化合物相似性搜索_FTrees——Similarity相似性搜索
FTrees简介
FTrees(Feature Trees)是一种高效的药效团模型相似性搜索软件工具,可以促进虚拟高通量筛选(HTS)。特征树描述符捕获分子的整体拓扑结构及其药效团特性。相似性基于两个分子的描述符进行比对。
FTrees主要应用
先导化合物的发现
骨架跃迁:结构不同的分子,具有高度相似的特征树。
高通量筛选分析(HTS)
命中率和正交结果:FTrees在基准数据集上超越了行业标准。
虚拟筛选
化学数据挖掘:能够超高速的从数十亿虚拟化合物中搜索相似骨架。
参考资料
[1] Hans Briem, Uta F. Lessel. In vitro and in silico affinity fingerprints: Finding similarities beyond structural classes. Perspectives in Drug Discovery and Design, 2000, 20 (1), 231-244
[2] Thierry Kogej, Ola Engkvist, Niklas Blomberg, Sorel Muresan Multifingerprint based similarity searches for targeted class compound selection. Journal of Chemical Information and Modeling, 2006, 46 (3), 1201-1213
[3] Markus Böhm, Tong-Ying Wu, Holger Claußen, Christian Lemmen Similarity Searching and Scaffold Hopping in Synthetically Accessible Combinatorial Chemistry Spaces. Journal of Medicinal Chemistry, 2008, 51 (8), 2468-2480
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