专家点评Science:中英合作揭示拟南芥三萜化合物特异调控根系微生物组
https://science.sciencemag.org/content/364/6440/eaau6389
本周五,中科院遗传发育所白洋组与JIC的Anne Osbourn组合作在拟南芥代谢物调控根系微生物组领域取得重大突破,成果以Article形式于5月10日在线发表于Science杂志,海南大学罗杰教授对本工作的意义进行点评。
新闻稿
中科院遗传发育所与John Innes Centre合作揭示拟南芥三萜化合物对植物根系微生物组的调控规律
植物不可移动,但在自然土壤中进化出了强大的适应能力,在根系招募大量种属特异且种类繁多的微生物(根系微生物组)。这些微生物参与植物吸收营养、抵抗疾病和非生物胁迫等重要生理过程。植物调控根系微生物组的机制对植物生长和健康非常重要,也是根系微生物组领域的研究热点。植物将20 ~ 30%的光合作用产物在根系合成化合物,是为了防御病原菌或资源浪费吗?这些化合物是否参与植物与根系微生物的互作过程,是否直接调控特异种类的根系微生物吗?这些问题一直没有明确的答案。
中国科学院遗传与发育生物学研究,中国科学院-英国约翰英纳斯中心植物和微生物科学联合研究中心(CEPAMS)白洋课题组与John Innes Centre的Anne Osbourn课题组合作在Science上发表文章,揭示了拟南芥三萜类化合物对根系微生物组的调控规律。该工作系统地解析了拟南芥中形成基因簇的三萜合成遗传网络。该网络的关键基因在植物根系特异表达,并具有潜力合成50多种未知的根系化合物(目前能稳定检测到的根系化合物大约300种)。与不能合成三萜的水稻和小麦相比,52%拟南芥特异的根系微生物组被三萜合成基因显著调控。通过分离培养的细菌资源库与纯化/合成的单种或混合化合物共培养,发现三萜化合物直接调控特异的根系细菌种类。同时根系细菌可以特异性修饰和利用拟南芥三萜化合物。该研究为利用植物天然化合物促进根系益生菌在绿色农业中的应用提供了理论依据。
上述结果最初以Report形式投稿到Science杂志,编辑部和五位审稿人都对本工作给予了高度评价,认为非常出色且有重大科学意义。应编辑要求扩展为Research Article,于5月10在线发表于Science杂志(doi: 10.1126/science.aau6389)。Anne Osbourn组博士后黄安诚和白洋组博士研究生姜婷为共同第一作者,中国科学院遗传与发育生物学研究所,中国科学院-英国约翰英纳斯中心植物和微生物科学联合研究中心CEPAMS白洋研究员和John Innes Centre的Anne Osbourn教授为共同通讯作者。白洋组工程师刘永鑫、助理研究员曲宝原参与了本项目。该研究得到了中国科学院战略性先导科技专项、前沿科学重点研究项目,国家自然科学基金委国际合作研究与交流项目和中国科学院微生物组项目支持。
拟南芥三萜化合物特异调控根系微生物组
Ancheng C. Huang#, Ting Jiang#, Yong-Xin Liu, Yue-Chen Bai, James Reed, Baoyuan Qu, Alain Goossens, Hans-Wilhelm Nützmann, Yang Bai, Anne Osbourn. (2019). A specialized metabolic network selectively modulates Arabidopsis root microbiota. Science. doi: https://doi.org/10.1126/science.aau6389
通讯作者简介
白洋简介
白洋,博士,研究员,博士生导师
中科院遗传与发育生物学所研究员,也是中国科学院-英国约翰英纳斯中心植物和微生物科学联合研究中心(CEPAMS)首位研究员。目前主要研究根系微生物组在植物抗病抗逆、营养高效等过程中的功能。在Science、Nature、Nature Biotechnology、Nature Methods、Nature Plants、Microbiome、GigaScience、Science China Life Sciences等杂志发表论文20余篇。
CEPAMS官页白洋组简介视频
实验室主页:http://bailab.genetics.ac.cn/
Anne Osbourn简介
Anne Osbourn教授,英国约翰英纳斯中心(John Innes Centre,JIC)诺里奇研究园工业生物技术联盟(Norwich Research Park Industrial Biotechnology Alliance)主任,2019年4月17月入选第30界英国皇家科学院院士(Fellow of the Royal Society),研究方向为植物天然产物的生物合成(natural product biosynthesis),包括三萜生物合成通路的发现、基因组挖掘天然产物代谢通路、天然产物及类似物的药物开发等。在Scinece、PNAS、Annual Review of Genetics、Metabolic Engineering、New Phytologist等杂志发表79篇文章。
实验室主页:https://www.jic.ac.uk/people/anne-osbourn/
专家点评
三萜代谢网络调控拟南芥根际微生物组
种类繁多的植物次生代谢物广泛参与植物之间及植物与环境之间的相互作用,在植物演化及其环境适应过程中发挥重要作用。根际微生物对于植物的生长及其适应性的作用已经广为人知,但是对于植物如何调控根际微生物却知之甚少。
三萜类化合物是植物中种类最多,结构最为多样的一类次生代谢物,在植物防御、信号转导等方面发挥重要功能,同时具有抗菌活力。近年来的研究表明催化形成三萜化合物不同步骤的合成基因在基因组中形成基因簇,并可能参与植物对于根际病原微生物的抗性,提示由这些基因簇催化形成的三萜化合物可能参与拟南芥根际微生物组的调控。拟南芥基因组中有4个在根中特异表达的合成三萜类化合物的基因簇,但是其生化及生理功能尚不知晓。
来自中国科学院遗传与发育生物学研究,中国科学院-英国约翰英纳斯中心植物和微生物科学联合研究中心(CEPAMS)白洋课题组与John Innes Centre的Anne Osbourn课题组合作解析并重构了拟南芥根特异表达的三类不同三萜化合物的基因网络。进一步的研究表明,上述基因簇功能缺失突变体与野生型植物相比根际微生物组的种类和多样性都发生了明显的变化。通过与不能合成这些三萜的水稻和小麦的比较研究,揭示了拟南芥三萜合成的基因网络能够富集拟南芥特异性的根际微生物组。为了进一步研究这些三萜化合物是否直接调控根际微生物组,通过分离培养的根际微生物资源库与纯化或合成的单种或多种混合化合物进行共培养,结果发现这些三萜化合物直接调控特异的根系细菌种类。
该研究为研究根际微生物对植物生长和健康的影响、植物根际微生物组的调控及其在绿色农业发展中的应用提供了理论依据。
点评专家简介
罗杰教授简介:
罗杰,男,博士,教授。长期从事作物营养与健康品质改良的代谢调控及代谢组学研究。海南大学热带农林学院教授、“作物学”世界一流学科责任教授。主持“国家自然科学基金”重点项目、国家“863”重点项目、国家“973”课题等。2009年入选“教育部新世纪优秀人才资助计划”,2016年获“国家杰出青年科学基金”,2016年入选国家“中青年科技创新领军人才”,2017年入选国家“万人计划”科技创新领军人才。主讲的《分子生物学》入选首批“国家级精品资源共享课程”。
近年来以通讯作者(含共同)在Cell, Nature Genetics, Nature Communications, PNAS, Plant Cell, Molecular Plant, Trends in Plant Science等国际顶级及主流期刊发表多篇论文,为作物营养与健康品质的基因工程改良提供了新思路和新方法。多次应邀在国际学术会议上做主题报告,是首位在“国际代谢组学大会”做主题报告的中国科学家。部分成果获得“第十六届湖北省自然科学优秀学术论文(特等奖)”。担任中国生化与分子生物学会教学分会副主任委员、中国生化与分子生物学会农业分会常务理事等,任《中国科学-生命科学》、《植物学报》等杂志编委。
Reference
Ancheng C. Huang, Ting Jiang, Yong-Xin Liu, Yue-Chen Bai, James Reed, Baoyuan Qu, Alain Goossens, Hans-Wilhelm Nützmann, Yang Bai†, Anne Osbourn†. (2019). A specialized metabolic network selectively modulates Arabidopsis root microbiota. Science. doi: https://doi.org/10.1126/science.aau6389
白洋组主页:http://bailab.genetics.ac.cn/
Anne Osbourn组主页:https://www.jic.ac.uk/people/anne-osbourn/
罗杰组招聘信息 https://mp.weixin.qq.com/s/XLMVkK8Q4g5uRm4z0RQpHw
猜你喜欢
10000+:菌群分析 宝宝与猫狗 梅毒狂想曲 提DNA发Nature Cell专刊 肠道指挥大脑
系列教程:微生物组入门 Biostar 微生物组 宏基因组
专业技能:学术图表 高分文章 生信宝典 不可或缺的人
一文读懂:宏基因组 寄生虫益处 进化树
必备技能:提问 搜索 Endnote
文献阅读 热心肠 SemanticScholar Geenmedical
扩增子分析:图表解读 分析流程 统计绘图
16S功能预测 PICRUSt FAPROTAX Bugbase Tax4Fun
在线工具:16S预测培养基 生信绘图
科研经验:云笔记 云协作 公众号
编程模板: Shell R Perl
生物科普: 肠道细菌 人体上的生命 生命大跃进 细胞暗战 人体奥秘
写在后面
为鼓励读者交流、快速解决科研困难,我们建立了“宏基因组”专业讨论群,目前己有国内外5000+ 一线科研人员加入。参与讨论,获得专业解答,欢迎分享此文至朋友圈,并扫码加主编好友带你入群,务必备注“姓名-单位-研究方向-职称/年级”。PI请明示身份,另有海内外微生物相关PI群供大佬合作交流。技术问题寻求帮助,首先阅读《如何优雅的提问》学习解决问题思路,仍未解决群内讨论,问题不私聊,帮助同行。
学习16S扩增子、宏基因组科研思路和分析实战,关注“宏基因组”
点击阅读原文,跳转最新文章目录阅读
专家点评Science:中英合作揭示拟南芥三萜化合物特异调控根系微生物组相关推荐
- Science:中英合作揭示拟南芥三萜化合物特异调控根系微生物组
文章目录 新闻稿 中科院遗传发育所与John Innes Centre合作揭示拟南芥三萜化合物对植物根系微生物组的调控规律 通讯作者简介 白洋简介 Anne Osbourn简介 文章要点总结 猜你喜欢 ...
- 中国科学:拟南芥二半萜类化合物调控根系微生物组
2019年5月10日关于王国栋组和白洋组二半萜化合物对微生物组调控的文章发表于<中国科学>,新闻稿如下: 中国科学:中科院遗传发育所揭示拟南芥二半萜对根系微生物组的调控机制 同一天由白洋组 ...
- SCLS:拟南芥二半萜类化合物调控根系微生物组
2019年5月10日关于王国栋组和白洋组二半萜化合物对微生物组调控的文章发表于<中国科学>,新闻稿如下: 中国科学:中科院遗传发育所揭示拟南芥二半萜对根系微生物组的调控机制 同一天由白洋组 ...
- SCLS:中科院遗传发育在拟南芥二半萜类化合物调控根系微生物组取得突破进展
文章目录 摘要 结果 拟南芥中进化出新的二半萜基因簇 图1. 十字花科中广泛共线性的TPS-GFPPS-P450基因簇 单个氨酸取代决定二半萜的特异性 图2. 十字花科植物二半萜特异的底物 拟南芥二半 ...
- 中国科学:中科院遗传发育所揭示拟南芥二半萜对根系微生物组的调控机制
植物产生超过20万种代谢物(主要是指分子量小于1,000的化合物),这些代谢物在植物的生活史中发挥着重要的生理功能.由于植物是固着生长,而根系周围有大量的微生物(微生物组),长期以来人们认为植物代谢物 ...
- Frontiers | 北林邬荣领/何晓青-网络作图揭示拟南芥与叶际微生物组互作机制
网络作图揭示拟南芥与叶际微生物组互作机制 Disentangling leaf-microbiome interactions in Arabidopsis thaliana by network m ...
- HIFI测序揭示拟南芥MSH1参与介导的细胞器基因组重组与变异积累规律
近日,中国农业科学院农业基因组所武志强课题组在<The Plant Journal>在线发表了题为"Long-read sequencing characterizes mito ...
- 中科院遗传发育所发表“重组菌群体系在根系微生物组研究中应用”的重要综述...
新闻稿 中科院遗传发育所发表"重组菌群体系在根系微生物组研究中的应用"的重要综述 微生物学权威杂志<Current Opinion in Microbiology>杂志 ...
- COM:中科院遗传发育所发表“重组菌群体系在根系微生物组研究中应用”的重要综述
文章目录 新闻稿 中科院遗传发育所发表"重组菌群体系在根系微生物组研究中的应用"的重要综述 根系微生物组研究中的合成群落还原法 摘要 引言 从整体主义到还原主义 图1. 在田间.温 ...
最新文章
- 十九、约束作用及常见约束
- SqlServer跨集群升级
- excel表格中添加combobox_excel高阶打印技巧:批量为表格添加logo,学会它老板都夸你厉害...
- pwm波如何控制电机代码_PWM波控制720电机
- get 和 post的区别
- oracle 除重更新,oracle数据库11.2.0.3升级到11.2.0.4
- 2020大一下暑期实习--funcode游戏设计
- ubuntu oracle 工具,ubuntu上安装Oracle InstantClient
- 概率图模型之贝叶斯网络的理解与应用
- 一个555振荡电路及其解释
- 初识Python必看基础知识~ 续(3)
- 技术专栏 | 为什么要基于模型设计?
- Yolanda,Withings,PICOOC以及RyFit四款智能人体成分秤对比评测
- label 字体添加中划线和下划线
- CIE颜色空间是如何用来设计更好的led的
- 年仅22岁的苹果视障工程师正在改变科技世界
- win10字体突然变成了繁体快速解决
- 计算机硬件基础与维修系列丛书,PC升级与维护大全(原书第12版附光盘)/计算机硬件基础与维修系列丛书...
- 【初识C++】C++、主人和狗 - 小区养狗信息管理
- FrozenUI - 专注于移动web的UI框架