1. Pymol 软件介绍

  2. 1.1 软件安装及初始设置

  3. 1.2 基本知识介绍(如氢键等)

  4. 2.Pymol 软件使用

  5. 2.1 蛋白小分子相互作用图解

  6. 2.2 蛋白蛋白相互作用图解

  7. 2.3 蛋白及小分子表面图、静电势表示

  8. 2.4 蛋白及小分子结构叠加及比对

  9. 2.5 绘相互作用力

  10. 2.6 Pymol 动画制作

  11. 3.实例讲解与练习:.

  12. (1)尼洛替尼与靶点的相互作用,列出相互作用的氨基酸,并导出结合模式图

  13. (2)制作结合口袋表面图

  14. (3)Bcr/Abl 靶点的 PDB 结构叠合

  15. (4)制作蛋白相互作用动画

  16. (5)针对 ACE2 和新冠病毒 Spike 的蛋白晶体复合物,制作蛋白-蛋白相互作用图 Cartoon Surface Surface of binding site

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