分享一个CCLE细胞系数据(CCLE数据库不能用了吗?)
癌细胞系百科全书项目 - Broad 研究所与诺华生物医学研究所之间的合作
2006 年,Sellers (Novartis)、Garraway (Broad Institute) 和 Schlegel (Novartis) 为约 1000 个癌细胞系的大规模基因表征制定了初步项目计划。该项目随后两次更新,因此我们将这些视为 CCLE 项目的三个阶段。
其网址如下:Cancer Cell Line Encyclopedia (CCLE)
来看看界面,CCLE数据库似乎改版了:
点击datasets:
然后点击download:
然而,这个网站就像崩了一样,没有任何反应。
难道官网下载不了CCLE数据了吗,那我们去哪下载。我搜遍各大网站及pubmed,最终无意中在UCSC xena网站中找到了CCLE数据库,关于UCSC xena如何下载数据,参照之前的一篇文章
分享一个TCGA数据库_李京弦的博客-CSDN博客https://blog.csdn.net/weixin_46500027/article/details/123673522?spm=1001.2014.3001.5501
下面我们直接点UCSC xena看看:
放在了UCSC 公共数据库里面。
如果不仔细去看,还真不知道。
我们点进去看一看:
可以看到CCLE原有的数据库基本都上传到了这里。
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