Biome-BGC生态系统模型与Python融合技术
Biome-BGC是利用站点描述数据、气象数据和植被生理生态参数,模拟日尺度碳、水和氮通量的有效模型,其研究的空间尺度可以从点尺度扩展到陆地生态系统。
在Biome-BGC模型中,对于碳的生物量积累,采用光合酶促反应机理模型计算出每天的初级生产力(GPP),将生长呼吸和维持呼吸减去后的产物分配给叶、枝条、干和根。生物体的碳每天都按一定比例以凋落方式进入凋落物碳库;对于水份输运过程,该模型模拟的水循环过程包括降雨、降雪、冠层截留、穿透降水、树干径流、 冠层蒸发、融雪、雪升华、冠层蒸腾、土壤蒸发、蒸散、地表径流和土壤水分变化以及植物对水分的利用;对于土壤过程,模型考虑了凋落物分解进入土壤有机碳库过程、土壤有机物矿化过程和基于木桶模型的水在土层间的输送关系;对于能量平衡,该模型还考虑了净辐射、感热通量和潜热通量等过程。
讲解利用中国区域地面气象要素驱动数据集(CMFD)和CN05.1气候数据格点化气象数据驱动Biome-BGC在区域上进行模拟。在模拟过程中,需要综合的使用Linux、Python等一些小工具,完成模式的前处理和后处理的工作。
【特色】:
1、原理深入浅出的讲解,强调原理的重要性;
2、技巧方法讲解,提供教程配套的完整教材数据及提供长期回放;
3、与项目案例相结合,更好的对接实际工作应用;
4、跟学上机操作、独立完成案例操作练习、全程问题跟踪解析;
5、专属助学群辅助巩固学习及实际工作应用交流,不定期召开线上答疑。
更多
●InVEST实践及在生态系统服务供需、固碳、城市热岛、论文写作等实际项目中应用
●【SWH】陆地生态系统蒸散模拟理论、蒸散估算、站点及区域尺度模拟
●生态系统碳循环模型CENTURY应用与实践技术
●无人机遥感在农林信息提取中的实现方法与GIS融合应用
●陆面生态水文模拟与多源遥感数据同化的应用
●高光谱遥感数值建模技术及在植被、水体、土壤信息提取领域应用
●生态碳汇涡度相关监测与通量数据分析应用
●Python语言在地球科学领域中的实践技术应用
●CMIP6数据处理方法与典型案例分析
一、模式介绍Biome-BGC介绍
二、基础
Linux应用
实现批量创建文件、删除文件及文件夹
并行化执行程序
CDO工具应用
使用cdo工具对netCDF文件进行合并
筛选时间和变量,裁剪为
Python应用
Python的循环语句,逻辑语句,
创建Numpy数组,并统计计算;
使用Matplotlib制作散点图、等值线图;
利用零散数据Pandas创建数,制作时间
利用Xarray读取netCDF文件,写入netCDF文件;实现插值工作
三、数据处理
在linux 上综合使用cdo和xarray数据制备所需数据。
1静态数据制备
地形数据:GTOPO30S 1km
土地利用数据:GLCC 1km
土壤数据:FAO
GPP数据:MODIS数据
2驱动数据制备
CN05.1数据处理
CMFD数据处理
3生态数据
MODIS GPP
四、单点的模拟
1前处理
从空间数据(netCDF)插值
配置运行文件
制备气象数据
2运行BGC模型
3调参
基于Python的并行化参数搜索
调整生长季开始和结束
4后处理
结果统计计算
结果可视化
五、区域模拟-1
区域模拟是将区域上每个格点分别进行计算进行的。
模拟前准备
分配数据
并行运行
合并结果
六、区域模拟-2
通过数据库的管理,可以减少单点模型空间化数据分发和管理复杂度。
MySQL介绍
常见命令介绍
在Mysql中建立驱动数据、静态数据表和结果表
编写脚本自动化生成静态数据
并行运行模式
结果导入数据库
后处理案例数据
七、长时间序列模拟案例
使用ERA5作为观测数据的降尺度后的CMIP6未来气候变化降尺度数据。
对气象数据降尺度,获得气温、湿度、降水和向下短波辐射。
土壤数据、植被数据库查询
准备气象数据和静态数据
后处理模拟结果数据
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