1.ggtree

代码如下：

library(ggtree)
library(ggplot2)
library(ape)
library(phytools)
library(maps)
#读入一致树
tree<-read.nexus(file="E:/paup4/paup/25tax50feature_cons.tree")
#可视化，geom_nodelab()添加bootstrap值
ggtree(tree)+geom_tiplab(size=4)+geom_nodelab(hjust=-0.05,size=4)

2.FigTree

打开FigTree.exe，file – open 打开树文件

左侧 mode labels – display – label

bootstrap值就标注在树上啦。。

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