论文写作就是将研究数据转变成科学知识

科学论文是记录原创性科学研究的结果（research article），或是综述已有科学发现及其发展（review），并将正式发表或出版的书写文件

科学论文，无要华丽的辞藻，要求清晰性，第一时间、第一地点，描述科学发现

科学论文 vs. 科学研究

科学论文和科学研究关系密切
优秀论文的前世是有好研究结果（英文和写作水平再好，发顶刊也需要能切中好的研究问题和结果）
好的研究结果需要论文来传播（记录和传播自己的学术进展）

怎样才是一篇优秀的（Reaerch 研究）论文

包含有意义的科学问题（表现世界研究前沿的重大科学问题）
有明确、合理的科学假设（避免南辕北辙、刻舟求剑的故事）
有严密的实验设计（大量的appendix 包括简短描述的methodology，support appendix说明每一步是怎么做的，data 和 sample 够不够亮，是否有重复、随机过程，有没有统计）
有令人信服的实验结果
有令人鼓舞的理论、实践意义(能够在讨论中挖掘出真正的实践价值）
有动人的故事情节（story）

每个人都可能是“三者”

读者——读精彩的文章
作者——写出佳世之作
编者——编辑好的论文

科学论文的特点：向读者传递新知识

清楚（nature science 让广大读者也挺轻松听懂专业知识，需要clarity）
简单（避免复杂的从句）

科学论文的总体框架（checklist）

Title
Authors
Address
Abstract/ summary
Key words

Introduction
Materials & methods
Results
Discussion

Acknowledgements
Reference / literature cited

Tables
Figure legends
Figure
Appendices

科学论文的一般格式（三部曲）

前奏：标题、作者、摘要、关键词 —— 需要吸引读者继续读下去
主旋律：IMMRD
- Introduction：研究目的 what question was studied？
- Materials & methods：如何实施 how & based on what the problem studied?
- Results：发现什么 what are the findings?
- Discussion：发现的意义 what do the findings mean?
尾声：致谢、参考文献等

综述论文

定义：综述某一学科领域或某一位（组）科学家的研究进展和现状
格式：
- Summarize 总结：information that has been published100-150篇相关文章，将观点理顺
- Analyze 分析：例如在近百年发展历程中，它的高峰期/低谷期在于什么时候，是什么原因造成的，在科学研究中有哪几个key factors 导致该方向没有很好的发展
- Evaluate 评价：发展是因为什么样的原因….
- Synthesize 整合：整合总结、分析、评价的结果，给一个最关键的整合总结，指出将来的发展方向，指出最大的问题，指出近期的几个关键发展点

如何撰写论文的题目

题目的重要性：论文题目会被大量读者看到
好题目的特点：以最少的文字，但最大限度地表述论文的内容
题目不适宜将导致论文被埋没或无缘被需要的读者阅读
意思明确：
- 使用太“泛”的语句使题目显得毫无意义，例如“a study of…”。
- 论文题目三要素：科学发现（结论）、研究材料、研究方法

Running title 短题目：在首页页眉上的简短标题

论文作者及其地址的撰写

作者-科学（学术）到的
每一位作者都应该对论文相关研究工作有贡献
每一位作者将对发表的科学论文负责

摘要

定义：是论文的“微缩版”，要让读者知道你在怎样的背景下发现了什么

存在意义：

摘要是一篇论文最有意义的部分
通常忙碌的读者指通过阅读这一部分获取论文信息
有时论文摘要也是某些地区读者唯一能独到的部分
许多数据库会手机论文摘要作为重要信息来源

摘要应包括的信息（minimum information elements）

P = purpose of the study 目的

M = methodology 方法

R = results 结果

C = conclusion ( & recommendations) 结果&建议

PMRC；可以代表论文摘要的核心要点

什么时候写

在论文的其他部分完成之后写
英文论文摘要的时态：成定论的内容现在时，自己的成果（已发表的观点但自己不接受）过去时

关键词

用于文献的检索/收索系统
为了提高论文被检索到的机会，应该认真考虑关键词的正确使用
最好不要选用已经在题目中出现过的词句作关键词（同义词/其他语种等）
注意关键词的位置

前言

读者对你的论文是否感兴趣，在于你如何引导，要牵着读者的“鼻子”走

作用：研究目的

提供本研究足够的相关背景信息和目的
介绍本研究提出的科学问题
- 为什么重要
- 目前知道多少（哪里存在knowledge gap）
- 为什么必须研究
让读者（编辑/审稿人）能理解和评价研究结果的意义

如何组织和撰写前言

通过对已有知识的回顾和综述提出科学问题
通过对科学问题的综述形成科学假设
解释本研究（验证假设）选用的方法和材料
简介说明本研究论文的目的（结论）

路线图

提出问题——综述和回顾——聚焦问题，提出假设——解决问题的方法——研究目的（结论）

general - specific 漏斗五步法

general statements about a field of research to provide the readers with a setting for problems
more specific statements about the aspects of the problems already studied by other researchers
statements that indicate the need for more investigation
very specific statements giving purpose / objectives of the writer's study
Optional statements that give a value or justification for carrying out the study

开题报告

背景和前言、研究内容、预期结果、技术路线、时间节点、经费预算

回头可以变为前言、实际结果，在实施路径中评价为discussion

文献综述要求

撰写时切忌列流水账，严禁虚列文献，宜对该研究问题的先行研究进行分类梳理，总结凝炼，但不需要分为国外和国内研究，而应按国内外学者解决该问题已从哪几个维度来解决并已经解决到什么程度进行条分缕析的梳理分析。

引言要体现三个要素：

1、定义核心概念；

2、界定研究起点：重点是界定研究起点，即凝炼前人对解决该研究问题有何核心观点，有何创新贡献，仍有哪些具体不足亟需解决。指出不足时不能泛泛而谈，而应精准点穴，并提供可操作性的改进方案或努力方向。

3、引出研究问题。

材料和方法

材料和方法是我们回答科学问题、验证科学假设的承载体和途径

目的：帮助读者/编辑/审稿人理解论文获得的结果

作用：

为有经验的读者提供重复实验并验证结果正确性的机会
为审稿人/编辑提供判断结果是否具有可靠性的基础
- 有经验的审稿人/编辑会仔细审阅论文的材料和方法。如果存在明显问题或疑点，或结果不能被重复，那么无论论文的发现有多么重要，审稿人/编辑会建议拒绝发表该论文

有效组织：

使用描述性语言顺序解释材料和方法，例 to measure pollen fertility, we collected pollen from one flower on each hybrid plant an 10 wild plants per population.(Campell & Snow 2007)
用段落第一句进行总体概括，然后用细节进行补充说明，例 mineralisable N was estimated using an anaerobic厌氧）incubation assay as described by Keeney(1982). This invovled…

结果

科研设计要做加法，精准细致、无懈可击；（考虑不到位可能会被审稿人challenge）

科学论文写作则要做减法，只将最重要的发现和精华呈现出来

意义：

“结果”决定了一篇论文的科学价值和重要程度
结果是论文的引擎或“驾驶”
结果是实验研究所获得的“数据”

如何表现“数据”

原则：简单从记录中将原始数据“转移”到论文中的做法不可取；
要将数据变成有用的知识信息 data——knowledge
应该在结果中呈现：有意义的数据；经过消化（分析）的数据

（穿插图/表，让读者尽快抓住关键信息）

一篇科学论文的关键在于：

好的科学内容：科学内容（science）是论文的精髓。As long as the science is good & can be clearly understood, I don’t worry too much about the english - I have copy editors who can fix that.——澳大利亚science主编
清楚易懂的文体

实验结果必须有统计意义——随机性、可重复性、对照组（正对照/负对照/空白对照）

进行统计检验
提供统计检验的值（value）
自由度（fd）
显著水准（P）

例：student's t-test, t=5.43, d.f.=114, p=0.00014

结果中最忌讳的是重复

正文的描述重复表和图中的内容
表中重复图中的内容
最糟糕的情况是正文中有表和图的部分或所有内容
在图和表的引用时应避免冗长的描述，例“it was clearly shwon in Table 1 that wild rice was of great diversity in China" ——” Wild rice in China had great diversity(Table 1)"

可以用相关的、做的最好的几个结果（图表+数据，不同的方法/侧重点）共同支撑一个研究假设

图、表以及文字的使用技巧

一切都应以读者能够容易地从结果中领会数据的意思和要点为目的
可以截掉空白部分，调整水平/垂直排版（显示离散度）等方式突出重点

讨论

科学发现的价值，就像一块平庸卵石中隐藏的宝玉，需要作者去挖掘、雕琢和升华

意义：解释结果的意义；指出结果是否验证了研究的科学假设及意义；比较研究结果与其他工作

精彩的论文讨论应该是

将结果与本文前言中的研究目的进行关联
解释能够支持结果的原理、关系
能将结果所揭示的现象和原理外延扩展（generalize）
对任何非预期结果进行认真解释——指出可能的新发现/可能存在的问题
研究结果与前人发现的关系——支持或否定已有发现/只是在别人的基础上增加了信息
用详实的证据进行概括性总结（结论）

如何进行讨论

特别要重视重访“前言”中提到的科学问题和假设
讨论研究结果可能带来的理论意义和应用价值
尽量清楚阐述和给出论文的结论
对每一条结论均提供充足的证据

英文论文的时态

摘要——现在时

成定论的内容现在时，自己的成果（已发表的观点但自己不接受）过去时

Introduction ——现在时&过去时（至今有重要影响的结果，用现在完成时）
M&M——过去时
Results——过去时
Discussion——现在时&过去时

致谢和引用参考文献

致谢方

支持该研究的基金（基金号.xxxx）
对本研究的实验工作有重要帮助的同事
对论文的撰写和修改提出建设性意见的专家

参考文献

应按照具体期刊杂志要求的格式排版（可能返稿要求为英文不够native等）
不要原封照搬别人综述中列过的文献（自己没有读过原文的），可能存在偏差
正文中的参考文献格式、年代时间拼写需要与ref list 中一模一样

如何投稿

确定投稿杂志的原则

确定研究论文的性质
确定目标杂志的内容

其他方面的考虑

The circulation factor 发行范围
The frequency factor 杂志发刊频率（若急可发周刊，很快见刊/看封面是否存在delay的情况，会审稿偏慢）
The audience factor 读者群（所用语言，人群有多大）
Impact factors 影响因子（有创新性novelty的可以冲击顶刊，重复他人工作的要相对降档）

投稿附信Cover letter

是投稿过程中，由作者寄给编辑的一封说明信
提供与稿件相关的必要说明（投给某个杂志/某个难度/某个领域）
作者对稿件进行特别解释（工作重要性/投给了其他杂志，出现了什么问题，现在已经解决）
包括任何其他信息

论文稿件投递的程序（路线图）

论文撰写修改完成（好的论文是修改出来的+ checklist)
选择适宜的刊物（从上往下投）
包装论文稿件
稿件投递：寄出附信和其他部分（一定要有cover letter）
通过邮件、网上、信件
信息跟踪（回执）（有些投稿之后还要确定，不然是悬挂状态）

论文审稿和发表过程

编辑及编辑的作用

科学编辑 Scientific Editors：
- 著名的科学家（自愿者 volunteer）
- 决定论文是否可以在本刊发表（职责是维护本刊声誉，选择符合的论文）
- 分派每一篇论文的编辑/审稿人
- 有关论文的科学问题（如接受与否）可以与科学编辑联系
管理和责任编辑Managing & Executive Editors
- 全职的专业人员（有工资）
- 不决定论文的“接受”或“退稿”
- 确定论文审稿和发表过程中所有事务性和管理型工作
- 负责将接受后的稿件转变成发表的论文
- 在论文的“校样”和“出版”过程中若有问题，可与managing editor联系
即，论文接受以前的问题找Scientific Editors；论文接受以后的所有问题联系Managing Editors

审稿的一般过程

了解编辑部的决策方式（越是高端的杂志决策越快）和过程，可以提高论文的命中（接受）率
The editorial, reviewing & publication process…
每一个杂志都有编委会，编辑负责审理来自不同领域的稿件（editor listed in the journal）
通常，编辑邀请2-3位审稿人对论文进行审阅（往来manner也很重要，直到见刊前都不能掉以轻心）
每一个杂志也有一套审稿专家库
有时杂志在网上有审稿专家库的名单
审稿意见有分歧时请第三位审稿人

文稿到达编辑部-快速决策：符合要求的论文-进入审稿程序：审稿人1、审稿人2-编辑/主编决策：作者修改-出版社/商：作者校样等-发表

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