Seurat | 强烈建议收藏的单细胞分析标准流程(SCTransform normalization)(四)
写在前面
完成了前面的基础质控、过滤以及去除细胞周期的影响后,我们可以开始SCTransform normalization
。
Seurat | 强烈建议收藏的单细胞分析标准流程(SCTransform normalization)(四)相关推荐
- Seurat | 强烈建议收藏的单细胞分析标准流程(基础质控与过滤)(一)
1. 写在前面 作为现在最火的scRNAseq分析包,Seurat当之无愧.
- Seurat | 强烈建议收藏的单细胞分析标准流程(差异分析与细胞注释)(五)
1写在前面 本期我们介绍一下如何使用Seurat包进行差异分析,以及如何使用SingleR进行细胞注释.
- seurat提取表达矩阵_单细胞分析实录(5): Seurat标准流程
前面我们已经学习了单细胞转录组分析的:使用Cell Ranger得到表达矩阵和doublet检测,今天我们开始Seurat标准流程的学习.这一部分的内容,网上有很多帖子,基本上都是把Seurat官网P ...
- 单细胞分析之质控(四)
学习目标 知道如何导入和读取数据,并了解数据的质控,能够对数据进行质控和分析. 1. 质控准备 在基因表达定量后,需要将这些数据导入到 R 中,以生成用于执行 QC(质控).下面将讨论定量数据的格式, ...
- Seurat | 单细胞分析工具
Seurat是一个老牌的单细胞分析工具了(satija的力作),我之前测试过,但是没怎么用. 最近发现这个工具又publish在了NBT上,所以很有必要看一下这篇文章. Integrating sin ...
- 领导讲话演讲稿,5个模板,即拿即用!(建议收藏)
领导万能讲话稿,5个模板,即拿即用!(建议收藏) 讲话材料是领导在一个时期.一项工作中主要思想和意向的反映,具有重要的导向作用.从某种意义上说,一个讲话就是一个信息"窗口",它告诉 ...
- 单细胞分析Seurat使用相关的10个问题答疑精选!
NGS系列文章包括NGS基础.转录组分析 (Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这).ChIP-seq分析 (ChIP-seq基本分析流程).单细胞测序分析 (重磅综述:三万字长文读 ...
- 收藏|北大生信平台单细胞分析、染色质分析视频和PPT分享
生物信息学习的正确姿势 NGS系列文章包括NGS基础.在线绘图.转录组分析 (Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这).ChIP-seq分析 (ChIP-seq基本分析流程).单细胞 ...
- 生信入门(六)——单细胞分析(Seurat)
生信入门(六)--单细胞分析(Seurat) 文章目录 生信入门(六)--单细胞分析(Seurat) 一.数据导入 1.数据来源 2.数据导入 二.标准预处理 1.QC和选择细胞进行进一步分析 2.规 ...
最新文章
- Java实现文件拷贝
- python执行系统命令后获取返回值的几种方式集合
- 使用sklearn自带公式计算余弦相似度
- 匈牙利算法java实现_匈牙利算法(Hungarian Algorithm)
- 了解一下HTTP1.1 Pipelining技术
- nginx解决浏览器跨域问题_前端通过Nginx反向代理解决跨域问题
- wxpython界面切换_wxpython中的图形用户界面
- .net发送邮件outlook中文乱码
- partproble在RHEL 6下无法更新分区信息
- 思科智能交换机受多个严重漏洞影响
- 【Expression 序列化】WCF的简单使用及其Expression Lambada的序列化问题初步解决方案(三)...
- 语音信号处理-概念(三):FBank特征、MFCC特征(梅尔频率倒谱系数)【由于二者蕴含信息较少,已不适合这个大数据时代。但有些任务由于其本身的特殊性质,还是会使用到MFCC谱。如情感语音转换任务】
- 做视频类网站如何选择云服务器?
- windwos常用cmd(DOS)命令集合
- 笨办法学python 粗略笔记(learn python the hard way)
- DSF(Debugger Services Framework) service介绍
- 自学资源(视频+文本)
- 冬令营2015 酱油记
- TCP/IP四层模型与OSI七层参考模型(网络协议)
- dom绑定click事件无效及解决办法
热门文章
- 一整套自助点餐软件,包含微信端,电视机,后台管理程序,个人开发,全套源码
- vue中小写数字转换为大写数字
- Python判断大小写和数字和常用方法
- Clear Type之父谈阅读革命(一)
- LeetCode——1888. 使二进制字符串字符交替的最少反转次数(Minimum Number of Flips to Make the Binary ...)[中等]——分析及代码(Java)
- Linux软件管理与vim实验报告,LinuxVi编辑器的使用实验报告.doc
- Python格式化新年祝福语
- 浅谈四种常见的agv导航方式及各自的优缺点
- Linux进程信号(产生、保存、处理)/可重入函数概念/volatile理解/SIGCHLD信号
- LED大屏实现“人屏”互动的方式有哪些?