1写在前面

本期我们介绍一下如何使用Seurat包进行差异分析,以及如何使用SingleR进行细胞注释

Seurat | 强烈建议收藏的单细胞分析标准流程(差异分析与细胞注释)(五)相关推荐

  1. Seurat | 强烈建议收藏的单细胞分析标准流程(基础质控与过滤)(一)

    1. 写在前面 作为现在最火的scRNAseq分析包,Seurat当之无愧.

  2. Seurat | 强烈建议收藏的单细胞分析标准流程(SCTransform normalization)(四)

    写在前面 完成了前面的基础质控.过滤以及去除细胞周期的影响后,我们可以开始SCTransform normalization.

  3. seurat提取表达矩阵_单细胞分析实录(5): Seurat标准流程

    前面我们已经学习了单细胞转录组分析的:使用Cell Ranger得到表达矩阵和doublet检测,今天我们开始Seurat标准流程的学习.这一部分的内容,网上有很多帖子,基本上都是把Seurat官网P ...

  4. 单细胞分析:质控实操(五)

    1. 学习目标 构建质量控制指标并评估数据质量 适当的应用过滤器去除低质量的细胞 2. 过滤目标 过滤数据以仅包含高质量的真实细胞,以便在对细胞进行聚类时更容易识别不同的细胞类型 对一些不合格样品的数 ...

  5. Seurat | 单细胞分析工具

    Seurat是一个老牌的单细胞分析工具了(satija的力作),我之前测试过,但是没怎么用. 最近发现这个工具又publish在了NBT上,所以很有必要看一下这篇文章. Integrating sin ...

  6. 单细胞分析Seurat使用相关的10个问题答疑精选!

    NGS系列文章包括NGS基础.转录组分析 (Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这).ChIP-seq分析 (ChIP-seq基本分析流程).单细胞测序分析 (重磅综述:三万字长文读 ...

  7. 收藏|北大生信平台单细胞分析、染色质分析视频和PPT分享

    生物信息学习的正确姿势 NGS系列文章包括NGS基础.在线绘图.转录组分析 (Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这).ChIP-seq分析 (ChIP-seq基本分析流程).单细胞 ...

  8. 生信入门(六)——单细胞分析(Seurat)

    生信入门(六)--单细胞分析(Seurat) 文章目录 生信入门(六)--单细胞分析(Seurat) 一.数据导入 1.数据来源 2.数据导入 二.标准预处理 1.QC和选择细胞进行进一步分析 2.规 ...

  9. DayDayUp:大学英语六级考试简介、应试分析、题型内容((Writing/Listening/Reading/Translation)、解答经验步骤、解题技巧之最强攻略(建议收藏)

    DayDayUp:大学英语六级考试简介.应试分析.题型内容((Writing/Listening/Reading/Translation).解答经验步骤.解题技巧之最强攻略(建议收藏) 简介:大学英语 ...

最新文章

  1. 1054. 求平均值 (20)
  2. 【Redis】Linux下Redis安装与redis-desktop-manager使用(无法连接Redis服务器解决方法)...
  3. bashrc文件实例
  4. cvsaveimage 异常_C++ IplImage*的若干bug之三:cvSaveImage問題
  5. SeleniumCSS选择器
  6. html表单代码有哪些,HTML常用代码有哪些
  7. 计算机vb题库程序代码编写,11计算机专业VB试题(二)
  8. ZipEntry 类,zip的压缩与解压
  9. icem不同的划分网格,但是质量差不多
  10. 详解无刷直流电机的工作原理
  11. Linux部署rsyslog日志服务器(主机部分)
  12. linux终端下载速度只有几kb,[菜鸟教学]如何提高linux下的下载速度!新手必看!...
  13. text edit model FELIX的理解与python实现
  14. matlab标题斜体_matlab 斜体 正体
  15. 27种迹象你该考虑辞掉程序员的工作
  16. 微信退款通知显示乱码,xml解析中文乱码
  17. netbackup备份mysql_NetBackup备份Oracle数据库失败-nbu
  18. v2ray服务端启动出现panic: runtime error: invalid memory address or nil pointer dereference
  19. MySQL经典练习题,看看你会几道?
  20. hadoop 常用环境变量及使用

热门文章

  1. 用计算机弹莫问归期数字,莫问归期 - 在线打字测试(dazi.kukuw.com)
  2. OpenLayers入门,使用OpenLayers叠加多边形、圆形、线段和点要素到地图上
  3. 大明宫、浐灞湿地公园
  4. NCH SoundTap Plus for mac(苹果电脑录音软件)
  5. sparkstreaming处理kafka数据,数据积压问题解决方案
  6. CocosCreator 音效管理器
  7. 内存管理---内存释放
  8. 打印机提示 change drum soon 解决
  9. 2.BJDCTF(2020第二届)——Misc杂项题
  10. -nan(ind) 重载运算符以及结构体排序