跟着“Science”做张24h 南丁格尔玫瑰图吧
今天是端午节,祝朋友们阖家安康!
“一切平面图形中,圆是最美的”! --古希腊毕达哥拉斯学派
当你对毕业论文,研究报告中使用最多的柱状图出现审美疲劳时,不妨将它“掰弯”,连成一个圆试试看,会给你耳目一新的视觉冲击,并且还不占空间。
例如在这篇题为“Sleep-wake cycles drive daily dynamics of synaptic phosphorylation”的Science文章中,作者利用极坐标绘制了突触磷酸化蛋白质组(synaptic phosphoproteome)的24h日变化情况。
我们就来处理下这个图。
“余丁解图”
该图属于极坐标bar图,还有一个漂亮的名字叫做南丁格尔玫瑰图(rose plot)。
形:属于极坐标类型
意:由于是极坐标,因此X轴缩成点;Y轴变成了原点周围的bar高度
数:24h对应的值
仿:颜色分3部分,左侧背景色、右侧背景色、bar颜色
合:左侧legend标尺(高度基本与右侧对应,分割数与右侧的grid数一样),右侧极坐标bar
经过上面的剖析,我们基本了解了这个图的各个部分内容,开始写后台代码,前台UI按钮,直接用paper里边的数据作为示例,经过简单调试,一个在线绘制该图的页面就做好了,快来试试吧!
1,打开绘图页面
http://www.bioinformatics.com.cn/plot_basic_24h_polar_bar_plot_141
中间为输入数据,选择参数;右侧为简要说明和例图。
2,下载示例数据
下载右侧示例数据excel
数据很简单,就1列,25行。第1行为名字,就是legend的描述。其余行为每个时间点对应的值。注意:这里是从0开始的。
3,拷贝并粘贴数据
拷贝这25行,并粘贴到输入框中,
4,修改参数,并提交
为了更方便些,我们这里设置了每个时间点的颜色均可选。另外还有字体大小等选项。最后是最大值和间距值。例如最大值选24,间距值选4,那么legend标注就是0,4,8,12,16,20,不包括最后一个24,对应圈上的圆形grid就是0,4,8,12,16,20。
包括:图片大小,字体大小,颜色,阈值,标注等等。基本可以满足90%的需求了。
如果你有另外10%的需求,请直接联系我们进行定制!
5,提交出图
贴好数据,选好参数(这里我们全部默认)后,点击提交,就会在右侧出现预览图。
若没有预览,就是没有做出来图,这时,需要检查数据格式等,请参考输入框什么的6条!
南丁格尔玫瑰图就做好了。同样提供了4种格式供下载!
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