Pajek常用方法保姆级操作指南—

##路径——最短路径：
1、看多少个节点、多少条边、自回路和没有自回路的密度：network-info-general-0(不限定)
2、图显示值：draw-options-lines-marklines-withvalues
3、生成最短路径(walk)：network-create new network-subnetwork with paths-one shortest path between two vertices-1&10(初始节点v1终止节点v10）-yes-no
4、图固定第一个节点和最后一个节点：layout-energy-kk-fix first and last
5、生成最短链（chain):①转换：network-create new network-transform-arcs->edges-all-yes-多重边情况下选择，没有不用管了②找最短链：同【生成最短路径(walk)】步骤
6、找所有最短路径：network-create new network-subnetwork with paths-all shortest paths between two vertices-3&10-yes-no
7、该网络的直径：network-create new network-info on diameter-查看report
8、抽取上一步的子网络：根据上一步的report结果重复生成最短路径(walk)步骤
9、对于小网络计算距离矩阵(任意两点间最短路径长度作为矩阵的值）：network-create new network-geo*-查看shortes path length matrix of N1文件-双击-2（99999表示没有路径）
10、限制两个节点间的路：network-create new network-subnetwork with paths-walks with-1&10-yes-no-5(v1-v10之间小于等于5的路径都会显示出来）
11、k邻接矩阵（某一节点出发到各点最短路径长度）：network-create partition-k-neighbours-input-1(其他各点到v1）&0（没有限制)-双击查看表格文件 output同理
12、按照k邻接结果生成子网络：原来网络文件+分区文件-operations-net+partition-extract-UNION（选择的类联合生成子网络）-1，3（最短路径为1和3的）如果是EACH选项则生成两个子网络
13、看分区partition的一部分：partiton-info-1(分区中至少有几个节点）&+20（最大的二十个）

##路径——非循环网络（从任一点出发，都不能有回到该点的回路）（主要是图形的绘制）：
1、求网络每个节点的深度（按深度分区）：network-acyclic network-create partition-depth partition-Acyclic
2、不同深度有不同颜色查看图：options-colors-partition colors-for vertices
3、有层次的体现图：layers-in y direction 固定：move-fix-x（在y轴方向上移动）
4、保存上传图形：export-2D-(某种形式）
5、求节点的度：network-create partition-degree-input（入度）
6、将分区文件变成向量文件：partition-copy to vector 用向量和网络绘图，节点大小不一样了
7、显示图为矩形：图界面-move-grid-0&0（没有限制）-layout-energy-kk-fix first and last vertex 考虑边上的值，相似度：options-values of lines-similarities-重复刚才的步骤
8、设置图运行时间：options-interrupt-every xx seconds
9、3D显示：layout-energy-fruc-3D
10、显示为圆形：layout-circular-original
11、图形上显示滚动条：options-scrollbar 方法图形：按住鼠标右键，选中放大的部分

##分区与成分：
1、建立类：cluster-create empty cluster-View/Edit Cluster-双击add new vertex-1&3（把第一个节点和第三个节点放进这个类中）
2、配合类将子网络抽出来：operations-net+cluster-extract subnetwork-
3、用分区文件转换成cluster：partition-make cluster-vertices from selected cluster-可以选若干个分区放到一类里也可以选一个
4、把所有节点都放到0号分区里：partition-create constant partition-10&0（默认打开网络的节点）变色：图中按住shift+左键可以增加类号；alt+左键降低类号；把所有点都增加类号，鼠标放在空白处而不是节点上，重复上面操作对于创建的分区，可以点击View/Edit Cluster直接修改
5、建立组元：network-create partition-components-weak/strong-1（最小1个节点）-report界面显示有多少组元，最大组元中的节点数

##双连接组元与核：
1、生成双组元：network-create new network-with Bi-2（最小的双组元中包含多少节点）查看结果：双击Hierarchy生成的文件，生成哪些组元，每个组元包含哪些节点
2、查看割点信息：双击Vectors生成的文件，report含义为不同节点属于几个双组元，数值大于1说明是割点，0是孤立节点，partition生成的文件也可以查看
3、抽取包含xx个节点的双组元：①将hierarchy文件转换成cluster：hierarchy-extract cluster-1（cluster1）②抽取子网络：将【生成双组元】步骤生成的network选中-operations-net+cluster-extract subnet
4、查看vector信息：vector-info-+10最高的前十个-3（将值分为两部分，在两个部分中的百分率是什么样的）
5、k-core（子集中每个节点的度数大于等于k）：network-create partition-k-core-input/output/all

##三方组与派系：
1、三方组：network-info-triadic census-yes-report结果第一列三方组类型，第二列数量
2、寻找三集圈的子网络：①network-create new network-complete network-directed-3（找几集圈就是几）②打开要操作的网络，查看是否有弧，如果都是边要转换成有向弧network文件部分，并列放置①生成的网络和要操作的网络 ③network-fragment-find（默认）④双击hierarchy文件，查看clique结果
3、从hierarchy中提取三个集圈的子网络：hierarchy-extract cluster-1（抽取第一个集圈）原网络和cluster配合抽取子网络
4、全局视图：原net文件和原clu文件-operations-net+partition-shrink network-1（类之间最小连线数目）&0（哪个类不用收缩，全局收缩输入不存在的类）

##中心性与中心势：
1、绝对点度中心度：network-create vector-centrality-degree-input//
2、closeness：network-create vector-centrality-closeness–input//
3、betweenness:network-create vector-centrality-betweeness–input//

##威望：
1、近距威望：network-create vector-centrality-proximity prestige-input-0（没有限制）生成三个vector文件①标准化的影响域文件②影响域中其他节点到该节点的平均距离③每个节点的近距威望，影响域比例/平均距离
2、将弧上的值加进来看中心度：network-create vector-centrality-weighted degree-input//
3、hubs authority枢纽权威：network-create vector-centrality-hubs-authorities-10（前十个枢纽）&10（前十个权威）&默认双击生成的partition查看是权威or枢纽，vector生成枢纽权重（出）和权威权重（进）两个文件，双击查看
4、测量权威权重和近距威望的相似性非相似性：vector两个文件并列放置这两个文件-vectors-info-report（查看相关系数）

##标记图操作：
1、标记图分区操作：①初始随机建立分区：partition-create random partition-1 mode-9(维度，结点数量）&2（生成云集数）②最优化：network-signed network-create partition-doreian mrvar method-1000（重复执行1000次）&0.5（默认）&1（云集中最少几个几点）生成平衡的分区文件
2、变换分区图：①保证执行【相似度】：options-values of lines-similarities操作②layout-energy-kk-Opt 同类的特别近
3、最优的，采用重排的方式：选择平衡的分区文件-partition-make permutation

##块建模操作：
1、块建模操作：选择原net和分区clu-network-create partition-blockmodeling-random start-structural equivalent（结构等价）-clusters类数和原来clu一样进行对比-run standard
2、对比分区：块建模分区+原clu-partitions-info-cramer 得到交叉对照表

##其他块建模操作：
1、预指定模型：仅原net-network-create partition-blockmodeling-random start-user defined-按照指定模型设置-run standard
2、相异性测量我的网络和你的分区有那些区别：operations-network+cluster-diss-network based-d5-0（连接按什么算）通过hierarchy文件查看
3、社群检测：network-create partition-community-Louvain method-Single-（默认）

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