CESM笔记——模式工作流（cesm1_2

磨磨唧唧又过了好久，模式也没什么进展。昨天导师一通电话把我吓傻了。赶紧搞起来。

CESM2移植还没搞好，就先在之前装好的CESM1_2_2上试验一下跑模式，熟悉下流程。之后CESM2搞好了再来写写移植问题。

这里给一个简单的记录，更完整具体的流程可参照官网指导：https://escomp.github.io/CESM/release-cesm2/quickstart.html

注：以下流程是基于模式已经移植成功,模式能正常运行的前提下进行的。

大概是这么四个步骤：create case（生成）, setup（设置）, build（编译）, run（运行）

1. creat a case（生成case），格式如下：

./create_newcase --case CASENAME --compset COMPSET --res GRID

cd ~/CESM/cesm1_2_2/scripts
./create_newcase -case ~/CESM/cesm1_2_2/scripts/zjjtest2 -compset B_1850 -res f19_g16 -mach tianhe2 -compiler intel

先到script目录下，然后运行可执行文件./create_newcase, 接下来是一些参数设置

-case 后面加你自己设的一个新文件夹目录的路径，就是这里在scripts目录下，原本没有zjjtest2这个文件夹，当执行完./create_newcase后，所有的运行文件都会存到这个新文件夹下，再进到zjjtest2进行后续操作。

-compset 后面加模式模块组合的缩写，具体参见：

http://www.cesm.ucar.edu/models/cesm1.2/cesm/doc/modelnl/compsets.html

命名规则参考另一篇文章：CESM笔记——compset命名规则https://blog.csdn.net/qq_27984679/article/details/107109786

举个例子，我这里用的B_1850,意思就是我跑的这个case从1850年开始一直使用的是工业前排放（比如研究CO2温室效应之类的这个可以作为参照实验，我是这么理解的？）

CESM2是这个：http://www.cesm.ucar.edu/models/cesm2/config/compsets.html

这里就能看出CESM1和2的一些差别，像大气模块CAM就已经从4进阶到6了。

-res 后面加的是分辨率，CESM1,2分辨率应该没太大变化，具体可以参考这里：http://www.cesm.ucar.edu/models/cesm2/config/grids.html

我这里用的f19_g16。命名规则参考另一篇文章：CESM笔记——res网格分辨率命名规则https://blog.csdn.net/qq_27984679/article/details/107103641

-mach 后面加机器名称，machine的简写，我这里因为是port在天河上，所以写的tianhe2。

-compiler 后面加的编译器，我用的intel。

接下来的步骤进到刚生成的case目录下操作

cd zjjtest2/

2. Setting up the case run script(设置case运行脚本)，格式如下:

./case.setup

set up前修改env_mach_pes.xml(optional)（感觉这个好像不需要改，一般默认的就能用）

./zjjtest2.setup

3. Build the executable using the case.build command(编译可执行文件)，格式如下:

./case.build

build前修改env_build.xml（optional）（一般不太需要改，确认一下里面的路径）

./zjjtest2.build

4. Run the case(运行case)，格式如下:

./case.submit

submit前修改env_run.xml（这个文件主要是管理输入输出、inputdata等的路径，一般默认的是我们之前在环境变量中设置的。如果路径和默认的不同，就手动改一下。里面还有初始化类型、时间等，具体参考另一篇文章：CESM笔记——env_run.xml设置https://blog.csdn.net/qq_27984679/article/details/107117882）

./zjjtest2.submit

这样，作业就提交上啦，一般大型集群比如我用的天河可以用yhq或者squeue查看作业，pbs作业提交系统可以用qstat查看。

诶，学模式真的好难啊。。。这也不会那也不会。。。可怜弱小又无助。

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