代码：

import java.io.BufferedOutputStream;
import java.io.BufferedReader;
import java.io.DataOutputStream;
import java.io.File;
import java.io.FileInputStream;
import java.io.FileOutputStream;
import java.io.IOException;
import java.io.InputStreamReader;

//有一些文件，当从jar转换成txt时，发现它为每个文件外建了一个同名的文件夹来保存这个文件
//大概是默认地把一本书建立一个文件夹，然后按照每章独立生成一个文件
//目标是把所有只有一个文件的文件夹里的文件移出，然后删除该文件夹
public class HandleTextBooks
{
private static void deleteFolderOrFile(File file)
{
  if(file.exists())
  {
   if(file.isDirectory())//文件，需要遍历目录下文件或文件夹，文件直接删除，文件夹则递归
   {
    File []files = file.listFiles();
    for(int i=0;i<files.length;i++)
     deleteFolderOrFile(files[i]);
   }
   file.delete();//删除文件或空文件夹
  }
}
//去除点及后缀，取得文件名
static String getFileNameWithoutPostfix(String fileName)
{
  int index = fileName.lastIndexOf('.');
  return fileName.substring(0, index);
}

//参数file是一个txt文件，这个方法把这该文件复制到所在目录的上一层目录里，再把该文件所在的目录删除
static void createATextBook(File file) throws IOException
{
  //在这个例子中，如果文件名（除去“点+后缀”）与所在目录名相同，才需要进行这个方法的操作
  System.out.println(getFileNameWithoutPostfix(file.getName()));System.out.println(file.getParentFile().getName());
  if(getFileNameWithoutPostfix(file.getName()) != file.getParentFile().getName())
   return;
  String fileName = file.getAbsolutePath();
  System.out.println("function 'void createATextBook(File file)-1':"+fileName);
  InputStreamReader reader = new InputStreamReader(new FileInputStream(fileName),"GB2312");
  BufferedReader in = new BufferedReader(reader);
  String readLineStr = new String();    
  //在文件所在目录的上一级目录创建一个与之同名的文件
  System.out.println("function 'void createATextBook(File file)-2':"+file.getParentFile().getParent());
     DataOutputStream out = new DataOutputStream(
    new BufferedOutputStream(new FileOutputStream(file.getParentFile().getParent()+"/"+file.getName())));
     while((readLineStr = in.readLine())!= null)
     {
      out.write((readLineStr+"\r\n").getBytes("GB2312"));//在Windows下换行必须是"\r\n"
     }
     in.close();
     out.close();
     deleteFolderOrFile(file.getParentFile());//删除该文件所在的目录
}
//为了递归调用，单独写成一个方法
static void handleTextBooks(File file)throws IOException
{
  if(file.exists()&&file.isDirectory())
  {
   File temFile = file.listFiles()[0];
   if((file.list().length == 1)&&(temFile.isFile()))
   {
    createATextBook(temFile);
   }
   else
   {
    File []files = file.listFiles();
    for(int i=0;i<files.length;i++)
    {
     handleTextBooks(files[i]);
    }
   }
  }
}
public static void main(String[]args)throws IOException
{
  File file = new File("F:/EBooks/常识作d/");
  handleTextBooks(file);
}
}

注：在Java中，File对象即可以是文件也可以是文件夹，所以在一个File文件夹上要写入数据，会提示：拒绝访问。

Java不提供直接复制的API，所以复制一个文件时，只能是先读取再写入。实验过程中发现，读一行写一行的执行速度远快于读全文再写全文。

实际上还有些情况，即文件与所在目录名不同，但仍属于本文所要处理的那种情况，所以，可以简单地把方法static void createATextBook(File file) throws IOException
中的第一段注释掉。

效果：

原来情况下，每个文件夹下都有唯一一个同名文件：

处理之后：