测序数据量:

常见的测序量概念有 M 和 G ,for example  10M  和 10G

解释:

M 常用于描述reads 的数量。 例如 10M 就是 10 *10^6 条reads

G 常用于描述这一批次测序共有的碱基数量。 例如 10G 就是10*10^9个碱基

M 和 G 之间的关系

比如说对于3G测序量的理解:

3G指有 5*10^9 个碱基,假如采取illumia的PE150测序,即150bp双端测序,算有多少M测序量的公式为 3*10^9 / 150 / 2 =10 M

测序深度

测序深度 = 测序得到的碱基总个数 / 参考基因组大小

比如说对于30G测序量的人类基因组测序深度是多少?(人类参考基因组3G)

测序深度 = 30*10^9 / 3*10^9 =10X

测序覆盖度

测序获得的序列占整个基因组的比例

测序深度 覆盖率 SNP检出率 研究目的
6-10X 90%-99% 70%-90% 群体结构,群体选择分析等等
30X 99.9%-100% 95%-99% 个体基因组信息
50X 99.9%-100% >99% BSA、癌细胞样本测序、关心突变频率的研究类型

高通量测序中常见名词解释相关推荐

  1. 高通量测序中的reads、contig、scaffold

    1.什么是read? 高通量测序时,在芯片上的每个反应,会读出一条序列,是比较短的,叫read,它们是读序:就是我们测序产生的短读序列,通常一代和三代的reads读长在几千到几万bp之间,二代的相对较 ...

  2. 无人机航测行业中常见名词解释,你都知道吗?

    无人机航测具有机动灵活.高效快速.作业成本低.适用范围广.生产周期短等优势,目前主要应用于地形测绘.工程建设.土地资源调查.地质灾害应急处理.城市数字化建设等方面.下面就来了解一下无人机航测行业中的常 ...

  3. linux中常用名词解释,科学网—linux中常见名词解释 - 武海丹的博文

    Shell:是系统的用户界面,提供了用户与内核进行交互操作的一种接口.它接收用户输入的命令并把它送入内核去执行.实际上Shell是一个命令解释器,它解释由用户输入的命令并且把它们送到内核.(当用户发出 ...

  4. 软件开发中常见名词解释

    1.框架ssm.ssh 当下流行的两种企业开发MVC开源框架,是我们Java程序猿必备知识能力.MVC,即模型(model)-视图(view)-控制器(controller)的缩写,一种软件设计典范, ...

  5. 高通量测序技术和序列拼接算法探析

    高通量测序技术和序列拼接算法探析 时间:2019-05-27 来源:计算机科学 作者:周卫星,石海鹤 本文字数:16853字 摘    要: 高通量测序 (High-throughput Sequen ...

  6. 高通量测序的数据处理与分析指北(一)_network

    原理介绍篇 前言 最近正在学习如何处理高通量测序的数据,我认为要处理高通量测序数,那么对测序原理要有一个清晰的认识,本篇文章介绍了sanger测序,二代测序的测序原理 1. sanger测序 要了解二 ...

  7. mysql like反义_[转载]关于小RNA高通量测序数据分析方法的研究

    1 引言 小RNA(small RNAs)主要指长度在18-30nt的一类非编码RNA(ncRNAs),在真核生物中,具有基因表达调控功能的小RNA主要有微小RNA(microRNAs,miRNAs) ...

  8. 测序总结,高通量测序名词

    主要来自 :http://mp.weixin.qq.com/s/iTnsYajtHsbieGILGpUYgQ 测序的黄金标准:一代测序了,故称之为黄金测序. 高通量测序最近这几年很火越来越火,但是世界 ...

  9. 计算机里多媒体的名词解释,多媒体技术中的常见名词解释 众德伟业

    原标题:多媒体技术中的常见名词解释 众德伟业 显示缓冲区与颜色定义.对于计算机显示系统来说,它有两种显示模式:字母数字模式(A1pha Number Mode)和图形模式(Graphics Mode) ...

最新文章

  1. 分布式技术比较(RPC,CORBA,WebService)
  2. 开源 java CMS - FreeCMS2.3会员个人资料
  3. swing下拉框从mysql_Java Swing应用程序 JComboBox下拉框联动查询
  4. qt开发环境 - c++之结构,联合,枚举
  5. vb连接mysql未发现_vb连接MySQL遇到的问题解决方法
  6. Linux 2 unit7 挂载网络共享
  7. 手机modem开发(28)---开发电信VoLTE开关默认值设置
  8. 关于 cocos2d-x win32 版本的 cpu 占用改良
  9. python有什么用途-Python是什么 Python的用处
  10. 类似clover的软件_Clover 我的电脑里的书签栏
  11. 华为智慧园区解决方案 -重新定位园区
  12. 无法导入某些项目,因为它们已经存在于Eclipse中的工作区错误中
  13. 职称最新消息:2022年开始湖北全面实行职称电子证书
  14. Sketch的插件管理
  15. poco for android,POCO桌面(com.mi.android.globallauncher) - 2.6.8.25 - 应用 - 酷安
  16. DRC设计规则设置介绍-Design Compiler(四)
  17. strace命令解析
  18. 自动化脚本Cron工具(MAC和Linux系统)
  19. 如果男生过了五十岁突然失业了,你觉得最好的谋生办法是什么?
  20. 伟大的牛逼之前都是傻逼式的坚持

热门文章

  1. 36岁大厂程序员,找不到工作。。。
  2. java获取长度_获取java长度
  3. 华中科技大学2021计算机学院,2021年华中科技大学计算机考研科目
  4. 题目: 哈夫曼编码大全
  5. 图解Pandas,又一个Pandas学习利器!
  6. 基于强化学习的自我完善聊天机器人
  7. 5.3 用户注册与登录
  8. java 获取office文件页数_jacob如何获取word文档的页码
  9. java interrupt详解_Java线程源码解析之interrupt
  10. python如何提取数据中的年月_Python数据处理笔记——Pandas时间数据提取处理