RDKit | 基于RDKit 的化合物预处理

基于Python和RDKit对化合物数据进行预处理。

环境

MolVS是专门用于化合物预处理的库。

rdkit 2020.03
molvs 0.1.1

化合物（Compound）预处理

RDKit：SanitizeMol

Kekure的形成，化合价的确认，芳香性的设定，结合等。

参考：http://rdkit.org/docs/source/rdkit.Chem.rdmolops.html

MolVS : Normarize

参考：https://molvs.readthedocs.io/en/latest/guide/standardize.html

进行了一系列转换，以修复常见错误并标准化特征组。

from rdkit import

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