pytorch常用代码

20211228

https://mp.weixin.qq.com/s/4breleAhCh6_9tvMK3WDaw
常用代码段

本文代码基于 PyTorch 1.x 版本，需要用到以下包：

import collections
import os
import shutil
import tqdm

import numpy as np
import PIL.Image
import torch
import torchvision

基础配置
检查 PyTorch 版本

torch.version # PyTorch version
torch.version.cuda # Corresponding CUDA version
torch.backends.cudnn.version() # Corresponding cuDNN version
torch.cuda.get_device_name(0) # GPU type

更新 PyTorchPyTorch 将被安装在 anaconda3/lib/python3.7/site-packages/torch/目录下。

conda update pytorch torchvision -c pytorch

固定随机种子

torch.manual_seed(0)
torch.cuda.manual_seed_all(0)

指定程序运行在特定 GPU 卡上
在命令行指定环境变量

CUDA_VISIBLE_DEVICES=0,1 python train.py

或在代码中指定

os.environ[‘CUDA_VISIBLE_DEVICES’] = ‘0,1’

判断是否有 CUDA 支持

torch.cuda.is_available()

设置为 cuDNN benchmark 模式Benchmark 模式会提升计算速度，但是由于计算中有随机性，每次网络前馈结果略有差异。

torch.backends.cudnn.benchmark = True


如果想要避免这种结果波动，设置

torch.backends.cudnn.deterministic = True

清除 GPU 存储有时 Control-C 中止运行后 GPU 存储没有及时释放，需要手动清空。在 PyTorch 内部可以torch.cuda.empty_cache()
或在命令行可以先使用 ps 找到程序的 PID，再使用 kill 结束该进程
ps aux | grep pythonkill -9 [pid]
或者直接重置没有被清空的 GPU
nvidia-smi --gpu-reset -i [gpu_id]
张量处理
张量基本信息
tensor.type()   # Data type
tensor.size()   # Shape of the tensor. It is a subclass of Python tuple
tensor.dim()    # Number of dimensions.
数据类型转换#Set default tensor type. Float in PyTorch is much faster than double.
torch.set_default_tensor_type(torch.FloatTensor)
#Type convertions.
tensor = tensor.cuda()
tensor = tensor.cpu()
tensor = tensor.float()
tensor = tensor.long()
torch.Tensor 与 np.ndarray 转换
#torch.Tensor -> np.ndarray.
ndarray = tensor.cpu().numpy()
#np.ndarray -> torch.Tensor.
tensor = torch.from_numpy(ndarray).float()
tensor = torch.from_numpy(ndarray.copy()).float()  # If ndarray has negative stride
torch.Tensor 与 PIL.Image 转换    不懂再看
PyTorch 中的张量默认采用 N×D×H×W 的顺序，并且数据范围在 [0, 1]，需要进行转置和规范化。
#torch.Tensor -> PIL.Image.
image = PIL.Image.fromarray(torch.clamp(tensor * 255, min=0, max=255).byte().permute(1, 2, 0).cpu().numpy())
image = torchvision.transforms.functional.to_pil_image(tensor)  # Equivalently way
#PIL.Image -> torch.Tensor.
tensor = torch.from_numpy(np.asarray(PIL.Image.open(path))).permute(2, 0, 1).float() / 255
tensor = torchvision.transforms.functional.to_tensor(PIL.Image.open(path))  # Equivalently way
np.ndarray 与 PIL.Image 转换    不懂再看
#np.ndarray -> PIL.Image.
image = PIL.Image.fromarray(ndarray.astypde(np.uint8))
#PIL.Image -> np.ndarray.
ndarray = np.asarray(PIL.Image.open(path))
从只包含一个元素的张量中提取值
这在训练时统计 loss 的变化过程中特别有用。否则这将累积计算图，使 GPU 存储占用量越来越大。
value = tensor.item()
张量形变
张量形变常常需要用于将卷积层特征输入全连接层的情形。相比 torch.view，torch.reshape 可以自动处理输入张量不连续的情况。
tensor = torch.reshape(tensor, shape)
打乱顺序
tensor = tensor[torch.randperm(tensor.size(0))]  # Shuffle the first dimension
水平翻转PyTorch 不支持 tensor[::-1] 这样的负步长操作，水平翻转可以用张量索引实现。#Assume tensor has shape N*D*H*W.tensor = tensor[:, :, :, torch.arange(tensor.size(3) - 1, -1, -1).long()]
复制张量
有三种复制的方式，对应不同的需求。#Operation                 |  New/Shared memory | Still in computation graph |
tensor.clone()            # |        New         |          Yes               |
tensor.detach()           # |      Shared        |          No                |
tensor.detach.clone()()   # |        New         |          No                |拼接张量
注意 torch.cat 和 torch.stack 的区别在于 torch.cat 沿着给定的维度拼接，而 torch.stack 会新增一维。例如当参数是 3 个 10×5 的张量，torch.cat 的结果是 30×5 的张量，而 torch.stack 的结果是 3×10×5 的张量。tensor = torch.cat(list_of_tensors, dim=0)
tensor = torch.stack(list_of_tensors, dim=0)将整数标记转换成独热（one-hot）编码
PyTorch 中的标记默认从 0 开始。N = tensor.size(0)
one_hot = torch.zeros(N, num_classes).long()
one_hot.scatter_(dim=1, index=torch.unsqueeze(tensor, dim=1), src=torch.ones(N, num_classes).long())
得到非零/零元素
torch.nonzero(tensor)               # Index of non-zero elements
torch.nonzero(tensor == 0)          # Index of zero elements
torch.nonzero(tensor).size(0)       # Number of non-zero elements
torch.nonzero(tensor == 0).size(0)  # Number of zero elements张量扩展#Expand tensor of shape 64*512 to shape 64*512*7*7.
torch.reshape(tensor, (64, 512, 1, 1)).expand(64, 512, 7, 7)矩阵乘法
#Matrix multiplication: (m*n) * (n*p) -> (m*p).
result = torch.mm(tensor1, tensor2)
#Batch matrix multiplication: (b*m*n) * (b*n*p) -> (b*m*p).
result = torch.bmm(tensor1, tensor2)
#Element-wise multiplication.
result = tensor1 * tensor2
计算两组数据之间的两两欧式距离
#X1 is of shape m*d.
X1 = torch.unsqueeze(X1, dim=1).expand(m, n, d)
#X2 is of shape n*d.
X2 = torch.unsqueeze(X2, dim=0).expand(m, n, d)
#dist is of shape m*n, where dist[i][j] = sqrt(|X1[i, :] - X[j, :]|^2)
dist = torch.sqrt(torch.sum((X1 - X2) ** 2, dim=2))
模型定义
卷积层
最常用的卷积层配置是
conv = torch.nn.Conv2d(in_channels, out_channels, kernel_size=3, stride=1, padding=1, bias=True)conv = torch.nn.Conv2d(in_channels, out_channels, kernel_size=1, stride=1, padding=0, bias=True)
如果卷积层配置比较复杂，不方便计算输出大小时，可以利用如下可视化工具辅助
链接：https://ezyang.github.io/convolution-visualizer/index.html
0GAP（Global average pooling）层
gap = torch.nn.AdaptiveAvgPool2d(output_size=1)
双线性汇合（bilinear pooling）
X = torch.reshape(N, D, H * W)                        # Assume X has shape N*D*H*W
X = torch.bmm(X, torch.transpose(X, 1, 2)) / (H * W)  # Bilinear pooling
assert X.size() == (N, D, D)
X = torch.reshape(X, (N, D * D))
X = torch.sign(X) * torch.sqrt(torch.abs(X) + 1e-5)   # Signed-sqrt normalization
X = torch.nn.functional.normalize(X)                  # L2 normalization
多卡同步 BN（Batch normalization）当使用 torch.nn.DataParallel 将代码运行在多张 GPU 卡上时，PyTorch 的 BN 层默认操作是各卡上数据独立地计算均值和标准差，同步 BN 使用所有卡上的数据一起计算 BN 层的均值和标准差，缓解了当批量大小（batch size）比较小时对均值和标准差估计不准的情况，是在目标检测等任务中一个有效的提升性能的技巧。
链接：https://github.com/vacancy/Synchronized-BatchNorm-PyTorch
类似 BN 滑动平均如果要实现类似 BN 滑动平均的操作，在 forward 函数中要使用原地（inplace）操作给滑动平均赋值。class BN(torch.nn.Module)def __init__(self):...self.register_buffer('running_mean', torch.zeros(num_features))def forward(self, X):...self.running_mean += momentum * (current - self.running_mean)
计算模型整体参数量
num_parameters = sum(torch.numel(parameter) for parameter in model.parameters())
类似 Keras 的 model.summary() 输出模型信息
链接：https://github.com/sksq96/pytorch-summary
模型权值初始化
注意 model.modules() 和 model.children() 的区别：model.modules() 会迭代地遍历模型的所有子层，而 model.children() 只会遍历模型下的一层。#Common practise for initialization.
for layer in model.modules():if isinstance(layer, torch.nn.Conv2d):torch.nn.init.kaiming_normal_(layer.weight, mode='fan_out',nonlinearity='relu')if layer.bias is not None:torch.nn.init.constant_(layer.bias, val=0.0)elif isinstance(layer, torch.nn.BatchNorm2d):torch.nn.init.constant_(layer.weight, val=1.0)torch.nn.init.constant_(layer.bias, val=0.0)elif isinstance(layer, torch.nn.Linear):torch.nn.init.xavier_normal_(layer.weight)if layer.bias is not None:torch.nn.init.constant_(layer.bias, val=0.0)#Initialization with given tensor.
layer.weight = torch.nn.Parameter(tensor)
部分层使用预训练模型
注意如果保存的模型是 torch.nn.DataParallel，则当前的模型也需要是
model.load_state_dict(torch.load('model,pth'), strict=False)
将在 GPU 保存的模型加载到 CPU
model.load_state_dict(torch.load('model,pth', map_location='cpu'))
数据准备、特征提取与微调
得到视频数据基本信息
import cv2
video = cv2.VideoCapture(mp4_path)
height = int(video.get(cv2.CAP_PROP_FRAME_HEIGHT))
width = int(video.get(cv2.CAP_PROP_FRAME_WIDTH))
num_frames = int(video.get(cv2.CAP_PROP_FRAME_COUNT))
fps = int(video.get(cv2.CAP_PROP_FPS))
video.release()
TSN 每段（segment）采样一帧视频
K = self._num_segments
if is_train:if num_frames > K:# Random index for each segment.frame_indices = torch.randint(high=num_frames // K, size=(K,), dtype=torch.long)frame_indices += num_frames // K * torch.arange(K)else:frame_indices = torch.randint(high=num_frames, size=(K - num_frames,), dtype=torch.long)frame_indices = torch.sort(torch.cat((torch.arange(num_frames), frame_indices)))[0]
else:if num_frames > K:# Middle index for each segment.frame_indices = num_frames / K // 2frame_indices += num_frames // K * torch.arange(K)else:frame_indices = torch.sort(torch.cat((                              torch.arange(num_frames), torch.arange(K - num_frames))))[0]
assert frame_indices.size() == (K,)
return [frame_indices[i] for i in range(K)]
提取 ImageNet 预训练模型某层的卷积特征
#VGG-16 relu5-3 feature.
model = torchvision.models.vgg16(pretrained=True).features[:-1]
#VGG-16 pool5 feature.
model = torchvision.models.vgg16(pretrained=True).features
#VGG-16 fc7 feature.
model = torchvision.models.vgg16(pretrained=True)
model.classifier = torch.nn.Sequential(*list(model.classifier.children())[:-3])
#ResNet GAP feature.
model = torchvision.models.resnet18(pretrained=True)
model = torch.nn.Sequential(collections.OrderedDict(list(model.named_children())[:-1]))
with torch.no_grad():model.eval()conv_representation = model(image)提取 ImageNet 预训练模型多层的卷积特征class FeatureExtractor(torch.nn.Module):"""Helper class to extract several convolution features from the givenpre-trained model.Attributes:_model, torch.nn.Module._layers_to_extract, list<str> or set<str>Example:>>> model = torchvision.models.resnet152(pretrained=True)>>> model = torch.nn.Sequential(collections.OrderedDict(list(model.named_children())[:-1]))>>> conv_representation = FeatureExtractor(pretrained_model=model,layers_to_extract={'layer1', 'layer2', 'layer3', 'layer4'})(image)"""def __init__(self, pretrained_model, layers_to_extract):torch.nn.Module.__init__(self)self._model = pretrained_modelself._model.eval()self._layers_to_extract = set(layers_to_extract)def forward(self, x):with torch.no_grad():conv_representation = []for name, layer in self._model.named_children():x = layer(x)if name in self._layers_to_extract:conv_representation.append(x)return conv_representation其他预训练模型
链接：https://github.com/Cadene/pretrained-models.pytorch微调全连接层
model = torchvision.models.resnet18(pretrained=True)
for param in model.parameters():param.requires_grad = False
model.fc = nn.Linear(512, 100)  # Replace the last fc layer
optimizer = torch.optim.SGD(model.fc.parameters(), lr=1e-2, momentum=0.9, weight_decay=1e-4)以较大学习率微调全连接层，较小学习率微调卷积层
model = torchvision.models.resnet18(pretrained=True)
finetuned_parameters = list(map(id, model.fc.parameters()))
conv_parameters = (p for p in model.parameters() if id(p) not in finetuned_parameters)
parameters = [{'params': conv_parameters, 'lr': 1e-3}, {'params': model.fc.parameters()}]
optimizer = torch.optim.SGD(parameters, lr=1e-2, momentum=0.9, weight_decay=1e-4)模型训练
常用训练和验证数据预处理
其中 ToTensor 操作会将 PIL.Image 或形状为 H×W×D，数值范围为 [0, 255] 的 np.ndarray 转换为形状为 D×H×W，数值范围为 [0.0, 1.0] 的 torch.Tensor。
train_transform = torchvision.transforms.Compose([torchvision.transforms.RandomResizedCrop(size=224,scale=(0.08, 1.0)),torchvision.transforms.RandomHorizontalFlip(),torchvision.transforms.ToTensor(),torchvision.transforms.Normalize(mean=(0.485, 0.456, 0.406),std=(0.229, 0.224, 0.225)),])val_transform = torchvision.transforms.Compose([torchvision.transforms.Resize(224),torchvision.transforms.CenterCrop(224),torchvision.transforms.ToTensor(),torchvision.transforms.Normalize(mean=(0.485, 0.456, 0.406),std=(0.229, 0.224, 0.225)),
])训练基本代码框架for t in epoch(80):for images, labels in tqdm.tqdm(train_loader, desc='Epoch %3d' % (t + 1)):images, labels = images.cuda(), labels.cuda()scores = model(images)loss = loss_function(scores, labels)optimizer.zero_grad()loss.backward()optimizer.step()标记平滑（label smoothing）for images, labels in train_loader:images, labels = images.cuda(), labels.cuda()N = labels.size(0)# C is the number of classes.smoothed_labels = torch.full(size=(N, C), fill_value=0.1 / (C - 1)).cuda()smoothed_labels.scatter_(dim=1, index=torch.unsqueeze(labels, dim=1), value=0.9)score = model(images)log_prob = torch.nn.functional.log_softmax(score, dim=1)loss = -torch.sum(log_prob * smoothed_labels) / Noptimizer.zero_grad()loss.backward()optimizer.step()Mixupbeta_distribution = torch.distributions.beta.Beta(alpha, alpha)
for images, labels in train_loader:images, labels = images.cuda(), labels.cuda()# Mixup images.lambda_ = beta_distribution.sample([]).item()index = torch.randperm(images.size(0)).cuda()mixed_images = lambda_ * images + (1 - lambda_) * images[index, :]# Mixup loss.    scores = model(mixed_images)loss = (lambda_ * loss_function(scores, labels) + (1 - lambda_) * loss_function(scores, labels[index]))optimizer.zero_grad()loss.backward()optimizer.step()L1 正则化l1_regularization = torch.nn.L1Loss(reduction='sum')
loss = ...  # Standard cross-entropy loss
for param in model.parameters():loss += torch.sum(torch.abs(param))
loss.backward()不对偏置项进行 L2 正则化/权值衰减（weight decay）bias_list = (param for name, param in model.named_parameters() if name[-4:] == 'bias')
others_list = (param for name, param in model.named_parameters() if name[-4:] != 'bias')
parameters = [{'parameters': bias_list, 'weight_decay': 0},                {'parameters': others_list}]
optimizer = torch.optim.SGD(parameters, lr=1e-2, momentum=0.9, weight_decay=1e-4)梯度裁剪（gradient clipping）
torch.nn.utils.clip_grad_norm_(model.parameters(), max_norm=20)
计算 Softmax 输出的准确率
score = model(images)
prediction = torch.argmax(score, dim=1)
num_correct = torch.sum(prediction == labels).item()
accuruacy = num_correct / labels.size(0)
可视化模型前馈的计算图
链接：https://github.com/szagoruyko/pytorchviz可视化学习曲线有 Facebook 自己开发的 Visdom 和 Tensorboard 两个选择。
https://github.com/facebookresearch/visdom
https://github.com/lanpa/tensorboardX#Example using Visdom.
vis = visdom.Visdom(env='Learning curve', use_incoming_socket=False)
assert self._visdom.check_connection()
self._visdom.close()
options = collections.namedtuple('Options', ['loss', 'acc', 'lr'])(loss={'xlabel': 'Epoch', 'ylabel': 'Loss', 'showlegend': True},acc={'xlabel': 'Epoch', 'ylabel': 'Accuracy', 'showlegend': True},lr={'xlabel': 'Epoch', 'ylabel': 'Learning rate', 'showlegend': True})for t in epoch(80):tran(...)val(...)vis.line(X=torch.Tensor([t + 1]), Y=torch.Tensor([train_loss]),name='train', win='Loss', update='append', opts=options.loss)vis.line(X=torch.Tensor([t + 1]), Y=torch.Tensor([val_loss]),name='val', win='Loss', update='append', opts=options.loss)vis.line(X=torch.Tensor([t + 1]), Y=torch.Tensor([train_acc]),name='train', win='Accuracy', update='append', opts=options.acc)vis.line(X=torch.Tensor([t + 1]), Y=torch.Tensor([val_acc]),name='val', win='Accuracy', update='append', opts=options.acc)vis.line(X=torch.Tensor([t + 1]), Y=torch.Tensor([lr]),win='Learning rate', update='append', opts=options.lr)得到当前学习率#If there is one global learning rate (which is the common case).
lr = next(iter(optimizer.param_groups))['lr']#If there are multiple learning rates for different layers.
all_lr = []
for param_group in optimizer.param_groups:all_lr.append(param_group['lr'])学习率衰减#Reduce learning rate when validation accuarcy plateau.
scheduler = torch.optim.lr_scheduler.ReduceLROnPlateau(optimizer, mode='max', patience=5, verbose=True)
for t in range(0, 80):train(...); val(...)scheduler.step(val_acc)#Cosine annealing learning rate.
scheduler = torch.optim.lr_scheduler.CosineAnnealingLR(optimizer, T_max=80)
#Reduce learning rate by 10 at given epochs.
scheduler = torch.optim.lr_scheduler.MultiStepLR(optimizer, milestones=[50, 70], gamma=0.1)
for t in range(0, 80):scheduler.step()    train(...); val(...)#Learning rate warmup by 10 epochs.
scheduler = torch.optim.lr_scheduler.LambdaLR(optimizer, lr_lambda=lambda t: t / 10)
for t in range(0, 10):scheduler.step()train(...); val(...)保存与加载断点注意为了能够恢复训练，我们需要同时保存模型和优化器的状态，以及当前的训练轮数。#Save checkpoint.
is_best = current_acc > best_acc
best_acc = max(best_acc, current_acc)
checkpoint = {'best_acc': best_acc,    'epoch': t + 1,'model': model.state_dict(),'optimizer': optimizer.state_dict(),
}
model_path = os.path.join('model', 'checkpoint.pth.tar')
torch.save(checkpoint, model_path)
if is_best:shutil.copy('checkpoint.pth.tar', model_path)#Load checkpoint.
if resume:model_path = os.path.join('model', 'checkpoint.pth.tar')assert os.path.isfile(model_path)checkpoint = torch.load(model_path)best_acc = checkpoint['best_acc']start_epoch = checkpoint['epoch']model.load_state_dict(checkpoint['model'])optimizer.load_state_dict(checkpoint['optimizer'])print('Load checkpoint at epoch %d.' % start_epoch)计算准确率、查准率（precision）、查全率（recall）#data['label'] and data['prediction'] are groundtruth label and prediction
#for each image, respectively.
accuracy = np.mean(data['label'] == data['prediction']) * 100Compute recision and recall for each class.
for c in range(len(num_classes)):tp = np.dot((data['label'] == c).astype(int),(data['prediction'] == c).astype(int))tp_fp = np.sum(data['prediction'] == c)tp_fn = np.sum(data['label'] == c)precision = tp / tp_fp * 100recall = tp / tp_fn * 100PyTorch 其他注意事项模型定义建议有参数的层和汇合（pooling）层使用 torch.nn 模块定义，激活函数直接使用 torch.nn.functional。torch.nn 模块和 torch.nn.functional 的区别在于，torch.nn 模块在计算时底层调用了 torch.nn.functional，但 torch.nn 模块包括该层参数，还可以应对训练和测试两种网络状态。使用 torch.nn.functional 时要注意网络状态，如def forward(self, x):...x = torch.nn.functional.dropout(x, p=0.5, training=self.training)
model(x) 前用 model.train() 和 model.eval() 切换网络状态。
不需要计算梯度的代码块用 with torch.no_grad() 包含起来。model.eval() 和 torch.no_grad() 的区别在于，model.eval() 是将网络切换为测试状态，例如 BN 和随机失活（dropout）在训练和测试阶段使用不同的计算方法。torch.no_grad() 是关闭 PyTorch 张量的自动求导机制，以减少存储使用和加速计算，得到的结果无法进行 loss.backward()。torch.nn.CrossEntropyLoss 的输入不需要经过 Softmax。torch.nn.CrossEntropyLoss 等价于 torch.nn.functional.log_softmax + torch.nn.NLLLoss。loss.backward() 前用 optimizer.zero_grad() 清除累积梯度。optimizer.zero_grad() 和 model.zero_grad() 效果一样。PyTorch 性能与调试torch.utils.data.DataLoader 中尽量设置 pin_memory=True，对特别小的数据集如 MNIST 设置 pin_memory=False 反而更快一些。num_workers 的设置需要在实验中找到最快的取值。
用 del 及时删除不用的中间变量，节约 GPU 存储。
使用 inplace 操作可节约 GPU 存储，如x = torch.nn.functional.relu(x, inplace=True)减少 CPU 和 GPU 之间的数据传输。例如如果你想知道一个 epoch 中每个 mini-batch 的 loss 和准确率，先将它们累积在 GPU 中等一个 epoch 结束之后一起传输回 CPU 会比每个 mini-batch 都进行一次 GPU 到 CPU 的传输更快。使用半精度浮点数 half() 会有一定的速度提升，具体效率依赖于 GPU 型号。需要小心数值精度过低带来的稳定性问题。时常使用 assert tensor.size() == (N, D, H, W) 作为调试手段，确保张量维度和你设想中一致。除了标记 y 外，尽量少使用一维张量，使用 n*1 的二维张量代替，可以避免一些意想不到的一维张量计算结果。统计代码各部分耗时
with torch.autograd.profiler.profile(enabled=True, use_cuda=False) as profile:...
print(profile)或者在命令行运行
python -m torch.utils.bottleneck main.py致谢感谢 @些许流年和@El tnoto的勘误。由于作者才疏学浅，更兼时间和精力所限，代码中错误之处在所难免，敬请读者批评指正。参考资料PyTorch 官方代码：pytorch/examples (https://link.zhihu.com/?target=https%3A//github.com/pytorch/examples)PyTorch 论坛：PyTorch Forums (https://link.zhihu.com/?target=https%3A//discuss.pytorch.org/latest%3Forder%3Dviews)PyTorch 文档：http://pytorch.org/docs/stable/index.html (https://link.zhihu.com/?target=http%3A//pytorch.org/docs/stable/index.html)其他基于 PyTorch 的公开实现代码，无法一一列举
张皓：南京大学计算机系机器学习与数据挖掘所（LAMDA）硕士生，研究方向为计算机视觉和机器学习，特别是视觉识别和深度学习。个人主页：http://lamda.nju.edu.cn/zhangh/知乎链接：https://zhuanlan.zhihu.com/p/59205847?

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