利用Bio.SeqIO提取基因组中特定序列时注意事项
例如:
from Bio import SeqIO
# 读取基因组文件
fa_seq = SeqIO.read(fasta_t_path+'\\genome.fasta', "fasta")
# 从基因组中提取我想要的基因(基因的位置信息从NCBI上找到为4130142:4131557)
# 但不能用起始位置的4130142作为起始,因为seq的从基因组中提取序列的方式类似列表的切片,4130142该位置的碱基是不被包含进去的,所以用4130141
b = fa_seq.seq[4130141:4131557]
b
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