dPCA 二面角主成分分析

dPCA相关的资料较少，谨以此文与大家讨论学习，非常欢迎argue和issue！

sham命令与自由能形貌图

通常情况下（简单情况下），GROMACS的sham命令可以利用两个变量的数据通过玻尔兹曼反转多维直方图(Bolzmann inverting multi-dimensional histograms)的方法计算Gibbs自由能形貌图；粗浅地理解，实际上就是把这两个变量的数据构成的散点图转换成形貌图，散点密集的地方能量更低（概率密度P(x)大， G(x)就低）。

G ( x ) = − k T ∗ L n ( P ( X ) )

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