数据结构实验病毒感染检测问题

假设病毒的DNA序列为baa，患者1的DNA序列为aaabbba，则感染。患者2的DNA序列为babbba，则未感染。（注意：人的DNA序列是线性的，而病毒的DNA序列是环状的）。

下面分别展示BF算法以及KMP算法的实现

注：KMP算法理解起来比较困难，若想简单理解原理，则可参考天勤的讲解

BF算法：

#include <iostream>
#include <string>
using namespace std;int index_BF(const string &str1, const string &str2, int pos);int main(){int pos = 0;string str1,str2;while(cin >> str2 >> str1){if(str1 == "0" || str2 == "0")break;int result = index_BF(str1,str2,pos);if(result != -1){cout << "YES " << result << endl;}else{cout << "NO" << endl;}}}int index_BF(const string &str1, const string &str2, int pos){int i = pos;int j= 0;int len1 = str1.size();int len2 = str2.size();while(i<len1 && j<len2){if(str1[i] == str2[j]){i++;j++;}else{i = i - j + 1;j = 0;}}if(j >= len2)return i-len2;elsereturn -1;}

KMP算法：

 #include<iostream>#include<cstring>#include<string>#include<fstream>using namespace std;void get_next(string str2,int *next){int i,j;i=1;j=0;next[1]=0;while(i<str2.size()){if(j==0||str2[i]==str2[j]){++i;++j;if(str2[i]!=str2[j])next[i]=j;elsenext[i]=next[j];}elsej=next[j];}}int kmp(string &str1,string &str2,int pos){int i=pos;int j=0;int next[255];get_next(str2,next);int len1=str1.size();int len2=str2.size();while(i<len1&&j<len2){if(j==0||str1[i]==str2[j]){i++;j++;}else{j=next[j];}}if(j>=len2)return i-len2;elsereturn -1;}int main(){int pos=0    ;string str1;string str2;while(cin >>str2>>str1){if(str1=="0"&&str2=="0")break;int result=kmp(str1,str2,pos);if(result!=-1)cout<<"YES"<<endl;elsecout<<"NO"<<endl;}return 0;}

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