Ubuntu安装MPICH3集群计算环境

本文是在Ubuntu15.10麒麟版中安装过程的实录。

准备工作：

1.设置root用户密码（命令：sudo passwd root）

2.正确设置各个节点IP（各个节点应该使用静态IP）

3.正确设置各个Host名字（sudo gedit /etc/hostname，同时要修改/etc/hosts内容使得Host名字保持一致）

4.安装OpenSSH软件（sudo apt-get install openssh-server）

注意点：

安装过程中，如果修改了一些参数，有时需要删除~/.ssh/known_hosts文件，然后重新用ssh命令连接到其他节点机器上。

MPICH官网是http://www.mpich.org/（点击进入，下同）。

setp1：下载软件

软件下载地址是：http://www.mpich.org/downloads/。如下图所示：

点击上图中mpich-3.2相关的"http"链接，即可下载软件。下载的软件文件名是“mpich-3.2.tar.gz”。

step2.解压缩软件
可以用提取菜单功能进行提取，也可以使用以下命令解压缩：

tar -xzvf soft/mpich-3.2.tar.gz

解压缩后得到目录“mpich-3.2”。

step3.软件安装

运行以下命令进行安装（将软件安装在/usr/local/mpich目录下）：

cd mpich-3.2

./configure --prefix=/usr/local/mpich

对于上述命令，如果没有安装Fortran语言编译器，则需要给该命令增加选项，屏蔽Fortran语言支持，否则会出现错误。可以运行以下命令：

./configure --prefix=/usr/local/mpich --disable-fortran

然后，运行以下命令：

make

make install

step4.环境变量设置

运行以下命令，编辑文件“/etc/profile”中的环境变量：

sudo gedit /etc/profile

在该文件的最后，添加以下的行：

PATH=$PATH:/usr/local/mpich/bin
MANPATH=$MANPATH:/usr/local/mpich/man
export PATH MANPATH

step5.单节点测试

运行以下命令（将本地目录下程序拷贝到安装软件的位置）：

cp -r examples/ /usr/local/mpich

运行测试，运行以下命令：

mpiexec -n 10 /usr/local/mpich/examples/cpi

step6.其他测试

可以运行以下命令进行测试，检查MPICH是否正确安装。

which mpicc

which mpiexec

step7.集群机器免密码登录设置

事先需要安装OpenSSH软件，运行以下命令：

sudo apt-get install openssh-server

同时需要启动ssh服务，运行以下命令：

/etc/init.d/ssh start

接着进行ssh配置。运行以下命令：

ssh-keygen -t dsa

需要输入3次Enter，生成的文件在~/.ssh目录下。

然后，使用以下命令，将文件id_rsa.pub拷贝到authorized_keys（在~/.ssh目录下运行以下命令）：

cat id_rsa.pub authorized_keys

同时，需要把这两个文件（id_rsa.pub和authorized_keys）拷贝到各个节点的~/.ssh目录下。

step8.ssh登录测试

可以输入以下命令，登录到其他机器中：

ssh m1

这里，m1是集群节点的某个机器IP名字，m1也可以是IP。

step9.各个集群节点的软件安装

各个集群节点也需要安装MPICH软件，同时配置做step7的配置（将文件id_rsa.pub和authorized_keys拷贝到各个节点的~/.ssh目录下。）

step10.多机集群计算测试

通常在~（主目录）目录下，创建machinefile（该文件名可以是其他名字，也可以是这个名字），其内容如下：

m1:4

m2:4

m3:4

m4:4

这里，m1-m4为各个节点的IP值，冒号后面的是节点的线程数。然后，运行以下命令，进行集群计算测试：

mpiexec -n 10 -machinefile ./machinefile /usr/local/mpich/examples/cpi

至此，MPICH集群计算环境安装设置完成。

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