我正在尝试编写一个Cython模块，该模块可计算成对距离，这是较大类的位置敏感哈希的一部分。我尝试不创建每种类型和每种距离度量的代码，而是尝试创建一个cdef函数，该函数采用从Metric继承的各种扩展类型：

cdef class Metric:

def __init__(self):

pass

cdef class Euclidean(Metric):

cdef numeric c_evaluate(self, numeric[:] x, numeric[:] y, int dims):

....

cdef numeric[:,:] pairwise(numeric[:] x, numeric[:] y, Metric func, bint symmetric):

...

dm[i,j] = func.c_evaluate(x,y,dims)

...

要从Python访问此函数：

def py_pairwise(numeric[:,:] x, numeric[:,:] y, str func, bint symmetric = 1, **kwargs):

cdef Metric mfunc = to_Metric(func, **kwargs)

return pairwise(x, y, mfunc, symmetric)

但是，我不断收到错误消息" c_distance。[Metric]对象没有属性'c_evaluate'"。我想知道c_evaluate方法是否不可访问，因为该类对象是通过python函数to_Metric在python代码中创建的，尽管我认为def和cdef函数应该能够在Cython模块内相互调用。如果我将c_evaluate更改为cpdef方法，则该方法有效，但是我不确定这是否通过允许cdef对象通过python传递到cython来解决问题，或者仅使用速度较慢的python方法来解决。有什么建议(我也不在家里的电脑上，所以我现在没有所有代码。以后会更新吗？)

编辑：错字不在原始函数中(可能还有其他)：

ctypedef fused floating:

float

double

cdef class Euclidean(Metric):

cdef public floating c_evaluate(self, floating[:] x, floating[:] y, int dims):

cdef int i

cdef floating tmp, d = 0

for i in range(dims):

tmp = x[i]-y[i]

d += tmp*tmp

return sqrt(d)

#@cython.boundscheck(False)

#@cython.wraparound(False)

def py_pairwise(numeric[:,::1] x, numeric[:,::1] y,str metric, bint symmetric,**kwargs):

cdef Metric func = to_Metric(metric,**kwargs)

return pairwise(x,y,func,symmetric)

cdef numeric[:,::1] pairwise(numeric[:,::1] x,numeric[:,::1] y, Metric met, bint symmetric):#

cdef int n,m,k,i,j

n = x.shape[0]

m = y.shape[0]

dims = x.shape[1]

if numeric in floating:

mdtype = np.float

else:

mdtype = np.int

#mdtype = np.float

cdef numeric[:,::1] dm = (np.empty((n,m),dtype = mdtype)).fill(0)

if symmetric:

interval = lambda i,n,m: range(i+1,m)

else:

interval = lambda i,n,m: range(m)

for i in range(n):

for j in interval(i,n,m):

dm[i,j] = met.c_evaluate(x[i,:],y[j,:],dims)

return np.asarray(dm)

另外，to_Metric：

def to_Metric(str m, **kwargs):

if len(kwargs) == 0:

if m == 'euclidean':

met = Euclidean()

elif m in {'cos','cosine'}:

met = Cosine()

elif m in {'hamming','matching'}:

met = Hamming()

else:

raise ValueError('Unrecognized metric {}'.format('\''+m+'\''))

else:

if m in {'pnorm','p-norm'}:

met = Pnorm(kwargs['p'])

elif m == 'maximal':

met = Maximal(kwargs['m1'],kwargs['m2'],kwargs['sep'])

else:

raise ValueError('Unrecognized metric {}'.format('\''+m+'\''))

return met

这可能只是拼写错误吗？

问题是c_evaluate与类Euclidean关联，因此只能与已知类型为Euclidean的对象一起使用。 但是，在pairwise中，您将met的类型声明为Metric。

因为您将c_evaluate函数声明为cdef，所以只能在编译时找到它。 如果希望像标准Python函数一样在运行时找到c_evaluate，则应将其声明为def。

如果您需要在编译时找到该函数(这样可以更快地调用它)，则应该使c_evaluate是Metric对象的函数，或者应该使pairwise仅采用Euclidean对象。

谢谢。 根据cython Wiki上的示例，我最初在Metric中有一个c_evaluate方法，返回值为0，但是在编译时出现诸如"错误：重复成员'__pyx_fuse_0c_evaluate'"之类的错误，由于无法覆盖扩展类型cdef而错误地得出了这一结论。 方法。 现在，我看到了在融合类型数值内为每种类型创建重复方法的问题。

请注意，链接到的示例使用cpdef而不是cdef

是的，但是我假定cdef函数的用法类似，因为cpdef只是一个def，而cdef组合为python对象，我是正确的。 在cdef方法中只有一个融合类型的bug尚未修复。 如果我将所有内容都键入为double，则效果很好。