研究生阶段记录2-常用名词

1.荧光阈值 threshold

2.Ct值 cycle threshold

3.△Rn值

4.引物

5.POCT Point-of-care testing

6.等温扩增技术

7.环介导等温扩增 Loop-mediated isothermal amplification LAMP

8.重组酶扩增反应 Recombinase polymerase amplification RPA

9.微流控芯片

1.荧光阈值 threshold

荧光阈值时在荧光扩增曲线指数增长期设定的一个荧光强度标准。

在实时荧光定量PCR中，随着反应的进行，监测到的荧光信号可以绘制成一条曲线。荧光扩增曲线一般分为基线期、指数增长期、线性增长期和平台期。基线期扩增的荧光信号被荧光背景信号所掩盖，无法判断产物量的变化。平台期扩增产物已不再呈指数级增加，PCR的终产物量与起始模板量之间无线性关系，所以根据最终PCR产物量不能计算出初始模板量。只有在荧光信号指数增长期，PCR产物量的对数值与起始模板之间存在线性关系，可以选择在这个阶段进行定量分析。荧光阈值是在荧光扩增曲线上人为设定的一个值，达到这个值后，扩增曲线开始进入指数增长期。

参考：1.张惟材等.实时荧光定量PCR[M]，化学工业出版社，p2.

2.Ct值 cycle threshold

PCR扩增过程中扩增产物的荧光信号达到设定的阈值时，所经过的扩增循环次数，它与模板起始拷贝数的对数存在线性关系。可以代表PCR的扩增效率。

参考：1.张惟材等.实时荧光定量PCR[M]，化学工业出版社，p2-3.

2.张临政,穆飞航,刘俊香.冠状病毒检测用PCR仪器领域专利分析[J].中国发明与专利,2020,17(03):30-37.

3.马雯,张伟宏,马瑛龙,葸静,金哲宇,朴文花.不同核酸提取试剂盒在新型冠状病毒核酸检测中的比较研究[J].分子诊断与治疗杂志,2020,12(05):552-556.

3.△Rn值

荧光PCR在扣除背景信号后的荧光值，能反映扩增产物的数量。

参考：1.马雯,张伟宏,马瑛龙,葸静,金哲宇,朴文花.不同核酸提取试剂盒在新型冠状病毒核酸检测中的比较研究[J].分子诊断与治疗杂志,2020,12(05):552-556.

4.引物

引物是两段与待扩增靶DNA序列侧翼片段互补的寡核苷酸。

参考：1.苏慧慈，刘彦仿.原位PCR[M]，科学出版社，p6.

5.POCT Point-of-care testing

现场快速检测，即时检验。是体外诊断（IVD）行业的一个新兴细分行业，也是目前微流控应用最为市场化的一个行业。

世卫组织WHO为POCT设备提出了ASSURED评价标准：廉价（Affordable）、灵敏（Sensitive）、特异性强（Specific）、用户友好（User-friendly）、快速（Rapid）、不依赖仪器（Equipment-free）、便携（Delivered to those with need）.

6.等温扩增技术

相较于以PCR为代表的变温扩增技术，等温扩增技术不需要在不同温度区间来回切换，对温度的要求也更低。因为对温度控制的系统的要求更低，适合用于集成化便携设备。同时省去了温度循环，扩增速度也有所提高。具有效率高、成本低、快速准确等特点。

7.环介导等温扩增 Loop-mediated isothermal amplification LAMP

LAMP有四条必需引物，即两条44bp内引物和两条20bp外引物可在链置换DNA聚合酶的作用下形成单茎环结构复制中间体与双茎环结构的哑铃复制中间体并完成后续扩增循环。为加快反应速度，也可加入对可特异性识别并结合茎环结构上的环形间隙区序列的环引物从而大幅增加多茎环结构复制中间体上的新链合成与引物结合位点，提升扩增效率。

8.重组酶扩增反应 Recombinase polymerase amplification RPA

相比于LAMP，RPA只需要两对引物，扩增温度在37℃-41℃之间。

9.微流控芯片

芯片实验室（lab-on chip）的重要组成部分，可以在几平方厘米或更小的芯片上操控微升或纳升级流体来构建集成化、微型化、自动化的化学生物实验平台。相比于传统实验室操作，微流控芯片可以显著降低试剂用量、简化操作流程，可以方便的用于即时检测中。

常用的微流控检测芯片从工作方式上可以分为片式芯片和碟式芯片两种。

片式芯片：外形呈矩形，利用毛细自吸现象或微泵作为液体流动的动力源，通过控制微阀的开闭实现对液体的操作，设计简单、拓展性较强。

碟式芯片：外形呈圆形，以高速旋转产生的离心力作为液体的动力源，液体流道则主要通过旋转速度与流道亲疏水性质进行控制。相比于片式芯片，碟式芯片操控方式简单，可以继承生化分析中常用的离心步骤。