heatmap绘制热图时出现样本列名顺序调换
今天像往常一样，用 ComplexHeatmap包中的 Heatmap函数画热图，本来输入是正常的
如图，C12H在左，RTF在右
代码也没啥问题
setwd("F:\\学习文件存放地址\\IOZ_实验室\\yangby\\结果文件\\all_表达矩阵\\")
library(ComplexHeatmap)
library(circlize)
#含注释_all_deseq_CH_vs_RTF.csvtargetgene
fil<-read.csv("含注释_all_deseq_CH_vs_RTF.csvtargetgene.csv")
paint_map_data<-fil
row.names(paint_map_data)<-as.vector(fil[,16]) #设置图的rowname
paint_map_data<-paint_map_data[,c(10,11,12,13,14,15)]
colnames(paint_map_data)<-c("c12h1","c12h2","c12h3","RTF1","RTF2","RTF3") #设置图的colname
Heatmap(paint_map_data[1:11,],c("blue","white")) #调用Heatmap函数展示基因表达量的热图但是画出来，竟然是这样的？！ 样本列名顺序不一致啦！
可以明显看到样本c12h3跑到了图的左边，RTF样本名称之间的顺序也发生了变化，明明是RTF1，RTF2，RTF3排列的，现在变成了RTF1，RTF3，RTF2
查看了一下Heatmap函数的参数，才知道原来这是由于对样本的列进行了聚类导致的
因为聚类，将相似的样本就放在一起了，所以样本顺序发生了变化，我们可以看到热图上方的聚类树，这就是聚类的情况
解决办法：画图的时候关掉对列样本进行聚类的功能,如下设置：
Heatmap函数中添加参数**cluster_columns=F** 即可
Heatmap(paint_map_data[1:11,],c("blue","white"),cluster_columns=F) #调
大功告成：
可以看到热图顶部的聚类树消失了，我们的样本顺序也是和原来一样，没有发生变动了
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