人工免疫克隆选择算法是一种比较新型的智能算法，其基本算法结构与遗传算法是类似的，以下源码是为网络节点分组调度问题而设计的算法。

function

[BestX,BestY,AllABfarm,LC1,LC2]=AIA2(M,N,Ns,Ncm,Nr,Pd,alpha,beta,K,Cx,Cy,r,Sx,Sy)

%% 网络节点分组调度的人工免疫优化算法通用Matlab程序

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%% 输入参数列表

% M------------人工免疫优化算法迭代次数

% N------------抗体群的规模

% Ns-----------免疫选择算子中选中的抗体个数

% Ncm----------克隆变异算子中产生的新抗体的个数

% Nr-----------抑制操作中保留下来的抗体个数

% Pd-----------变异程度控制参数，取值0～1，越大变异越厉害

% alpha--------亲和度加权系数，用于激励度的计算

% beta---------浓度加权系数，用于激励度的计算

% K------------调度分组的个数

% Cx-----------节点的横坐标，1×n的向量

% Cy-----------节点的纵坐标，1×n的向量

% r------------节点的感知半径，1×n的向量

% Sx-----------质点的横坐标，1×m的向量

% Sy-----------质点的纵坐标，1×m的向量

%% 输出参数列表

% BestX--------最优调度方案

% BestY--------最优调度对应的平均覆盖率

% AllABfarm----历史上所有抗体群的集合，M×1的细胞结构

% LC1----------最优抗体亲和度的收敛曲线，M×1

% LC2----------抗体群平均亲和度的收敛曲线，M×1

%%

-----------------------初始化----------------------------------

n=length(Cx);

LC1=zeros(M,1);

LC2=zeros(M,1);

AllABfarm=cell(M,1);

%控制参数初始化

mm=1;%迭代计数器

%调用子函数，抗体群初始化

ABfarm=AntiBodyInitial(N,n,K);

%%

-----------------------迭代过程---------------------------------

while mm<=M%设置停止条件

%调用子函数，计算抗体群亲和度

aff=Affinity(ABfarm,K,Cx,Cy,r,Sx,Sy);

%记录收敛曲线

maxaff=max(aff);

meanaff=mean(aff);

LC1(mm)=maxaff;

LC2(mm)=meanaff;

pos=find(aff==maxaff);

BestPos=pos(1);

BestX=ABfarm(BestPos,:);

BestY=maxaff;

AllABfarm{mm}=ABfarm;

%调用子函数，计算抗体浓度

den=Density(ABfarm);

%调用子函数，计算抗体激励度

sim=SumUp(aff,den,alpha,beta);

%调用子函数，免疫选择算子

ABfarmS=Select(ABfarm,sim,Ns);

%精英抗体保护

ABfarmS(1,:)=BestX;

%调用子函数，克隆变异算子

ABfarmCM=CloneMutation(ABfarmS,Ncm,Pd,K);

%调用子函数，抑制刷新算子

ABfarm=RepresRenewal(ABfarmS,ABfarmCM,Nr,N,K,Cx,Cy,r,Sx,Sy);

disp(mm);

mm=mm+1;

end