文章目录

1.基于序列特征搜寻潜在基因
2 基于实验技术鉴别候选基因
3 基于同源比对确定基因的功能（基因： 80%的相似性；蛋白质：30%的一致性或50%的相似性）
4.4 基于实验技术预测基因功能：
- gain/loss of function
4.5原核生物基因组中的基因知识
- 操纵子----多个基因共用一套启动原件或调控原件
4.6 真核生物基因组中的基因组织
4.7 可移动元件和病毒的基因组织
- DNA 转座子

1.基于序列特征搜寻潜在基因

可能的结构：开放阅读框，密码子，内含子-外显子边界，启动子，回文序列，互补区（RNA茎环结构）

2 基于实验技术鉴别候选基因

RNA杂交法/种属印记法

种属印记法：

2.3 cDNA测序法：可以确定左右边界

末端快速扩增法

2.4 外显子探测法

3 基于同源比对确定基因的功能（基因： 80%的相似性；蛋白质：30%的一致性或50%的相似性）

3.1 软件预测：基因之间的同源性（直向/直系同源基因：黑猩猩和人的肌红蛋白基因；共生/旁系同源基因：同一个生物体内的同源基因：人的肌红蛋白和β-球蛋白基因）
BLAST软件

比蛋白质的结构域。

4.4 基于实验技术预测基因功能：

gain/loss of function

#4.4.1 基于同源重组基因灭活(loss of function)
4.4.2基因转座作用的基因功能灭活
4.4.3 基于RNA干扰的基因沉默（RNAi/siRNA）

4.4.4 基于过表达的基因增强

基于定点突变的基因扰动：同源重组//CRISPR-Cas9技术

4.5原核生物基因组中的基因知识

操纵子----多个基因共用一套启动原件或调控原件

基因的容量：

4.6 真核生物基因组中的基因组织

4.6.1基因容量
基因家族：相似或相同，具有序列相似差异------多基因家族/超基因家族

4.6.2 由于RNA剪切作用，蛋白质编码基因小于蛋白质种类数。

4.6.3人类基因目录

4.6.4真核生物核基因组的重复序列
卫星DNA2-200pb，一般在着丝粒区。

小卫星、微卫星重复：具有特异型：每个人的微卫星不同（DNA鉴定）。

4.7 可移动元件和病毒的基因组织

RNA转座子与逆专座

DNA 转座子

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