R语言绘制二维密度图

R语言绘制二维密度图

二维密度图显示了两个数值变量之间的关系，一个在x轴上表示，另一个在Y轴上表示，与散点图类似，然后计算二维空间中特定区域内的观测数，并用颜色梯度表示。二维密度图有几种类型，以下主要展示二维直方图和Hexbin图的绘图代码。

R语言|绘制二维直方图
对于2d直方图，plot区域被划分为多个正方形，调用geombin2d（）函数，它提供了一个bins参数，用于控制要显示的bins数量。

1.先绘制基础的散点图；

##二维直方图
# Library
library(tidyverse)
library(ggplot2)# 读取数据
a <- data.frame( x=rnorm(20000, 10, 1.9), y=rnorm(20000, 10, 1.2) )
b <- data.frame( x=rnorm(20000, 14.5, 1.9), y=rnorm(20000, 14.5, 1.9) )
c <- data.frame( x=rnorm(20000, 9.5, 1.9), y=rnorm(20000, 15.5, 1.9) )
data <- rbind(a,b,c)#绘制基础的散点图
ggplot(data, aes(x=x, y=y) ) +geom_point()

2.绘制二维直方图。

####二维直方图可使用geom_bin2d()函数绘制
#二维直方图默认选项
ggplot(data, aes(x=x, y=y) ) +geom_bin2d() +theme_bw()# Bin大小控制与调色板
ggplot(data, aes(x=x, y=y) ) +geom_bin2d(bins = 70) +scale_fill_continuous(type = "viridis") +theme_bw()

R语言|绘制Hexbin图

当显示大型数据集时，散点图很难解释，因为点不可避免地会被覆盖，并且可能不被单独识别出来。hexbin图中将地块划分为多个六边形，图中阴影部分代替了条形图的高度。图形是通过R的hexbin包绘制的。

# Packages
library(hexbin)
library(RColorBrewer) # Create data
x <- rnorm(mean=1.5, 5000)
y <- rnorm(mean=1.6, 5000) # Make the plot
bin<-hexbin(x, y, xbins=40)
my_colors=colorRampPalette(rev(brewer.pal(11,'Spectral')))
plot(bin, main="" , colramp=my_colors , legend=F )

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