生物图像处理软件_细胞分割
1 前言
细胞分割（cell segmentation）是生物图像分析中很重要的一步。通常，用于胞体分割的图像是2D或者3D的。细胞分割是细胞追踪的第一步，分割结果的好坏直接决定了细胞追踪的准确度。
2 目的
左图就是一副细胞的二维图片。
（1）统计细胞的纵膈
（2）统计每个细胞的面积
（3）统计每个细胞的荧光亮度
3 软件
| 名称 | 主页 | 适用图像类型 | 系统要求 |
|---|---|---|---|
| Modular Interactive Nuclear Segmentation (MINS) | https://github.com/therealkatlab/MINS | 2D，3D | Matlab, 64-bit Windows OS |
| interactive learning and segmentation toolkit (ilastik) | https://www.ilastik.org/index.html | 2D，3D | Windows, Linux, Mac, 64-bit |
4 算法 （TODO）
在实现细胞分割上，MINS和ilastik的原理完全不同。
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