RDKit | 基于RDKit的MaxMin方法选择高度多样化的库
建立高度多样化的库有四种方法,
- 聚类方法
- 基于距离的方法
- 基于分类的方法
- 使用优化方法的方法
这次使用RDKit中实现的MaxMin方法作为“ 基于距离的方法” 来构建各种库。
基于距离的方法概述
聚类方法中
- 将数据集划分为指定数量的集群
- 从每个簇中选择分子
分两个阶段选择了分子。另一方面,本研究中使用的基于距离的MaxMin方法中,一步选择分子。
RDKit中MaxMin方法的实现
rdkit.SimDivFilters.rdSimDivPickers.MaxMinPicker
用于选择各种各样的RDKit化合物的
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