Numpy报错解决办法

2024-06-05 20:58:07

bug描述：

经常出现加载numpy会报错或者在安装tensoflow、pytorch时，出现如下错误：

问题一：

RuntimeError: module compiled against API version 0xc but this version of numpy is 0xb
Traceback (most recent call last):File "/home/hcguo/miniconda3/envs/wes/bin/bamCoverage", line 5, in <module>from deeptools.bamCoverage import mainFile "/home/hcguo/miniconda3/envs/wes/lib/python2.7/site-packages/deeptools/bamCoverage.py", line 8, in <module>from deeptools import writeBedGraph  # This should be made directly into a bigWigFile "/home/hcguo/miniconda3/envs/wes/lib/python2.7/site-packages/deeptools/writeBedGraph.py", line 5, in <module>import pyBigWig
ImportError: numpy.core.multiarray failed to import

问题二：

FutureWarning: Passing (type, 1) or '1type' as a synonym of type is deprecated;in a future version of numpy, it will be understood as (type, (1,)) / '(1,)type'._np_qint8 = np.dtype([("qint8", np.int8, 1)])

解决办法：

一般这种问题都是版本问题，需要将版本降低。一般来说，numpy1.17版本都比较高，可能支持不太好，博主试了好几个都是因为1.17版本报错的原因，解决办法是：

pip3 install numpy==1.16

将版本降低，如果还是不行，则试试15,14.....

如果不想这样一个一个试就我就用下面命令查了一下我的numpy文件的版本

pip show numpy

我们回到之前的出现问题中， RuntimeError: module compiled against API version 0xc but this version of numpy is 0xb

说明你需要的是0xc版本的numpy，然后去查一下这个对应的numpy版本，下载就好；

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