单细胞拟时分析：基因及通路随拟时表达变化趋势

之前给小伙伴做分析复现的时候，接触到一篇Cell文章的拟时分析，参考文献：Single-cell landscape of the ecosystem in early relapse hepatocellular carcinoma。这篇文章呈现了不同分组的拟时基因表达趋势、以及代谢通路的趋势。

关于拟时分析，我们之前以及有详细的描述了，参考： Monocle3（1）：单细胞拟时分析---分析（详细注释版） Monocle3（2）：单细胞拟时分析可视化---普通版 Monocle3：单细胞拟时分析---个性化分析思路及可视化群成员专享：Monocle2更新（就是重新梳理一下）

一键跑完monocle2？

这里我们就直接使用做好拟时的monocle对象进行复现了：文章中做了代谢通路，其实不论是GO、KEGG，只要是感兴趣的通路都可以呈现！****

当然了，本片内容和我们号所有的帖子一样，不仅仅让你复现做出拟时的这个分析内容，你还可以学习到其他的数据处理技巧和作图方法！

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