建立高度多样化的库有四种方法,

  1. 聚类方法
  2. 基于距离的方法
  3. 基于分类的方法
  4. 使用优化方法的方法

这次使用RDKit中实现的MaxMin方法作为“ 基于距离的方法” 来构建各种库。

基于距离的方法概述

聚类方法中

  1. 将数据集划分为指定数量的集群
  2. 从每个簇中选择分子

分两个阶段选择了分子。另一方面,本研究中使用的基于距离的MaxMin方法中,一步选择分子。

RDKit中MaxMin方法的实现

rdkit.SimDivFilters.rdSimDivPickers.MaxMinPicker

用于选择各种各样的RDKit化合物的

RDKit | 基于RDKit的MaxMin方法选择高度多样化的库相关推荐

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