生信必会格式:Fasta Fastq 简介及转换
文章目录
- 前言
- FASTA
- 例子:血红蛋白α的核酸和蛋白质序列
- FASTQ
- FASTA FASTQ 对比
- FASTQ 转为 FASTA
- 使用基本的命令:sed、paste、awk
- 使用现有工具:Bioawk、Seqtk
- FASTA 到 FASTQ
- 闲聊
前言
FASTA和FASTQ文件,其实还是文本文件,用于存储序列信息。平时为了存储方便,节省空间,所以变成了GZ的压缩文件(二进制文件,不能直接用head
、less
等命令直接查看)。之前没有好好记笔记,现在补上
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