2021-3-22科研进展

对于OCMR_data

filename = '/Volumes/exterD/codeTemp/pg_mri/OCMR_data/us_0194_pt_1_5T.h5'
kData,param = read.read_ocmr(filename)
# Image reconstruction (SoS)
dim_kData = kData.shape   #(352, 126, 1, 24, 30, 1, 1, 1, 1)
CH = dim_kData[3]  #24
SLC = dim_kData[6] #1
kData_tmp = np.mean(kData, axis = 8); # average the k-space if average > 1           # (352, 126, 1, 24, 30, 1, 1, 1)im_coil = transform.transform_kspace_to_image(kData_tmp, [0,1]); # IFFT (2D image)  # (352, 126, 1, 24, 30, 1, 1, 1)
im_sos = np.sqrt(np.sum(np.abs(im_coil) ** 2, 3)); # Sum of Square                 #  (352, 126, 1, 30, 1, 1, 1)
print('Dimension of Image (with ReadOut ovesampling): ', im_sos.shape)
RO = im_sos.shape[0] #352
# math.floor(RO/4)：88，   math.floor(RO/4*3)： 264
image = im_sos[math.floor(RO/4):math.floor(RO/4*3),:,:]; # Remove RO oversampling   # (176, 126, 1, 30, 1, 1, 1)
print('Dimension of Image (without ReadOout ovesampling): ', image.shape)
# Show the reconstructed cine image
from IPython.display import clear_output
import timeslc_idx = math.floor(SLC/2) # 0
print(slc_idx)
image_slc = np.squeeze(image[:,:,:,:,:,:,slc_idx])     # image_slc(176, 126, 30)    image[]=(176, 126, 1, 30, 1, 1)

train_reconstruction

我就运行了这两个数据集，我发现代码里knee用的esc，brain用的rss
为啥呢knee不用rss，经过我的实验我让knee调用rss居然代码跑通了，我还没有研究虽然跑通的但不知道这样做对不对

我想知道esc和rss都是什么，我就研究了一下
下面这是knee的结构

下面这是brain的结构

下面这是knee和brain共同的结构rss

下面这是train_reconstruction加载的数据形式

然后我就自己写了个.py文件加载我的OCMR数据集，最后代码跑通啦
train和val都各用了一个.h5文件，我只是想跑通代码而已，loss是很大的，但是发现loss一直在降

train_policy

policy我也跑通了代码加载我的OCMR数据集，train和val都各用了2个.h5，跑通啦跑通啦，反正效果好垃圾别在意，仅仅为了跑通代码

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