Mac 科研常用软件
转自http://bbs.feng.com/read-htm-tid-7698336.html
我的 Mac 是 2012 年的 Pro Retina,现在主要用的是 Mac 系统,Windows 已经不常上了
经常用的软件有以下几个:
1. 科学绘图软件:SciDAVis 和 Plot
目前这两个软件更新频率很快,SciDAVis 已经到 1D8 版了,就是 Mac 上的 Origin;Plot 更新到了 2.0R12 版,使用命令更复杂,但可实现的效果也更多,现在也支持 Mavericks 和 64 位,只是去掉了曲线拟合模块,比较遗憾。有同学可能会问,既然有 iGor Pro、QtiPlot 和其他多种画图软件,为什么还要用 SciDAVis。因为有的期刊可能要求你提供画图软件的版本信息,一旦使用盗版可能会被拒稿;另外,一些商业画图软件公司也会在软件中设置后门,你如果用的是破解版,他们可能会找上门来,或者通知期刊社要求撤销你的稿件。盗版在国内抓得不严,但是在国外非常严格。再者,SciDAVis 这个软件开源免费,而且容易上手,功能强大,使用它何乐而不为。
SciDAVis 下载地址: scidavis.1.D8.pkg 镜像下载地址: http://pan.baidu.com/s/1eQxqEOi
Plot MAC 下载地址:App Store 搜索 Plot 2
对 SciDAVis 的介绍: Mac 科研软件漫谈2:SciDAVis,科学画图软件,Mac 上的 Origin
具备类似功能的商业软件:Igor Pro、QtiPlot、Pro Fit、Prism 等
使用 SciDAVis/Plot 可节省:约 400 元
2. 文献参考软件:Sente
Sente 确实很好用,而且现在有免费版,每个数据库参考文献不大于 100 个。Sente 可以用 DOI,也可以采用 Google Scholar 搜索等来导入文献信息,对中文文献导入支持也很好,也支持 Elsevier、Springer、Wiley 以及 Web of Science 的网页在线导入,但 WOS 的内置搜索功能仍然不能使用。相比 Mendeley,Sente 支持自定义参考文献格式。
更多的介绍请看这里: Mac 科研软件漫谈1:Sente,文献编辑和管理软件
比较下来,Zotero 比 Sente 更好用
3. 文献参考软件:Zotero
再加一个文献管理软件,感觉比 EndNote 和 Sente 更好用,就是 Zotero 的 Mac 桌面版。Zotero 的大名想必大家都不会陌生,介绍可以见这里:
http://www.yangzhiping.com/tech/zotero1.html
这是中文版,经过测试,Zotero 对元数据(Meta Data)的抓取比 Mendeley 要好一些,对网页数据的支持也比 Mendeley 更多。内置 6000 多个期刊或者数据库的参考文献样式,应该基本可以满足大家的需求了
Sente 下载地址: Sente 6 for Mac (zip file)
Zotero 下载地址: https://www.zotero.org/download/
有部分网友反应网址打不开,镜像地址: http://pan.baidu.com/s/1B8HX0
更新视频介绍地址: Mac 科研软件漫谈 3: Zotero,一款比肩 EndNote 的文献参考软件
具备类似功能的商业软件:EndNote、Sente、BookEnds
使用 Zotero 可节省:300 元
Zotero 下载地址: http://pan.baidu.com/s/1sjCFpmP
4. 画图软件:Keynote 和 AutoCAD
用 Keynote 来画示意图,要求精密度高的或者 3D 图形就用 AutoCAD 来画,非常方便。现在 AutoCAD 有 2014 版本,支持 Retina 显示屏,且能够使用 3D 命令来画三维图形;AutoCAD 更新至 2015 版本
Keynote 下载地址:App Store
AutoCAD 下载地址:官网上有,学生和教育工作者可以申请三年试用版。
使用 AutoCAD 教育版可节省:20000 元
5. 计算和编程软件 Fortran
目前使用 FORTRAN MAC: http://bbs.feng.com/read-htm-tid-7820600.html. 总结了一些心得。
具备类似功能的商业软件:Intel Fortran
使用 Gfortran 可节省:400 元
6. Matlab 的替代品:Octave
命令形式和 Matlab 完全兼容,Matlab 的 .m 文件可以在 Octave 运行,而且运算速度比 Matlab 快。下载地址:
http://sourceforge.net/projects/ ... 8.2-for-OSX-10.9.5/
对中文的支持比 Matlab 更好
具备类似功能的商业软件:Matlab
使用 Octave 可节省:3000 元
7. Mathematica 的替代品:wxMaxima
要 Maxima 才能运行。wxMaxima 是 Maxima 的 GUI,可以做符号运算的。感谢作者 andrejv 上传支持 retina 的版本,下载地址:
http://andrejv.github.io/wxmaxima/download.html
具备类似功能的商业软件:Mathematica
使用 wxMaxima 可节省:3000 元
2014.02.20 更新: 现在 SciDAVIS 已经更新了,最新版本为 1.D5,初步测试,在 Mac 下解决了加载大量数据反映缓慢、打开文件窗口中文显示倾斜的问题。下载地址:
http://sourceforge.net/projects/ ... s.1.D5.pkg/download
对于在 Windows 上经常用 Origin 的同学来说,这个 SciDAVIS 实在是太熟悉了,因为它基本就是 Origin 的翻版。
解决在 Excel 中拷贝数据到 SciDAVIS 中,行列改变问题:用 Numbers 打开 Excel 文件,拷贝数据后再粘贴到 SciDAVIS 中。如果是 TXT 文件,则使用 LineBreak。下载地址: https://code.google.com/p/linebreak/. 下载后,把 Mac 下 TXT 文件的换行模式转换为 UNIX 或者 DOS 的换行模式,就可以了。
2014.03.24 更新: Plot Mac 现在出了 2.0 版,下载地址: http://plot.micw.eu/. 国内似乎访问不了,要用 ***。新版 Plot 支持 Mavericks 和原生 64 位,运行速度更快,使用命令基本保持不变,唯一遗憾的是去掉了曲线拟合模块。
2014.07.05 更新: 在 SciDAVis 中如何设置具有出版物质量的图像输出——
1. 在 SciDAVis 中画好图像后,选择 File 然后 Export Graph 选择 SVG 格式;
2. 在 Safari 中打开 SVG 格式的图片,然后在文件中选择导出为 PDF...,或者选择打印...→PDF→存储为 PDF;
3. 这个时候导出的 PDF 再用预览打开,裁剪边框,大功告成!
采用这种方法是导出质量最佳的图片,因为导出的是矢量图形,所以放大多少倍仍然非常清晰,适合出版物用。
2014.07.28 更新: SciDAVis 更新至 1D8 版,下载地址:
scidavis.1.D8.pkg
目前图片输出的问题暂时没有得到解决,用我上面推荐的方法可以得到矢量图片,具备出版物质量。和 SciDAVis 的开发者沟通后,他们同意在近期解决这个问题。
2014.10.25 更新: AutoCAD 更新至 2015 版,在美国官网上可以找到下载地址,学生和教育工作者可以得到三年免费试用;
更新 Matlab 的自由开源替代品:Octave,现已经更新到 3.8.2,具备了 GUI,运算速度比 Matlab 快,而且命令与 Matlab 完全兼容;
更新 Mathematica 的自由开源替代品:wxMaxima,就是做符号运算的(Octave 也有一个符号运算的工具包:Octsympy,需要 Sympy 运行,类似于 Matlab 上的 Symbolic Toolbox,目前版本为 Octsympy-0.1.1)。如果我早点找到这个软件,大学学微积分的时候就可以用这个来验算结果是否正确了。
2015.02.15 更新: 更新 SciDAVis 和 Sente 的视频简介,另外增加文献管理软件 Zotero 的介绍
2015.02.17 更新: 如果觉得 Word Mac 里面的图片在 Retina 显示屏上不清晰,请保存为 Doc 而非 Docx 格式,这样就很清楚了
2015.03.16 更新: 更新 Zotero 的镜像下载地址, http://pan.baidu.com/s/1B8HX0 ,另外 Octave 的符号运算箱可通过输入命令:pkg install symbolic 得到
2015.05.22 更新: Zotero 的官网现在可以登录了,Zotero 实在太好用了,居然还支持 CNKI 和万方等国内数据库,参考文献样式也包括中文参考文献标准样式,做科研的同学不可不用!地址:https://www.zotero.org 注意:安装 Zotero Mac 独立版本后,还要安装 Safari 的扩展软件,即可网页抓取元数据;或者用 Zotero 的做的 bookmark 标签也可以。Zotero 目前只支持 Word 2011,2016 预览版目前暂时还不支持
2015.05.25 更新 Zotero Mac 桌面版的使用视频 地址:http://bbs.feng.com/forum.php?mo ... page=1#pid146396300 SciDAVis 镜像下载地址:http://pan.baidu.com/s/1eQxqEOi
2015.07.07 更新 wxMaxima 更新至 15.0.4 版本,支持 Retina。这个 wxMaxima 是做符号运算的,是 Mathematica 的替代品。下载地址:http://andrejv.github.io/wxmaxima/download.html
2015.07.15 更新 Zotero Mac 单独版更新至 4.0.27.6 版本,已经支持 Office 2016,能够在 Word 2016 内的 Ribbon 内加载项。Zotero 下载地址: https://www.zotero.org 。另外,如果要编辑参考文献格式,可以登录这个网站:http://editor.citationstyles.org/about/,寻找相近的参考文献格式后,即可进行自定义编辑。
2015.08.01 更新 不用 MathType,可以达到插入公式自动居中、公式右边自动编号的效果,并且支持交叉引用,不需要插入书签了。地址请看:
http://bbs.feng.com/read-htm-tid-9698249.html
具备类似功能的商业软件:MathType
使用此方法可节省:300 元
自动图文集要保存到 Normal.dotm 模板里面,才能够实现输入前四个字符得到自动图文的效果,另外也可设置快捷键。
如果好用请加分!
2015.10.3 更新 以上推荐的软件比商业软件要更胜一筹,而且在给您提供同样生产力的同时,可为您节省至少 30000 元的投入。
2015.11.18 更新 更新 Zotero 的镜像下载地址: http://pan.baidu.com/s/1sjCFpmP
2015.11.23 更新 教你们如何把题录从 EndNote 批量导出到 Zotero:全选 EndNote 的题录,导出为 RIS 格式,然后再用 Zotero 导入就可以了。注意 Zotero 是支持 Word 2016 的
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