【Ziv Bar-Joseph教授课件】计算生物学:序列比对与剖面HMMs
本课件主要内容包括:
中心法则
日益增长的生物数据
FDA批准基于基因的乳腺癌试验
用于数据集成的输入输出HMM
主动学习
序列同源函数
序列分析技术
序列比对:导致差异的可能原因
双序列比对
Scoring Alignments
计算最优比对:Needham-Wuncsh算法
示例
关于计算时间
蛋白质家族
描述蛋白质家族的方法
多比对过程
从已有的比对中训练HMM
记住一个简单的例子
选择最优的模型:将序列比对用于模型
简单HMM的打分
未比对序列的训练
设计HMMs:共识(匹配)状态
设计HMMs:插入
设计HMMs:删除
总结
完整课件下载地址:
http://page2.dfpan.com/fs/clc5j242132951653b4/
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