venn.diagram生成pdf图片

R包VennDiagram::venn.diagram 自定义韦恩图输出图片

1.问题

在linux系统下，想要将venn.diagram函数画出的venn输出在当前目录下，结果是函数里面的filename定义不能输出图片，但是在Rstidio中可以生成图片到本地，使用的原代码：
无法生成图片！！！

venn.diagram(x = list(a_name, b_name),category.names = c(diff_a , diff_b),lwd = 1,  # 圈线条粗细 1 2 3 4 5lty = 1,  # 线条类型, 1 实线, 2 虚线, blank 无线条#fill = color,  # 填充色col = c("red", 'green'),  # 线条色filename = "test.png",output=TRUE)

2.解决办法

现将filename用空值Null赋值，不能用“”代替；
imagetype 有三种类型可以选择png、svg、tiff，默认是tiff；

调用grid：grid.draw（）画图
调用pdf生成图片

代码

p<-venn.diagram(x = list(a_name, b_name),category.names = c(diff_a , diff_b),lwd = 1,  # 圈线条粗细 1 2 3 4 5lty = 1,  # 线条类型, 1 实线, 2 虚线, blank 无线条#fill = color,  # 填充色col = c("red", 'green'),  # 线条色#imagetype = "svg",filename = NULL,output=TRUE)pdf("venn.pdf")
grid.draw(p)
dev.off()

3.个人猜想

1.其他画图函数具有filename的，一般都会有imagetype，可以选择；另外filename=“”和filename=NULL意思是不同的。

2.关闭venn函数内部画图的功能之后，需要将函数的图片赋值之后，需要调用其他画图函数。

参考：

1.venn.diagram如何保存pdf格式文件
2.使用 R：VennDiagram 包时，将图片生成在Plots窗口而不保存图片文件到本地
3.grid.draw 绘制一个网格grob

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