聊个天就把生信分析做了?你的未来在哪里?
生物信息学习的正确姿势
NGS系列文章包括NGS基础、在线绘图、转录组分析 (Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这)、ChIP-seq分析 (ChIP-seq基本分析流程)、单细胞测序分析 (重磅综述:三万字长文读懂单细胞RNA测序分析的最佳实践教程)、DNA甲基化分析、重测序分析、GEO数据挖掘(典型医学设计实验GEO数据分析 (step-by-step))、批次效应处理等内容。
2020年9月24日看到美国MD安德森癌症研究中心梁晗老师实验室发表在Cencer Cell的Next-generation Analytics for Omics Data的评论文章,介绍了其团队基于自然语言和人工智能开发的组学数据分析平台——DrBioRight。
这是一个很宏大的设想,不需要编程,只需要输入自然语言,该工具就可以帮助实现所需的分析。而且还可以根据每次的分析经历进行自我学习和提高,不断完善其识别任务和盛微信分析的能力。
这么有意思的工具得实际体验一下,经测试可以轻松完成TCGA数据的统计、指定基因的关联分析和一套转录组数据的分析(从原始数据到表达矩阵)。其官方视频还提供了进行生存分析、突变分析等功能的演示。
于是跟梁晗老师申请了DrBioRight的视频使用权限,转载至此,供更多朋友学习和讨论。
DrBioRight整体功能介绍
DrBioRight转录组分析
DrBioRight生存分析
当然目前能识别的文字还需要一定的范式,对关键词不同写法的区分能力也有一些不完善。但迈出了第一步,后面的完善还会远吗?而且这个工具是可以自学习的,欢迎更多朋友去测试帮助其不断完善。赶紧点击阅读原文去体验下吧。
参考
https://www.cell.com/cancer-cell/fulltext/S1535-6108(20)30433-5
https://drbioright.org/landing/
往期精品(点击图片直达文字对应教程)
后台回复“生信宝典福利第一波”或点击阅读原文获取教程合集
聊个天就把生信分析做了?你的未来在哪里?相关推荐
- 面向生信分析的高性 RStudio 服务器
因需要超大内存的拼接/比对/表达量计算发愁? 为了使用组里的服务器而被困在实验室? 浪费大量的时间龟速下载 NCBI 的数据? 快来看看云筏 HPC 吧! https://my.cloudraft.c ...
- 生信分析流程构建的几大流派
导言 构建生信分析流程是生物信息学从业人员必备的技能之一,对该项能力的评估常常是各大公司招录人员的参考项目之一. 在进行 ngsjs 项目时,我做了一张示意图来表示一些高通量测序数据分析项目重现性的要 ...
- 福建农林大学朱方捷组招聘讲师/副教授/助理——生信分析方向
福建农林大学转录系统生物学课题组招聘(生信分析.组培转化) 工作地点: 福建农林大学海峡联合研究院 薪金: 18-30万 招聘岗位: 讲师/副教授/助理 实验室网址: http://hbmcsysbi ...
- 生信分析平台方案推介,助力科研
生信分析平台方案推介,助力科研 专注 专业 共赢 目前生信分析对计算性能和存储高并发性能都提出来新的要求,例如在基因测序分析中,基因序列数目庞大,对基因进行同源性搜寻.比对.分析.系统发育分析等需要对 ...
- 这是入门生信,学习生信分析思路和数据可视化的首选?
封面来源:https://www.zhihu.com/question/304747766 常规转录组是我们最常接触到的一种高通量测序数据类型,其实验方法成熟,花费较低,是大部分CNS必备的技术,以后 ...
- docker卸载命令_使用docker完成生信分析环境搭建
生信开发人员最头疼的问题,可能就是平台搭建和软件安装了.部署和迁移上要费很大力气.本文讲述使用docker制作一个镜像,后续通过导入自己定制的镜像,复制文件完成分析流程的部署和迁移. 如何使用dock ...
- 找不到r低版本_R 语言与数据挖掘直播班开始招生,生信分析帮你发高分文章
数据单薄很难支撑文章内容?数据有了不知道怎么处理作出高级的图片?这个时候需要的是生信分析--深度的数据挖掘和分析处理,可以帮助临床医生通过数据处理得到自己想要的信息,更快速地发文章. 学习哪种生信分析 ...
- 属于服务器端运行的程序_生信分析云平台产品开发 - 5 生信分析pipeline服务器端运行...
在上文 [生信分析云平台产品开发 - 4 生信分析pipeline的图形化] 讨论了生信分析pipeline的图形化,如何用图形的方式显示生信pipeline,但是pipeline脚本按照变量的形式保 ...
- mirna富集分析_经验之谈丨生信分析文章套路原来这么简单!
近两年,不做实验或者仅需要少量实验的生物信息学分析文章,发表量越来越多.如果利用数据库检索,高效的发出一篇文章.是科研工作者关注的话题,今天我们就用一篇生信分析的文章作为切入点,来谈谈生信分析文章的套 ...
最新文章
- 2022-2028年中国车载充电机行业深度调研及投资前景预测报告
- 摘要注释_《间架结构摘要九十二法》高清图片+注释 爱书法的朋友值得收藏
- Spring Boot 接入 GitHub 第三方登录,只要两行配置!
- 编写高质量代码:改善Java程序的151个建议(第4章:字符串___建议52~55)
- 【第一届“文翁杯”现场竞技赛】(校内“欢乐”赛)T1—洗刷刷(dp)
- 图解CSS中padding、margin、border的区别及使用
- python官网下载文件-使用Python下载文件的简单示例
- php+memcached缓存技术实例
- 股票历史数据下载-A股所有股票的历史数据下载
- 机器人足球比赛linux,机器人足球实验报告.doc
- 5G NR随机接入过程
- 华为双前置摄像头_华为P40系列的前置双摄像头到底隐藏了什么?我们一起来看看...
- 两个次序统计量的联合密度函数
- 笔记本电脑无法连接WiFi,如何解决
- 【sex.com最贵的域名】
- 如何在iPhone之间共享您的Wi-Fi密码?
- 华为云冰山安全,让用户安心用云
- 西北大学电影专硕考研考情与难度、参考书及上岸前辈备考经验
- 【面经】长鑫存储-产品可靠性-合肥-提前批校招面经-已gg
- 国培2018、四川乡村教师访名校南通培训班联谊晚会——原创朗诵节目《家》