CT数据将.nii格式或.nii.gz格式转换为dcm格式
1.先转换.nii格式或.nii.gz格式转换为dcm格式
import SimpleITK as sitkimage=sitk.ReadImage(r"D:\python\project\RCN\datasets\lspig_val\segmentation0.nii.gz")# 读取要转换格式的图像
sitk.WriteImage(image, r"C:\Users\Lenovo\Desktop\tran\segmentation0.dcm")
2.读取dcm并保存图片
import pydicom
import matplotlib.pyplot as plt
from matplotlib import imagein_path = r'C:\Users\Lenovo\Desktop\1\images\warped_moving_0\0.dcm'
out_path = r'C:\Users\Lenovo\Desktop\1\images\warped_moving_0\output.jpg'
ds = pydicom.read_file(in_path) #读取.dcm文件
img = ds.pixel_array # 提取图像信息
print(img.shape)
plt.imshow(img)
plt.show()
image.imsave(out_path,img)
显示的图片如下所示:
最终保存的图片显示如下:
3.显示dcm图片信息代码如下所示:
import SimpleITK as sitk
import numpy as np
reader = sitk.ImageFileReader()reader.SetFileName(r'C:\Users\Lenovo\Desktop\1\images\warped_moving_0\0.dcm')
reader.LoadPrivateTagsOn();reader.ReadImageInformation();len = 0
for k in reader.GetMetaDataKeys():v = reader.GetMetaData(k)len += 1print(k, v)
print(len)
显示的信息如下(我这个数据信息并不是很完整):
下面这个老哥的数据看起来比较完整,链接: DCM_Data
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