2021年9月16日,Journal of Genetics and Genomics 在线发表北京大学口腔医院陈峰副研究员团队和北京大学人民医院陈宁副主任医师团队合作题为“The role of genotype and diet in shaping gut microbiome in a genetic Vitamin A deficient mouse model”的研究论文。该论文报道了遗传性维生素A缺陷小鼠模型中,基因型、低维生素A饮食、小鼠周龄和饮食干预起始周龄等因素对肠道菌群的多重调节作用。

https://doi.org/10.1016/j.jgg.2021.08.015

肠道菌群不仅参与宿主多种急慢性疾病的发生发展,还与子代正常发育息息相关。尽管已有诸多研究报道肠道菌群受多种因素共同调节,但目前较少有单独研究综合分析多种因素对肠道菌群调节作用的强弱。

Retinol binding protein 4 (RBP4) 是外周血中唯一存在的视黄醇结合蛋白,其基因缺陷会引起外周血中视黄醇转运功能障碍,导致遗传性的维生素A缺乏。该研究通过构建Rbp4–/–小鼠,在不同周龄(4周龄和7周龄)对小鼠进行28天低维生素A饮食饲喂,并采集七个时间点的粪便样本,以评价宿主基因型、饮食、周龄和饮食干预起始周龄等因素对肠道菌群的影响。

研究发现宿主基因型、饮食习惯、周龄和饮食干预起始周龄等因素都不同程度地影响肠道菌群组成。单纯基因型差异就可以引起肠道菌群显著不同;饮食干预能迅速调整肠道菌群构成,且饮食干预时间越早,肠道菌群紊乱程度越高;周龄对肠道菌群的影响微弱但持久。值得注意的是,饮食、周龄和饮食干预起始周龄等因素对母体肠道菌群调节作用都伴随基因型特异性的影响。

基因型、饮食、周龄等因素对肠道菌群的调节作用 (MDI:菌群失调指数)。

北京大学人民医院徐俊博士和北京大学口腔医院张杰铌博士为该论文共同第一作者,陈峰副研究员和陈宁副主任医师为共同通讯作者。中科院刘永鑫高级工程师参与部分生信分析工作。相关工作得到国家自然科学基金、北京市自然科学基金、北京大学临床+X基金等资助。

引用本文:Jun Xu, Jie-Ni Zhang, Bo-Hui Sun, Qing Liu, Juan Ma, Qian Zhang, Yong-Xin Liu, Ning Chen, Feng Chen. (2021). The role of genotype and diet in shaping gutmicrobiome in a genetic Vitamin A deficient mouse model. Journal of Genetics and Genomics.

DOI: 10.1016/j.jgg.2021.08.015.

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