六万播放量的B站单细胞课程
离最开始做单细系列课程已经过去一年多啦,原本也就是随便搞搞,没想到播放量越增越快,导致我不更完很难收场。目前我们的各类免费单细胞数据分析的课程基本都排在B站的头名,总播放量已经超过六万啦。如果说你还没有学过这些课程,可就太可惜了:
《手把手教你做单细胞测序数据分析》
https://www.bilibili.com/video/BV1S44y1b76Z?p=1
《细胞通讯》
https://www.bilibili.com/video/BV1Ab4y1W7qx?p=1
《拟时序分析》
https://www.bilibili.com/video/BV1br4y1x7Hf?p=2
依次学完下面的内容,3~5分的SCI随便水(当然也不要真的去水文章)
单细胞数据分析系列教程:
B站视频,先看一遍视频再去看推送操作,建议至少看三遍:
https://www.bilibili.com/video/BV1S44y1b76Z/
单细胞测序基础数据分析保姆级教程,代码部分整理在往期推送之中:
手把手教你做单细胞测序数据分析(一)——绪论
手把手教你做单细胞测序数据分析(二)——各类输入文件读取
手把手教你做单细胞测序数据分析(三)——单样本分析
手把手教你做单细胞测序数据分析(四)——多样本整合
手把手教你做单细胞测序数据分析(五)——细胞类型注释
手把手教你做单细胞测序数据分析(六)——组间差异分析及可视化
手把手教你做单细胞测序数据分析(七)——基因集富集分析
上游fastq文件处理:
单细胞分析的最上游——处理Fastq文件:cellranger
单细胞分析的最上游——处理Fastq文件:dropseqRunner
有奖提问,这个smart-Seq2数据实战的比对率为何如此低?
细胞通讯
B站连续播放起来比较方便:
https://www.bilibili.com/video/BV1Ab4y1W7qx?p=1
往期推送
单细胞测序数据进阶分析—《细胞通讯》1.概论
单细胞测序数据进阶分析—《细胞通讯》2.1CellChat基础分析教程
单细胞测序数据进阶分析—《细胞通讯》2.2CellChat多组别分析
给你们申请到了免费的128GB云服务器
拟时序分析
B站连续播放起来比较方便:
https://www.bilibili.com/video/BV1br4y1x7Hf?p=1
往期推送
单细胞测序数据进阶分析—《拟时序分析》1.概论
单细胞测序数据进阶分析—《拟时序分析》2.monocle概论
单细胞测序数据进阶分析—《拟时序分析》3.monocle2实操:完整版
单细胞测序数据进阶分析—《拟时序分析》4.初识monocle3
单细胞测序数据进阶分析—《拟时序分析》5.monocle3的降维、分群、聚类
其他单细胞相关技术贴也在这里:
细胞的数量由誰决定?
单细胞中应该如何做GSVA?
答读者问(三):单细胞测序前景
答读者问(四):如何分析细胞亚群
答读者问(六):Seurat中如何让细胞听你指挥
答读者问(八):为什么Read10X也会报错?
答读者问(十)整合后的表达矩阵,如何拆分出分组信息?
答读者问(十一)如何一次性读取一个目录下的cellranger输出文件?
给你安排一个懂生信的工具人(十):不学编程 零代码完成单细胞测序数据分析:Loupe Browser
什么?不做单细胞也能分析细胞类群和免疫浸润?
答读者问 (十三)查看Seurat对象时的ERROR:type='text'
各类单细胞对象(数据格式)转换大全(一)
批量整理好GEO中下载的单细胞数据
答读者问 (十四)Seurat中分类变量处理技巧
答读者问 (十五)稀疏矩阵转matrix, as.matrix函数是下下策
答读者问 (十六)做单细胞测序到底需要多少内存
答读者问 (十七)调用的线程越多就算的越快嘛?
单细胞文献阅读:
文献阅读(三)、单细胞测序解析糖尿病肾病中肾小球的动态变化
文献阅读(四)、单细胞测序技术解析健康人与T2D患者的胰岛差异
文献阅读(六)、小鼠全肾单细胞测序开篇之作
文献阅读(七)、一篇不花钱就能白嫖的文章
文献阅读(八)、不会吧不会吧,Nature都能白嫖?
文献阅读(十一)、高氧下小鼠肺发育损伤的ScRNA图谱
文献阅读(十二)、IgAN & STRT-Seq
文献阅读(十三)、老树开新花——EGFR、肿瘤、免疫+scRNA-Seq
文献阅读(十五)、癌前基质细胞驱动BRCA1肿瘤发生
文献阅读(十八)、紧跟生信"钱"沿,胰腺癌&免疫多模态图谱
文献阅读(十九)、原发头颈癌和肿瘤转移微生态
非技术帖:
关于单细胞的事 谈谈后面的计划
趁机预告一波
有关提高"Biomamba 生信基地"运行效率事宜
生信分析为什么要使用服务器?
如何联系我们
公众号后台中消息更新不及时,超过48h后便不允许回复读者消息,这里给大家留一下领取资料、咨询服务器的微信号,方便大家随时交流、提建议(由助理接待)。此外呼声一直很高的交流群也建好了,欢迎大家入群讨论:
你们要的微信、交流群,来了!
大家可以阅读完这几篇之后添加
笑一笑也就算了
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