Discovery studio画蛋白质构象叠合图
1. 准备数据
打开DS软件,对于一个蛋白质,这里使用三个不同的构象作为例子。
2. 将蛋白质文件拖到DS中
一定要把所有的蛋白质拖到同一个窗口中,不然不会显示在一起。
Chart --- Ramachandran Plot可以画蛋白质拉式图,横坐标为phi,纵坐标为psi,分别对应与氨基酸单元的两个二面角(C-N-Cα-C)和(N-Cα-C-N)。
对于第一个蛋白质:
加入第二个蛋白质后:
加入第三个蛋白质后:
3. 叠合
Structure ---Superimpose --- Molecular Overlay...
4. 结果
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