小分子化合物在重编程中的应用
2006 年,日本科学家山中伸弥等人利用四个转录因子(Oct4、Sox2、Klf4和c-Myc)将小鼠胚胎成纤维细胞(MEFs)和成体成纤维细胞重编程为诱导多能干细胞(induced pluripotent stem cells, iPSCs)[1],iPSCs 和胚胎多能干细胞(embryonic stem cells, ESCs)一样,具有自我更新的能力,在体外可以长期扩增,并能够分化为三个胚层的组织和细胞。这一研究成果使得重编程的研究工作如火如荼。
重编程(reprogramming )是指通过一定的手段使已经分化的细胞回复到具有分化能力的干细胞的状态。根据所用方法的不同,重编程可以分为转录因子介导的重编程和非转录因子的重编程。非转录因子介导的重编程常用的方法为小分子化合物。
小分子化合物在重编程领域具有得天独厚的优势。首先,小分子化合物避免了转录因子介导重编程常用到的病毒载体整合进基因组,不会破坏细胞基因组的结果,安全性较高;其次,大部分小分子化合物均能以渗透的方式进入细胞内发挥作用,省去了细胞转染、病毒包装、细胞感染等繁琐步骤,且便于进行定量研究,可操作性强;此外,小分子化合物结构多样、靶点清晰、价格低廉、易于获得且可选择性大;最后,小分子化合物价格相对低廉,可节省大量成本。
图1.分化和重编程的影响机制
2011 年,中国科学家邓宏魁等人发现,化合物组合(VPA, CHIR99021, 616452, Tranylcypromine)可以成功替代 YAMANAKA 四因子(OSKM)中的三个转录因子(Sox2/Klf4/c-Myc),与 Oct4 一起作用将小鼠成纤维细胞重编程为多能干细胞[2]。接下来,通过 10000 个化合物的筛选,邓宏魁团队又发现了可以代替 Oct4 的化合物组合。从而实现了纯化合物组合(VPA, CHIR99021, Repsox, Forskolin, Tranylcypromine, DZNep)介导的重编程,该研究成果于 2013 年发表在 Science上[3]。之后,利用小分子化合物诱导体细胞重编程又取得了很多新的进展,见表1。此外,除了将体细胞重编程为 iPSCs 之外,科学家们还发现小分子化合物还可以成功将一种体细胞诱导转化为另一种体细胞,该过程叫做转分化。目前,仅用小分子化合物成功实现转分化的报道主要集中在神经细胞、心肌细胞等领域 [8]。
表1.小分子化合物介导重编程研究进展
胚胎发育的过程涉及众多基因的选择性表达,多个信号通路的开关,而重编程则是反其道而行之。目前,很多信号通路都已经被研究得很透彻,小分子化合物可以通过靶向调节这些信号通路上的关键环节,实现对细胞命运的控制。此外,小分子化合物可以直接作为药物进行临床开发。小分子化合物在重编程领域具有较好的应用前景。
Reference
[1]Takahashi K, YamanakaS. Induction of pluripotent stem cells from mouse embryonic and adult fibroblastcultures by defined factors. Cell,2006,126(4):663-676.
[2] Tongxiang Lin,Shouhai Wu. Reprogrammingwith Small Molecules instead of Exogenous Transcription Factors.Stem Cells Int.2015; 2015: 794632.
[3] Yukimasa T, Yoshinori H, Toshikazu Y, Ping D. Chemicalcompound-based direct reprogramming for future clinical applications. Biosci Rep. 2018 Jun29; 38(3): BSR20171650.
[4] Ye J, Ge J, Zhang X, et al. Pluripotent stem cells induced from mouse neural stem cells and small intestinal epithelial cells by small molecule compounds. Cell Research, 2015,26(1):34-45.
[5] Li D, Wang L, Hou J, et al. Optimized approaches for generation of integration-free iPSCs from human urine-derived cells with small molecules and autologous feeder. Stem Cell Reports, 2016,6(5):717-728.
[6] Xiaoping Han H Y. A molecular roadmap for induced multi-lineage trans- differentiation of fibroblasts by chemical combinations. Cell Research, 2017:1-16.
[7] Han X, Yu H, Huang D, et al. A molecular roadmap forinduced multi-lineage trans- differentiation of fibroblasts by chemicalcombinations. Cell Research, 2017:1-16.
[8] Yukimasa T, Yoshinori H, Toshikazu Y, et al.Chemical compound-based direct reprogramming for future clinical applications.Biosci Rep. 2018 Jun 29; 38(3): BSR20171650.
MCE 推荐
Valproic acid
Valproic acid 一种 HDAC 抑制剂,IC50 值为 0.5-2 mM,抑制 HDAC1 的活性 (IC50,400 μM),同时可诱导 HDAC2 的降解。
CHIR-99021
GSK-3α/β 抑制剂,IC50 为 10 nM/6.7 nM。
LDN193189
选择性的BMPI型受体激酶抑制剂,抑制ALK2和ALK3的活性。
PD0325901
PD0325901:具有选择性的 MEK 抑制剂,IC50 值为 0.33 nM。
Pomiferin
HDAC 和 mTOR 的抑制剂,IC50 值分别为 1.05 μM 和 6.2 µM。
Asiaticoside
TGF-β/Smad 信号通路抑制剂。
小分子化合物在重编程中的应用相关推荐
- MCE公司:小分子化合物在重编程中的应用
干细胞(stemcell)是一类具有自我更新的多潜能细胞.在一定条件下,它可以分化成多种功能细胞.干细胞具有分化成多种细胞的多潜能特性,使其在医学领域具有广泛的应用前景,可应用于肿瘤.心血管系统疾病. ...
- G 蛋白偶联受体与小分子化合物的相互作用
化学遗传学 (Chemogenetics) 是指一种蛋白被改造与先前未被识别的小分子化合物相互作用的过程.多种蛋白的改造已被报道,包括激酶.非激酶的酶类.G 蛋白偶联受体 (GPCRs) 和配体门控离 ...
- 抗肿瘤靶向药物丨小分子化合物 or 单克隆抗体?- MedChemExpress
癌症是人类最常见的死亡原因之一.癌症的主要特征是细胞不受控制和侵入性生长,这些细胞可能在转移的过程中通过血液和淋巴管扩散到身体的其他部位.靶向治疗是一种旨在干扰肿瘤生长或进展中起关键作用的特定靶蛋白的 ...
- 小分子化合物的蛋白靶点(蛋白质、酶、受体) + IC50、EC50、Ki 是什么?
受体拮抗剂(英语:receptor antagonist),也叫阻断剂(英语:blocker),是药理学术语,指能与受体结合,并能阻止激动剂产生效应的一类配体物质. 抑制剂 & 拮抗剂等小分子 ...
- PROTAC——小分子化合物
PROTAC VS. 传统小分子 PROTAC 全称为 proteolysis-targeting chimeras (蛋白水解靶向嵌合分子),是一种杂合双功能小分子化合物,由三部分组成:靶蛋白配体. ...
- 18f:氟-18同位素 Fluorine-18标记小分子化合物/多肽/纳米粒子/抗体及其他动物代谢
18f:氟-18同位素 Fluorine-18标记小分子化合物/多肽/纳米粒子/抗体及其他动物代谢 18f:氟-18同位素 Fluorine-18标记小分子化合物/多肽/纳米粒子/抗体及其他动物代谢 ...
- RORγ 反向激动剂-XY101 小分子化合物
早在 2016 年,中国科学院广州生物医药与健康研究院许永教授团队就曾与加州大学戴维斯分校的陈宏武教授合作,首次发现核激素受体 RORγ 是作用于雄激素受体 AR 上游的关键驱动因子,直接调控雄激素受 ...
- python绘制如下图形、小三角形边长20_在编程中发现数学之美——使用Python小龟绘制多边形...
在使用数学知识画出很酷的各种图形之前,你需要先学习Python编程语言的基础知识.本文将会带你熟悉以下编程概念:循环.变量.函数.使用小龟模块绘制图像.本文假设你已经安装了Python,如果没有,欢迎 ...
- 139115-90-5,Azido-PEG2-alcohol,叠氮-二聚乙二醇,叠氮化PEG小分子化合物的物理特性
英文名称: Azido-PEG2-alcohol 中文名: 叠氮-二聚乙二醇 分子式: C4H9N3O2 分子量: 131.1 CAS: 139115-90-5 纯度: ≥95% 结构式: 用 ...
最新文章
- 射影几何笔记3:中心射影-透视射影
- 云智一体趋势下,百度智能云打通技术与商业的共生闭环
- 安装php时,make步骤报错make: *** [ext/gd/gd.lo] Error 1
- Oracle中TO_DATE格式的使用小结
- 研究所月入两万,是一种什么体验?
- [蓝桥杯2016初赛]寒假作业-next_permutation枚举
- 《Cocos2D权威指南》——3.9 本章小结
- AndroidManifest.xml详解
- 【Hadoop】HDFS数据复制
- 2018蓝桥杯A组:星期一(年份判断)
- 手把手安装flownet2-pytorch
- 计算机考试操作步骤,计算机考试操作步骤(精).doc
- 朗文当代高级英语辞典android,朗文当代高级英语辞典
- python表格绘制斜线表头_【Excel系列05】表格中如何制作斜线表头
- (转)sqlserver 数据恢复方法
- c语言编程设计实验课件,c语言程序设计实验课件.ppt
- SSD固态硬盘和HDD机械硬盘的区别
- 关于Android Studio项目开发的感想
- POSIX标准总体分析 执行调度 消息传递 调度参数 进程调度函数 关闭消息队列 得到消息队列参数 设置调度参数 时钟和定时器 时钟和定时器函数 消息传递函数 打开消息队列 设置消息队列参数
- 照片透明背景抠图怎么做?试试这几种抠图方法