分享我们承建的三篇NAR的数据库
生物信息分析离不开数据资源和数据库,生物信息学数据库分类概览 (第一版)系统梳理了常用功能数据库。
下面再分析3个我们承建的NAR发表的新数据库,以飨读者。
中医药方剂的数据库,收录方剂、药材、靶点、疾病、通路等信息,
网站古色古香,设计精美,交互探索,网络大气,
高颜值是很好的敲门砖,
于2018年发表于NAR杂志。
表格展示太枯燥,关键信息交互式饼图展示,查看,点击筛选~~
现在数据库升级第二版,更多功能,更多展示 (网络图比下面这个更漂亮,更有生物意义,更有交互性,只是暂时还不能释放 o(╥﹏╥)o)。
另一个是`Prophage hunter`,在细菌基因组中寻找活性噬菌体。
页面极简,但设计精良,定制基因组浏览器交互,
于2019年发表于NAR杂志。
表格和基因组浏览器的双向控制
再一个是海洋天然产物数据库,页面精美,功能强大!刚刚发表于2020年NAR数据库专刊。
多模式组合检索
做的更多的还是分子数据的展示,如转录组相关数据的展示。
首先展示下首页,专业设计师私人定制,可以传统,可以现代;可以功能为主,也可以轮播酷炫。
首页搜索框全局搜索,类似谷歌,输入基因名、通路名、功能关键词皆可搜索。
小轮播展示网站可做的分析和结果展示,差异基因富集全套,还是交互式的。
四个饼图联动展示数据库收录的样品和属性信息,高端大气显内涵。
那搜索一下,都展示哪些信息?
基因,别名,公共数据库链接,功能注释,表达分布,PPI网络,共表达网络,想放啥放啥!
一个基因嫌少,来绘制一组基因的表达谱,修饰谱;同时展示甲基化修饰与基因表达的关系。
图就不展示了,绝对心中所想!
搜索太简单了(其实功能很强大),可否更多条件搜索?
多组学如何展示?基因组浏览器可否嵌入?
基因组浏览器是多组学的展示利器,更多见:
IGV基因组浏览器可视化高通量测序数据
高通量数据分析必备-基因组浏览器使用介绍 - 1
高通量数据分析必备-基因组浏览器使用介绍 - 2
高通量数据分析必备-基因组浏览器使用介绍 - 3
ChIP类数据同时展示IP
, Input
样品丰度 (这个双峰图可拆可合)和peak
信息,见下图。
展示同源物种,也可以~
更多在线功能,样品聚类、筛选、差异基因(样品特异性基因)、功能富集 (一个小的云平台出来了)
更多交互式图,染色体图谱、饼图、箱线图、交互式表
数据库收录样本信息更多互动展示
这也是一个主页风格,随您定制。
更多地图展示
时间轴变化来一个
访问量统计页来一个 (这是高颜值可定制在线绘图工具-第三版的用户访问,总访问量20万,给您做个友情链接,也能推广带动访问)
以上列出一部分,更多数据库还在建设中,发表后慢慢释放,更多展示和需求也等您提出。
如果您也有建设的需求,欢迎联系我们。
往期精品(点击图片直达文字对应教程)
后台回复“生信宝典福利第一波”或点击阅读原文获取教程合集
分享我们承建的三篇NAR的数据库相关推荐
- 连续发表三篇NAR的数据库文章——数据库承建
生物信息分析离不开数据资源和数据库,生物信息学数据库分类概览 (第一版)系统梳理了常用功能数据库. 下面再分析3个我们承建的NAR发表的新数据库,以飨读者. 中医药方剂的数据库,收录方剂.药材.靶点. ...
- 你的数据也可以-三篇NAR的数据库
生物信息分析离不开数据资源和数据库,生物信息学数据库分类概览 (第一版)系统梳理了常用功能数据库. 下面再分析3个我们承建的NAR发表的新数据库,以飨读者. 中医药方剂的数据库,收录方剂.药材.靶点. ...
- mysql测试数据库 jmeter_第三篇--Jmeter测试数据库Mysql
Jmeter模拟100用户访问Mysql数据库 1.将Mysql数据库的驱动[mysql-connector-java-5.1.15-bin.jar]放到jmeter的lib目录下,新建线程组100[ ...
- 三篇学会MySQL数据库【基础知识】
MySQL万字教程,从入门到精通,争取三篇拿下MySQL初级知识,加油 ⛽ 我们终其一生不是为了迎合每个人,而是要找和我们共振的那部分人,这世界很喧嚣,做好你自己就好 MySQL文章目录 1. 基本操 ...
- 你的数据可也可以发三篇NAR的文章
生物信息分析离不开数据资源和数据库,生物信息学数据库分类概览 (第一版)系统梳理了常用功能数据库. 下面再分析3个我们承建的NAR发表的新数据库,以飨读者. 中医药方剂的数据库,收录方剂.药材.靶点. ...
- 连续发表三篇核酸研究数据库文章
生物信息分析离不开数据资源和数据库,生物信息学数据库分类概览 (第一版)系统梳理了常用功能数据库. 下面再分析3个我们承建的数据库在核酸研究(NAR)发表,以飨读者. 中医药方剂的数据库,收录方剂.药 ...
- 你的数据也可以-两篇NAR的数据库
生物信息分析离不开数据资源和数据库,生物信息学数据库分类概览 (第一版)系统梳理了常用功能数据库. 下面再分析2个NAR发表的新数据库,以飨读者. 中医药方剂的数据库,收录方剂.药材.靶点.疾病.通路 ...
- 厉害了,网易伏羲三篇论文上榜 AI 顶会 ACL
近日,国际AI顶尖学术会议ACL 2021(Annual Meeting of the Associationfor Computational Linguistics)公布了论文录用结果.网易伏羲共 ...
- 华南农业大学在Annual Review of Microbiology发表三篇综述文章
华南农业大学群体微生物研究中心科研人员应国际权威微生物综述期刊Annual Review of Microbiology的邀请,分别于2019年6月21日和7月5日在线发表了三篇综述文章,分别总结了细 ...
最新文章
- JW Player使用简介
- VS2015 MFC属性页孙鑫笔记
- Java技术:干掉 XML配置文件,新出的 Fluent Mybatis 技术真香!
- 系统架构师5 ***********那就给个合格分了。111
- springboot : Failed to decode downloaded font 和 OTS parsing error
- Javascript基础回顾 之(二) 作用域
- appium+python+windows执行测试用例,并使用HTMLTestRunner输出测试报告
- 52单片机定时器2使用(C语言程序)
- Python助力性能测试——报文批量生成
- c++ explicit关键字解读
- OS X桌面自动化神器:Hammerspoon for Mac
- unity3d游戏开发之简单的透明shader技能培训
- 超频到3200最佳时序_内存条从入门到精通!想要超频或是稳定,看完保证你也能轻松挑选...
- idea使用帮助文档1
- 男人最碰不得的十大危险女人
- BGA封装的优缺点解析
- win 7 系统(x64)安装vs2012时遇到的问题
- UrlRewritingNet 完美实现 ASP.NET 2.0 中的URL重写(映射)
- js 笔记-LHS RHS 作用域
- 小飞计算器(小飞可编程复数计算器)用户手册