为进一步提高《微生物组实验手册》稿件质量,本项目新增大众评审环节。文章在通过同行评审后,采用公众号推送方式分享全文,任何人均可在线提交修改意见。公众号格式显示略有问题,建议电脑端点击文末阅读原文下载PDF审稿。在线文档(https://kdocs.cn/l/cL8RRqHIL)大众评审页面登记姓名、单位和行号索引的修改建议。修改意见的征集截止时间为推文发布后的72小时,文章将会结合有建设性的修改意见进一步修改后获得DOI在线发表,同时根据贡献程度列为审稿人或致谢。感谢广大同行提出宝贵意见。

反刍动物瘤胃原虫与细菌微循环测定方法

Determination of Ruminal Protozoa and Bacteria Recycling

王梦芝*,甄永康,高健,王洪荣

动物科学与技术学院,扬州大学,扬州,江苏

*通讯作者邮箱: mengzhiwangyz@126.com

摘要: 反刍动物瘤胃微生态中存在有原虫对细菌的吞噬,形成了原虫和细菌之间蛋白质的循环,如果吞噬循环量过大则会导致微生物蛋白合成量的减少以及合成效率的降低。鉴此,本实验建立一种适合于反刍动物瘤胃原虫与细菌微循环的测定方法。采用荧光染色标记瘤胃细菌技术(Fluorescence-Labeled Rumen Bacteria, FLRB),分离的瘤胃原虫与荧光标记瘤胃细菌共培养,通过荧光显微镜对原虫吞噬荧光标记瘤胃细菌数量计数,并计算原虫对细菌的吞噬速率。以期为反刍动物瘤胃微生物蛋白周转与宿主氨基酸营养构建提供基础资料。

关键词: 瘤胃原虫,瘤胃细菌,吞噬速率,微循环

材料与试剂

1.2 μm滤膜

2.80目纱布

3.载玻片

4.盖玻片

5.无菌生理盐水

6.5(6)-(4,6-二氯三嗪基)氨基荧光素 (DTAF)

7.无菌瘤胃液 (见溶液配方)

仪器设备

1.高速离心机

2.水浴摇床

3.荧光显微镜(Eclipse 80i, Nikon, Japan)

实验步骤

1.采集瘤胃液,经过2 μm滤膜过滤,使用高速离心机于22,000 × g离心15 min (25 °C),收集沉淀。

2.收集的沉淀用灭菌生理盐水清洗,使用高速离心机于22,000 × g离心15 min (25 °C),重复两次,将沉淀物悬浸于灭菌生理盐水中,沉淀物为瘤胃细菌。

3.将2 mg DTAF加入样品中,荧光染色10 min后,于60 °C水浴培养2 h,然后使用高速离心机于22,000 × g离心15 min (25 °C),弃上清,沉淀物使用灭菌生理盐水清洗离心重复三次,将沉淀物悬浸于灭菌生理盐水中,-20 °C保存。

4.用时解冻荧光标记细菌,使用高速离心机于22,000 × g离心15 min (25 °C),收集沉淀,使用无菌瘤胃液悬浸制成2倍浓度的荧光标记瘤胃细菌(FLRB)悬液,置水浴锅(39 °C)备用。

5.按Menke法[1]进行体外培养。在体外培养进行至10 h时,取与FLRB悬液同体积的培养液,80目纱布过滤,于150 × g离心10 min (25 °C),并用无菌生理盐水洗涤离心2次,用样品一半体积的无菌瘤胃液悬浸,此为原虫悬液。

6.原虫悬液于水浴摇床振荡培养 (39 °C,厌氧,50 r/min) 30 min重新复苏原虫。

7.合并原虫悬液和FLRB悬液于水浴摇床振荡培养 (39 °C,厌氧,50 r/min) 进行吞噬实验,于5、10、15、20、25 min取少量混合培养液滴加到载玻片上,加等体积甲醛固定,盖上盖玻片马上镜检。

8.使用荧光显微镜先在普通光100~400倍观察原虫形态,然后在1,000倍油镜下转置荧光背景,检测原虫体内FLRB数量,每个样品3个重复,每片以12个原虫的平均值计算细菌的吞噬数量。检测原虫体内FLRB数量的荧光图如下图1所示。

图1原虫吞噬细菌显微镜荧光图 (25 min,400 ×,Bar = 20 μm)

9.换算系数:如计算吞噬细菌氮和微生物蛋白含量,可以按如下系数换算。荧光标记细菌细胞平均体积为0.10 μm3,氮为0.054 pg N/μm3。以吞噬细菌氮量乘6.25的系数来估算微生物蛋白。

例:如表1 所示,为2 ~ 25 min原虫吞噬细菌量,可依此计算吞噬速率、氮量和微生物蛋白量[2]

表1 原虫吞噬细菌相关指标计算举例

时间/min

吞噬量 (cells/cell)

吞噬速率 (cells/(cell h))

2

18.00

480.00

5

53.00

636.00

10

107.00

642.00

15

137.00

548.00

20

146.00

438.00

25

178.00

427.00

对原虫的吞噬量与时间进行25 min内线性回归分析,回归方程为Y=21.27+6.64X (R=0.971)。式中,Y为原虫吞噬细胞量(cells/cell),X为吞噬时间(min)。由回归直线方程可计算原虫的吞噬速率为398.40 cells/(cell h)。

荧光标记细菌细胞平均体积为0.10 μm3,氮为0.054 pg N/μm3,则换算氮量为:398.40 × 0.054 ×0.10 = 2.15 pg N/(cell h),为原虫在内循环中对细菌氮的吞噬速率。若按照山羊瘤胃内容物为 4 L,瘤胃含 5 × 105 个/mL原虫细胞来计算的话,每头山羊每天因原虫吞噬细菌氮量估计为2.15 × 5 × 105 × 4 × 1000 × 24 × 10-9 = 103.2 mg N/(d 头),换算为微生物蛋白量为 103.2 × 6.25 × 10-3  =  0.645 g Pr/(d 头)。

溶液配方

1.无菌瘤胃液

采集瘤胃液,于29,000 × g离心20 min(25°C),取上清液,使用高压蒸汽灭菌器灭菌(121 °C,0.1 MPa灭菌20 min),4 °C保存,一周内使用。

致谢

1.感谢国家自然科学基金(30771567)对本实验的支持。

2.王梦芝,程欣,谢文文,张柏松,刘翔,王洪荣. (2010). 体外法研究不同油脂对瘤胃原虫吞噬细菌微循环的影响. 中国农业科学, 43(18): 3831-3837.

3.王梦芝. 山羊瘤胃原虫与细菌吞噬关系和微生物AA变化机制的研究[D]. 扬州大学, 2008.

4.感谢扬州大学动物科学与技术学院王梦芝所做的研究工作,对本实验提供了很大的帮助。

参考文献

1.Menke, K. H., and Steingass, H. (1988). Estimation of the energetic feed value obtained from chemical analysis and in vitro gas production using rumen fluid. Anim Res Dev 28: 7-55.

2.王梦芝. 山羊瘤胃原虫与细菌吞噬关系和微生物AA变化机制的研究[D]. 扬州大学, 2008.

猜你喜欢

10000+:菌群分析 宝宝与猫狗 梅毒狂想曲 提DNA发Nature Cell专刊 肠道指挥大脑

系列教程:微生物组入门 Biostar 微生物组  宏基因组

专业技能:学术图表 高分文章 生信宝典 不可或缺的人

一文读懂:宏基因组 寄生虫益处 进化树

必备技能:提问 搜索  Endnote

文献阅读 热心肠 SemanticScholar Geenmedical

扩增子分析:图表解读 分析流程 统计绘图

16S功能预测   PICRUSt  FAPROTAX  Bugbase Tax4Fun

在线工具:16S预测培养基 生信绘图

科研经验:云笔记  云协作 公众号

编程模板: Shell  R Perl

生物科普:  肠道细菌 人体上的生命 生命大跃进  细胞暗战 人体奥秘

写在后面

为鼓励读者交流、快速解决科研困难,我们建立了“宏基因组”专业讨论群,目前己有国内外5000+ 一线科研人员加入。参与讨论,获得专业解答,欢迎分享此文至朋友圈,并扫码加主编好友带你入群,务必备注“姓名-单位-研究方向-职称/年级”。PI请明示身份,另有海内外微生物相关PI群供大佬合作交流。技术问题寻求帮助,首先阅读《如何优雅的提问》学习解决问题思路,仍未解决群内讨论,问题不私聊,帮助同行。

学习16S扩增子、宏基因组科研思路和分析实战,关注“宏基因组”

点击阅读原文下载PDF审稿,或浏览器直接访问下载链接:http://210.75.224.110/github/MicrobiomeProtocol/04Review/210218/2003579MengzhiWang930330/Protocol2003579.pdf

MPB:扬州大学王梦芝组-​​反刍动物瘤胃原虫与细菌微循环测定方法相关推荐

  1. MPB:扬州大学王梦芝组-​​反刍动物瘤胃原虫的分离培养与形态学分析

    为进一步提高<微生物组实验手册>稿件质量,本项目新增大众评审环节.文章在通过同行评审后,采用公众号推送方式分享全文,任何人均可在线提交修改意见.公众号格式显示略有问题,建议电脑端点击文末阅 ...

  2. MPB:扬州大学王梦芝组-​​反刍动物瘤胃原虫样品采集及计数方法

    为进一步提高<微生物组实验手册>稿件质量,本项目新增大众评审环节.文章在通过同行评审后,采用公众号推送方式分享全文,任何人均可在线提交修改意见.公众号格式显示略有问题,建议电脑端点击文末阅 ...

  3. MPB:扬州大学王梦芝组-反刍动物瘤胃原虫18S rRNA测序分析技术

    为进一步提高<微生物组实验手册>稿件质量,本项目新增大众评审环节.文章在通过同行评审后,采用公众号推送方式分享全文,任何人均可在线提交修改意见.公众号格式显示略有问题,建议电脑端点击文末阅 ...

  4. MPB:扬大林淼组-​瘤胃混合细菌连续传代培养技术

    为进一步提高<微生物组实验手册>稿件质量,本项目新增大众评审环节.文章在通过同行评审后,采用公众号推送方式分享全文,任何人均可在线提交修改意见.公众号格式显示略有问题,建议电脑端点击文末阅 ...

  5. MPB:亚热带生态所谭支良、焦金真等-​反刍动物瘤胃样品采集与保存

    为进一步提高<微生物组实验手册>稿件质量,本项目新增大众评审环节.文章在通过同行评审后,采用公众号推送方式分享全文,任何人均可在线提交修改意见.公众号格式显示略有问题,建议电脑端点击文末阅 ...

  6. 小王梦游记五---最美丽的湖

    小王梦游记五-最美丽的湖 序章 入选 王爷是一个富可敌国的大老板,那天在街上偶遇,他心情好,让我坐上他的船玩玩,然后我就上去,这条船很奇怪,明明看上去只是一叶扁舟,但是试图划船时却感觉使不上力,只能让 ...

  7. 平安金融壹账通区块链团队产品负责人王梦寒:区块链应用落地有三大瓶颈

    "目前区块链应用落地遇到三大瓶颈:数据隐私问题,系统主导权争议,及性能抉择两难." 本文旨在传递更多市场信息,不构成任何投资建议. 8月20日,由火星财经主办的"POW' ...

  8. MPB:浙大王佳堃组-​幼龄反刍动物粪便DNA提取及注意事项

    为进一步提高<微生物组实验手册>稿件质量,本项目新增大众评审环节.文章在通过同行评审后,采用公众号推送方式分享全文,任何人均可在线提交修改意见.公众号格式显示略有问题,建议电脑端点击文末阅 ...

  9. MPB:扬大林淼组-瘤胃内容物样本中有机酸的定量分析 (高效液相色谱)

    为进一步提高<微生物组实验手册>稿件质量,本项目新增大众评审环节.文章在通过同行评审后,采用公众号推送方式分享全文,任何人均可在线提交修改意见.公众号格式显示略有问题,建议电脑端点击文末阅 ...

最新文章

  1. 又一个强大的PHP5.3依赖注入容器
  2. css代码应该放html哪里,css代码放到哪里?
  3. 220V电容启动交流电机
  4. T-SQL常用字符串函数
  5. 沙老师的作业系列——Crackme3
  6. SAP UI5 oSelectedItem.getBindingContext(json)
  7. SharePoint要在master page中动态显示List数据的几种方式
  8. Ubuntu12.04 搭建TFTP服务
  9. HTML5前端开发真的会被取代吗?
  10. cache相关命中率的运算_Linux cache命中率查看
  11. 【转】牛仔裤品牌介绍大全
  12. 资产证券化java开发_资产证券化的作用在于()。 A.提高商业银行资产的流动性 B.增强商业银行关于资产和负...
  13. 帝国cms生成静态php,帝国cms自动生成手机版静态插件
  14. 为什么数据库的内容像加密了_意外的负担(或者为什么我认为加密所有内容都不是个好主意)
  15. 七年级上计算机课教学记录,【备课参考】(川教版)七年级信息技术上册第9课《计算机操作系统》教学设计...
  16. 功能测试非常重要的43个功能测试点...
  17. 大炮打蚊子(c语言易懂版)
  18. Chapter4、色调映射的一般方法
  19. 大连民族大学计算机转专业,大连民族大学可以转专业吗,大连民族大学新生转专业政策...
  20. #coding=utf-8 from ctypes import * import time import os,pygame,threading windll.user32.BlockInpu

热门文章

  1. 我的创业日记(序)——人生在于一种体验
  2. java计算机毕业设计客服管理系统源码+mysql数据库+系统+lw文档+部署
  3. 新来的23岁Java开发上来秀了波操作,真是扮猪吃老虎
  4. idea 调节背景护眼_idea修改背景颜色|护眼色|项目栏背景修改
  5. 云安全高等教育改革示范教材
  6. HTML常用的五种标签,完整版开放下载
  7. 写字楼租金,2020年之后会呈现十分惊人的跳升
  8. Linux的网络协议中的网卡缓冲区
  9. [windows phone7 ]手机端程序备份工具--wp7钛备份 查看已安装程序GUID
  10. Oracle配置EM(Enterprise Manager)