药物靶点信息数据库有哪些？都有哪些特点？

药物靶点信息数据库的应用不仅能够高效地扩大靶点信息获取，而且能深化科研人员对于靶点的认识，从而服务于新靶点发现、药物筛选、药物设计、疾病治疗及药理学机制的研究等领域。

药物靶点可以分为受体、酶、离子通道、DNA、激素与生长因子等几种类型。随着生物信息学的快速发展，科研人员的工作更加垂直，孕育而生的药物靶点信息数据库也是各有专攻，导致部分不熟悉的科研人员不能高效的选取合适的目标药物靶点信息数据库，主要还是不了解每个靶点数据库的核心功能、数据特色、背景来源等信息。

为此笔者调研了目前业内人士主流使用的靶点数据库，将其具有价值的数据、功能等信息作详细讲解，方便大家快速了解各个数据库，提高大家选号入座的效率。

（注：下面每个数据库都各有特色-不分先后排名，一定要排名只能说ChEMBL>BindingDB）

①Therapeutic Target Database (以下简称TTD)

TTD药物靶点信息数据库提供有关已知和探索的治疗性蛋白质和核酸靶点，靶向疾病，通路信息以及针对每个靶点的相应药物的信息，由新加坡国立大学开发，截止2022年收录3500+个药物靶点，38000+个药物分子。

目标信息可以通过交叉链接从以下搜索字段访问UniProtKB，PDB，KEGG，OMID和Brenda数据库。

②Bindind Database(以下简称BindingDB)

BindingDB是由美国加州圣地亚哥分校-斯卡格斯药剂学和药剂科学学院（Skaggs School of Pharmacy & Pharmaceutical Sciences）开发，主要是候选药物靶标的蛋白质与小的药物样分子配体的相互作用。BindingDB通过文献意识和结构-活性关系的发展（SAR和QSAR）支持药物化学和药物发现;验证计算化学和分子建模方法，如对接、评分和自由能方法;化学生物学和化学基因组学;以及分子识别物理化学的基础研究。

BindingDB目前包含约270万+结合数据，涉及9000+蛋白质和超过116万+类药物分子。主要收集药物靶点蛋白质和类药小分子之间相互作用亲和力的数据库。包括近百万个靶点-配体结合信息，如若只是查询某药物靶点的全面的配体信息，BindingDB是当之无愧首选。

③DrugBank

DrugBank于2006年在阿尔伯塔大学的David Wishart博士实验室成立。包含有关药物和药物靶点的信息，作为生物信息学和化学信息学资源，将详细的药物（即化学、药理和药物）数据与全面的药物靶标（即序列、结构和途径）信息相结合。

最新版本的DrugBank Online（版本5.1.10，发布于 2023-01-04）包含 15760种药物条目，DrugBank是最全面的疾病靶点数据库之一，包含了超过9000种药物和7100+种靶点信息。

④ChEMBL

ChEMBL数据库是欧洲生物信息研究所开发的一个开放数据库，主要通过大量文献中收集各种靶点及化合物的生物活性数据，给药物化学家们提供了一个非常便利的查询靶点或化合物的生物活性数据平台，目前EMBL-EBI的数据涵盖基因组学，蛋白质，表达，小分子，蛋白质结构，系统，本体和科学文献。收载了各类靶标15398种，不同化合物239万+，通过该数据库，用户可以快速查询到某个靶点目前已报道的化合物及其活性信息，也可以查询到某个化合物在哪些靶点做过生物活性测试及其数据。

⑤Pharnexcloud(以下简称药融云)

药融云-靶点格局数据库是由中国药融云博士带领专业团队开发的一款开放数据库，是目前国内医药相关企业及机构应用最为广泛的数据库，该药物靶点信息数据库目前收录了全球已上市及处于不同研发阶段的药物靶点详细信息5421条，包含了靶向疾病、通路、企业等信息，同时扩展同靶点药物的注册、研发状态、临床实验、上市以及销售额信息。还可通过该药物靶点信息数据库可辅助分析预测目标靶点药物企业竞争格局，辅助药企制定战略规划与决策。

图片来源（Pharnexcloud-药物靶点格局数据库）

总结：以上数据库都是权威机构及专业人士在维护，相互之间还有数据互通，可信度非常高，可以溯源，为我们查阅信息提供了很大的便捷。其中前面四个数据库主要都是用于学术性的药物靶点各类信息查询，而pharnnexcloud主要适用于商业性市场调研，了解全球靶点药物的研发现状。

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