• 进入KEGG物种列表,网址:https://www.kegg.jp/kegg/catalog/org_list.html

  • 这里以小鼠为例,点击Ctrl+F查找物种小鼠的拉丁名Mus musculus

    这里也可以用mouse来搜索,不过可以看到在kegg中含有三种鼠的信息。为了信息准确,最好使用拉丁名作为搜索条件。

  • 点击Brite hierarchy

  • 进入KEGG Orthology (KO)

  • KEGG Orthology 提供了两种可供下载的格式,比如下载htext格式

    如果提示连接不到网络,可以多次点击,国外网的原因。。。

  • htext格式如下

  • 下载json格式

  • json格式如下,这种格式更适合提取数据

KEGG 下载 Pathway 通路数据相关推荐

  1. kegg 上ko号对应的通路数据

    kegg 上ko通路数据的获取 最近一直在弄kegg的一些东西,就把心得写下来吧. 接着自己上面的文章: ko对应K号的表的下载 得到的json文件内容部分如下: {"name": ...

  2. linux下kegg注释软件,KEGG数据库-pathway对应基因的注释信息下载

    KEGG数据库-pathway对应基因的注释信息下载 KEGG数据库pathway相关数据下载 我们下载KEGG数据库的目的是为了研究目标蛋白参与了那些pathway . 前面我们介绍了KEGG 数据 ...

  3. 【Reactome 下载所有通路基因集】

    Reactome 下载所有通路基因集 Reactome 下载所有通路基因集 Reactome 介绍 ReactomePA 官网下载处理 Reactome 下载所有通路基因集 目前,网上有许多下载 KE ...

  4. 下载的长数据怎么分开R语言_TCGA数据库单基因gsea作业之COAD-READ

    我前面写过 单基因GSEA分析策略(数据分析免费做活动继续) ,然后马上就碰到了一个求助,复现下面的图表! 发表在Cancer Management and Research的简单数据挖掘杂志:Apo ...

  5. GWAS处理流程(全基因组关联分析)——对从ADNI数据库下载的SNP数据及进行质控(QC)

    对从ADNI数据库下载的SNP数据及进行质控(QC) 简介 一.先查看数据中的个体和SNP缺失情况 1.查看 2.生成绘图以可视化缺失结果. 二.QC第一步:删除缺失度大于某个数值的SNP和个体 1. ...

  6. 一文快速读懂 KEGG 数据库与通路图

    一.介绍 在进行生物学实验或者生物信息的学习中,都会听说KEGG富集分析,而且该方法在高通量测序分析中已然成为数据分析中必不可少的一环. 这种分析方法依托的是由 Kanehisa实验室 在1995年开 ...

  7. 从新浪财经上下载交易明细数据并统计每天的买卖笔数(shell 命令行)

    从新浪财经上下载交易明细数据并统计每天的买卖笔数 1.下载 如果需要下载多只股票多个交易日的明细数据,可以建立一个地址链接文件.下例给出了下载600001股票2008年1至9月各个交易日的数据需要的链 ...

  8. python下载文件到本地-Python下载网络文本数据到本地内存的四种实现方法示例

    本文实例讲述了Python下载网络文本数据到本地内存的四种实现方法.分享给大家供大家参考,具体如下: import urllib.request import requests from io imp ...

  9. python导入哨兵数据_Python 下载哨兵Sentinel数据(Sentinel-1~3)

    哨兵数据目前应用广泛,空间分辨.光谱分辨率都比较高.目前数据下载部分包括官网和Python程序下载. 其中哨兵1和2数据下载网上已经有非常详细的记录,链接如下:Python中使用sentinelsat ...

  10. 用Python编写小工具下载OSM路网数据

    文章来源于Python大数据分析,作者费弗里 本文对应脚本已上传至Github仓库: https://github.com/CNFeffery/DataScienceStudyNotes[1] 1 简 ...

最新文章

  1. 如何理解naive Bayes
  2. python引用传递的区别_python的值类型和引用类型及值传递和引用传递的区别
  3. POJ - 2914 Minimum Cut(全局最小割-Stoer_Wagner)
  4. vue跳转页面增加等待_vue跳转页面方法
  5. AtCoder Regular Contest 120 C - Swaps 2 线段树模拟
  6. mysql 查询系统_使用select和show命令查看mysql数据库系统信息
  7. 多进程模块multiprocessing
  8. bootstraptable列宽自适应内容_多列列表框行高和列宽的自适应调整
  9. Leetcode 76.最小覆盖子串
  10. Linux下安装DB2数据库
  11. exe应用程序无法启动,因为应用程序的并行配置不正确
  12. 编程设计模式中委托 和代理模式的区别
  13. “无法访问参数错误。”的4种解决方法
  14. 史上最美大型互联网机房综合布线图鉴
  15. tp获取php异常信息,ThinkPHP 异常处理
  16. matlab中tgn,TGN/EE介导的囊泡运输与GDI1协同调控根毛中ROP2 GTPase的动态定位的机理研究...
  17. 金融知识国民读本(一)
  18. 深信服行为感知命令执行漏洞
  19. VM(虚拟机)Ubuntu打不开
  20. php获取nginx真实IP,nginx proxy获取用户真实ip

热门文章

  1. 机器学习进阶 第一节 第一课
  2. linux统计文件大小大于100k,Centos / Linux设置logrotate为所有日志的最大文件大小
  3. Python爬虫实现爬取糗事百科段子 (26行代码简单实现)
  4. SQL中去重的三种方式
  5. java 解析unicode,解析Unicode编码和Java char
  6. 科技云报道:资本涌入的计算机视觉,却逃不开商业化“摆烂”?
  7. OpenFileDiaog.Filter的使用
  8. SEO学习笔记一:Google搜索引擎背后的运作模式
  9. 网传华为员工未加班领夜宵被冻薪降考评,并终身不得领夜宵
  10. C#修改内存制作外挂