冷冻电镜聚类中心(2D Class)粒子图像的解析

冷冻电镜粒子图像聚类：

Import Particles：读取原始的冷冻电镜粒子图像
2D Class：2D聚类，获取聚类中心的清晰粒子图像

下载图像的聚类中心(MRC文件) 和标签信息(CS文件)：

MRC：cryosparc_P1_J12_020_class_averages.mrc
CS：cryosparc_P1_J12_020_particles.cs

加载MRC文件函数：

def mrc_loader(mrc_path):"""加载MRC文件"""mrc

冷冻电镜聚类中心(2D Class)粒子图像的解析相关推荐

【金猿产品展】荣联冷冻电镜数据分析平台——助力生物医疗科研创新
荣联科技集团产品本项目由荣联科技集团投递并参与"数据猿年度金猿策划活动--2021大数据产业创新服务产品榜单及奖项"评选. 数据智能产业创新服务媒体 --聚焦数智 · 改变商业 ...
冷冻电镜(cryo-EM)三维图像重构软件Relion工作站配置推荐
单颗粒冷冻电镜是结构生物学研究的重要手段之一,冷冻电镜的模型重构通常需要对几万甚至几十万张投影图片进行分析.组装和优化,计算量巨大,这需要先进的计算架构配合有效的算法才能实现. Relion是专门为低 ...
【冷冻电镜|论文阅读】emClarity：用于高分辨率冷冻电子断层扫描和子断层平均的软件
题目 & 作者有两篇介绍该软件的论文,一篇是2018年的,第二篇是2022年的.第二篇主要是对软件使用流程的详细介绍. emClarity: software for high-resolu ...
【冷冻电镜|论文阅读】子断层平均 M 软件解读：Multi-particle cryo-EM refinement with M
题目&作者 Multi-particle cryo-EM refinement with M visualizes ribosome-antibiotic complex at 3.5 Å i ...
肖清华计算机系北大生命科学,清华大学生命学院、电子系和计算机系合作提出新型的冷冻电镜三维重构算法...
清华大学生命学院.电子系和计算机系合作提出新型的冷冻电镜三维重构算法清华新闻网12月3日电 11月30日,清华大学生命科学学院李雪明研究组,电子工程系沈渊研究组和计算机系杨广文研究组三方合作在< ...
肠道腺病毒HAdV-F41的冷冻电镜结构揭示人类腺病毒的结构变异
肠道腺病毒是世界上导致病毒性胃肠炎的主要原因之一,它必须能够承受肠道中的恶劣条件.这一要求表明衣壳的稳定性必须不同于其他腺病毒.我们报道了人肠道腺病毒HAdV-F41的4-分辨率结构,并将其与其他呼吸 ...
盘点2021年度中国生命科学有哪些进展？信息学大数据？基因分析？冷冻电镜？
导语中国科协生命科学学会联合体本着"公平.公正.公开"的原则,进行了2021年"中国生命科学十大进展"评选.本年度延续了将项目成果进行知识创新和技术创新分类推 ...
【冷冻电镜】RELION4.0之subtomogram对位功能源码分析（自用）
源码地址 relion源码指路(注意选择4.0版本的branch). 对 subtomo averaging 我也还有很多疑惑,还在摸索期,如有任何问题,欢迎大家私信交流,祝大家科研顺利~ What' ...
ML之K-means：基于DIY数据集利用K-means算法聚类(测试9种不同聚类中心的模型性能)
ML之K-means:基于DIY数据集利用K-means算法聚类(测试9种不同聚类中心的模型性能) 目录输出结果设计思路实现代码输出结果设计思路 1.使用均匀分布函数随机三个簇,每个簇周围1 ...

冷冻电镜聚类中心(2D Class)粒子图像的解析

冷冻电镜聚类中心(2D Class)粒子图像的解析相关推荐

最新文章

热门文章