KEGG 下载 Pathway 通路数据
- 进入KEGG物种列表,网址:https://www.kegg.jp/kegg/catalog/org_list.html
这里以小鼠为例,点击
Ctrl
+F
查找物种小鼠的拉丁名Mus musculus
这里也可以用
mouse
来搜索,不过可以看到在kegg中含有三种鼠的信息。为了信息准确,最好使用拉丁名作为搜索条件。点击
Brite hierarchy
进入
KEGG Orthology (KO)
KEGG Orthology 提供了两种可供下载的格式,比如下载
htext
格式如果提示连接不到网络,可以多次点击,国外网的原因。。。
htext
格式如下下载
json
格式json
格式如下,这种格式更适合提取数据
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