python文件处理，去除内含子，拼接外显子

DNA序列：

ATGGTCTACATAGCTGACAAACAGCACGTAGCAATCGGTCGAATCTCGAGAGGCATATGGTCACATGATCGGTCGAGCGTGTTTCAAAGTTTGCGCCTAG

内含子1：ATCGGTCGAA

内含子2：ATCGGTCGAGCGTGT

剪切之后的拼接结果为：

ATGGTCTACATAGCTGACAAACAGCACGTAGCATCTCGAGAGGCATATGGTCACATGTTCAAAGTTTGCGCCTAG

dna1 = "ATGGTCTACATAGCTGACAAACAGCACGTAGCAATCGGTCGAATCTCGAGAGGCATATGGTCACATGATCGGTCGAGCGTGTTTCAAAGTTTGCGCCTAG"
dna2 = "ATCGGTCGAA"
dna3= "ATCGGTCGAGCGTGT"
a = dna1.index(dna2)
b = dna1[:a]+dna1[a+len(dna2):]
c = b.index(dna3)
d = b[:c]+b[c+len(dna3):]
print(d)

注意字符串的index方法：

>>>dna1='ABCDEF'
>>>index=dna1.index('CDE')
>>>index2

转载于:https://www.cnblogs.com/lmt921108/p/8023338.html

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