python生物数据分析_Python学生物统计-数据可视化-学习笔记5

5.1 作图的重要性

在分析一个数据之前, 我们首先要对数据进行检查, 在统计上看一下汇总统计, 比如最大值, 最小值, 中位数, 平均值, 方差, 标准差, 变异系数等等.直方图, 看一下数据的分布情况

箱线图, 看一下数据的分布, 有无异常值

所谓一图胜千言.

python中的作图工具

5.2 散点图

# Import standard packages

import numpy as np

import matplotlib.pyplot as plt

import pandas as pd

import scipy.stats as stats

import seaborn as sns

这里生成了500个随机数, 使用plot进行作图

# Generate the data

x = np.random.randn(500)

# Plot-command start ---------------------

plt.plot(x, '.')

# Plot-command end -----------------------

# Show plot

a2 = plt.show()

5.3 直方图

a3 = plt.hist(x,bins=25)

5.4 箱线图

a4 = plt.boxplot(x);

练习corn.csv

corn是R包agridat中的smith.corn.uniformity玉米数据, 我们来看一下如何对其可视化?

row col plot year yield

1 20 1 101 95 30.0

2 19 1 102 95 29.1

3 18 1 103 95 25.7

4 17 1 104 95 26.3

5 16 1 105 95 30.3

6 15 1 106 95 31.1

首先, 在R中将其保存为corn.csv, 保存到D盘根目录(方便读取)

library(agridat)

data(smith.corn.uniformity)

dat = smith.corn.uniformity

head(dat)

write.csv(dat,"d:/corn.csv",row.names = F)

用python读取数据, 使用pandas包

import pandas as pd

corn = pd.read_csv("d:/corn.csv")

查看前六行

corn.head()

row col plot year yield 0 20 1 101 95 30.0 1 19 1 102 95 29.1 2 18 1 103 95 25.7 3 17 1 104 95 26.3 4 16 1 105 95 30.3

对产量yield作图

import matplotlib.pyplot as plt

c1 = plt.plot(corn["yield"],".")

c2 = plt.hist(corn["yield"])

c3 = plt.boxplot(corn["yield"])

python生物数据分析_Python学生物统计-数据可视化-学习笔记5相关推荐

python气象数据可视化学习笔记6——利用python地图库cnmaps绘制地图填色图并白化
文章目录 1. 效果图 2. cnmaps简介及安装 2.1 写在前面 2.2 cnmaps简介和安装 3. 导入库 4. 定义绘图函数 4.1 使用get_adm_maps返回地图边界 4.2 ax ...
ECharts数据可视化学习笔记和应用
ECharts数据可视化学习笔记和应用一.概念二.Echarts使用使用步骤三.Echarts-基础配置四.柱状图图表1 五.柱状图图表2 六.折线图1 七.折线图2 八.饼状图1 九.饼形 ...
数据可视化学习笔记一——概述
工作准备文章目录工作准备工作内容补充说明地理信息数字化技术 GIS QGis PostGIS PostgreSQL 可视化技术 echarts mapbox three.js [Vue.js ...
数据可视化（一）：解构数据可视化——学习笔记
一.数据可视化过程一个完整的数据可视化过程可以分为四个步骤: (1)确定可视化的主题首先得确定数据围绕什么样的主题来组织.具体地说,可以是业务的目标.一个需求.一个问题.比如,信贷行业分析不同信用 ...
可视化导论 - 第五章时空数据可视化 - 学习笔记
第5章时空数据可视化 5.1 一维标量数据可视化一维标量数据通常用二维坐标图或折线图来可视化. 制作坐标图时要注意: 数据转换对输入数据进行数据转换生成新的变量,可以方便用户更好地观察数据.例如 ...
QGIS数据可视化学习笔记01——一般的图层样式调整和在地图上添加图表
说明:QGIS数据可视化章节用的数据为QGIS绘制一张地图学习章节的数据,传送门:https://blog.csdn.net/qq_47188967/article/details/1301962 ...
python汽车数据分析_Python研究汽车传感器数据统计可视化分析
我一直在使用Open Torque Viewer结合Torque App和基本的OBDII蓝牙传感器来记录我过去一个半月的汽车传感器数据.这是我学到的一些东西: 轻松进入汽车的ECU非常简单自199 ...
Python数据可视化学习笔记：第一章关联图第四节使用Python绘制一般气泡图
前言声明:这个系列的博文都是我自己学习所得的东西,秉承着每天进步一点点的理念进行学习,我参考的课程是<菊安酱与菜菜的Python机器学习可视化50图>,使用的Python版本为3.6.4 ...
python气象数据可视化学习笔记7——利用cartopy+cnmaps和ERA5数据绘制填色图并对中国地区白化
文章目录 1. 效果图 2. 绘制基于中国地区的填色图(大地图) 3. 添加南海小地图 4. 读取数据并传入绘图函数 5. 代码完整版 1. 效果图前序博文cnmaps填色图介绍了cnmaps在线地 ...

python生物数据分析_Python学生物统计-数据可视化-学习笔记5

python生物数据分析_Python学生物统计-数据可视化-学习笔记5相关推荐

最新文章

热门文章