fastqc检验时不能执行java

先用conda安装

conda install fastqc

很顺利

输入

fastqc

结果

Exception in thread "main" java.awt.HeadlessException:

No X11 DISPLAY variable was set, but this program performed an operation which requires it.

at java.awt.GraphicsEnvironment.checkHeadless(GraphicsEnvironment.java:204)

at java.awt.Window.(Window.java:536)

at java.awt.Frame.(Frame.java:420)

at java.awt.Frame.(Frame.java:385)

at javax.swing.JFrame.(JFrame.java:189)

at uk.ac.babraham.FastQC.FastQCApplication.(FastQCApplication.java:63)

at uk.ac.babraham.FastQC.FastQCApplication.main(FastQCApplication.java:332)

可是输入

java -version

java version "1.7.0_79"

OpenJDK Runtime Environment (IcedTea 2.5.6) (7u79-2.5.6-0ubuntu1.15.04.1)

OpenJDK Client VM (build 24.79-b02, mixed mode, sharing)

这个网上说没有图形界面

可以这样

fastqc * .fastq＆

或者

fastqc * .fq.gz＆

都可以

fastqc *.fq.gz & [1] 117993

(fcx2.7) [train@train duanefuhuangF5-1_NDSW53945]$ Started analysis of duanefuhuangF5-1_NDSW53945_1.fq.gz

Approx 5% complete for duanefuhuangF5-1_NDSW53945_1.fq.gz

Approx 10% complete for duanefuhuangF5-1_NDSW53945_1.fq.gz

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