【GNN报告】加拿大蒙特利尔唐建:图几何学习与药物发现
1、简介
报告嘉宾:唐建(加拿大蒙特利尔算法研究院,加拿大蒙特利尔大学商学院)
报告题目:Geometric Deep Learning For Drug Discovery
报告摘要
报告人简介
唐建博士,现任加拿大蒙特利尔学习算法研究所 (Mila) 以及蒙特利尔大学商学院副教授,加拿大人工智能研究主席(CIFAR AI Research Chair);主要研究方向为图表示学习、图神经网络,生成模型、知识图谱,和药物发现。他曾获得 ICML2014最佳论文奖, WWW2016最佳论文提名,Amazon及腾讯教师研究奖等。他是图表示学习领域的代表性人物,发表了图表示学习领域一系列代表性的工作如 LINE、LargeVis、RotatE 等,多次担任 NeurIPS,ICML领域主席。他的团队近期开源了基于机器学习的药物研发系统,受到广泛关注。个人主页:https://www.jian-tang.com/
2、Geometric Deep Learning For Drug Discovery
药物学习背景
学习过程
新工作大纲
分别对应的工作
insight:建模为3D结构
分子和蛋白质建模工作
GeoDiff
基于3D结构的深度学习预训练技术(刚挂出来)
生物医学知识图谱推理
Neural Bellman-Fold Networks 工作
TorchDrug药物发现系统平台
目前大多针对小分子,目前也在研究大分子(就是上面图中最后一个模块)
旧工作大纲
分子性质预测任务
工具
方法 InfoGraph
实验结果
分子设计与优化任务
GraphAF方法
动机
实验结果
Retrosynthesis预测任务
G2Gs方法
实验结果
Going Beyond 2D Graphs: 3D Structures
Reasoning on Knowledge Graphs
小结
3、参考
中科大×LOGS || 加拿大蒙特利尔唐建:图几何学习与药物发现_哔哩哔哩_bilibili
中科大×LOGS|| 加拿大蒙特利尔唐建:图几何学习与药物发现
https://github.com/tangjianpku
Jian Tang’s Homepage
清华AIR学术工作坊 | 唐建:基于图表示学习的新药发现(上)_哔哩哔哩_bilibili
清华AIR学术工作坊 | 唐建:基于图表示学习的新药发现(下)_哔哩哔哩_bilibili
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